一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法及表达载体技术方案

技术编号:24882318 阅读:79 留言:0更新日期:2020-07-14 18:08
本发明专利技术涉及一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法及表达载体,属于水稻改良技术领域。本发明专利技术所述方法利用CRISPR/Cas9系统抑制水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14的表达;所述CRISPR/Cas9系统中,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明专利技术方法能够在后代中分离获得无转基因标记的,带有香味且白叶枯病抗性显著提高的突变体,为优质抗病水稻育种提供了新的种质资源和创制方法。

【技术实现步骤摘要】
一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法及表达载体
本专利技术涉及水稻改良
,具体涉及一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法及表达载体。
技术介绍
水稻(OryzasativaL.)是世界约一半人口的主要粮食作物,随着人们生活水平的提高,人们对稻米品质的要求越来越高。稻米的香味是食味品质的重要指标,香米具有特殊的香味,广泛受到市场和消费者的亲睐。由革兰氏阴性菌黄单胞杆菌水稻致病变种所引起的水稻白叶枯病是世界水稻生产中危害最严重的细菌性病害之一,严重时可导致高达50%的产量损失。在常规杂交育种过程中,其分离后代香味(隐性性状)纯合基因型的单株较少,按传统检测方法会使含有香味基因的优良杂合个体在选择过程中被淘汰,最终导致香味基因的丢失。随着分子标记技术的发展,一般利用分子标记辅助选择的方法开展香味和抗白叶枯病水稻品种的选育。但是多基因的聚合操作起来有一定的难度,而且在创建导入系的过程中存在不良性状的连锁累赘,需要回交多代或者扩大分离群体的规模,才有可能打破这种连锁,延长了育种周期。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法及表达载体。本专利技术方法能够在后代中分离获得无转基因标记的,带有香味且白叶枯病抗性显著提高的突变体,为优质抗病水稻育种提供了新的种质资源和创制方法。本专利技术提供了一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法,包括以下步骤:利用CRISPR/Cas9系统抑制水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14的表达;所述CRISPR/Cas9系统中,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。优选的是,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的接头引物包括核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的接头正向引物32870-Gf和核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的接头反向引物32870-U6Ar;所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的接头引物包括核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的接头正向引物31190pro-Gf和核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的接头反向引物31190pro-U6Br。优选的是,所述CRISPR/Cas9系统中,靶点gRNA表达盒的构建方法包括以下步骤:分别以pYLsgRNA-OsU6a/LacZ质粒和pYLsgRNA-OsU6b/LacZ质粒作为模版,进行二轮的巢式PCR扩增,构建含水稻香味基因Badh2靶位点序列的sgRNA表达盒U6a-Badh2-gRNA和含白叶枯病感病基因SWEET14基因靶位点序列的sgRNA表达盒U6b-SWEET14-gRNA;第一轮包括两个独立的扩增反应:用引物对U-F/接头反向引物进行反应1,和引物对接头正向引物/gR-R进行反应2;反应的程序均为:94℃10s,60℃15s,68℃20s,28个循环;所述接头反向引物为核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的接头反向引物32870-U6Ar或核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的接头反向引物31190pro-U6Br;所述接头正向引物为核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的接头正向引物32870-Gf或核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的接头正向引物31190pro-Gf;第二轮为OverlappingPCR,用特异引物扩增表达盒产物:将第一轮反应1和反应2中的PCR产物稀释10倍混合分别作为模版;使用引物对U-GAL/Pgs-GA2,扩增产物为U6a-Badh2-gRNA;使用引物对U-GA2/Pgs-GAR扩增产物为U6b-SWEET14-gRNA;反应程序均为:95℃10s,58℃15s,68℃20s,20个循环;所述U-F的核苷酸序列如SEQIDNO.7所示;所述gR-R的核苷酸序列如SEQIDNO.8所示;所述U-GAL的核苷酸序列如SEQIDNO.9所示;所述Pgs-GA2的核苷酸序列如SEQIDNO.10所示;所述U-GA2的核苷酸序列如SEQIDNO.11所示;所述Pgs-GAR的核苷酸序列如SEQIDNO.12所示。优选的是,所述CRISPR/Cas9系统中,含水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14靶位点的CRISPR表达载体的构建方法包括以下步骤:将含水稻香味基因Badh2靶位点序列的sgRNA表达盒U6a-Badh2-gRNA和含白叶枯病感病基因SWEET14基因靶位点序列的sgRNA表达盒U6b-SWEET14-gRNA用重组酶连接到pYLCRISPR/Cas9Pubi-H载体上。本专利技术还提供了水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点序列,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。本专利技术还提供了含水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14靶位点的CRISPR表达载体,其特征在于,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。本专利技术提供了一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法。水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14在隐性状态下分别具有香味和白叶枯病抗性,对这两个水稻内源基因进行编辑或定点突变,在第二代即能获得无转基因成分的纯和突变体植株,提高了育种效率,而且避免了传统转基因导致的生物安全评价问题。本专利技术利用CRISPR/Cas9系统同时对水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14进行编辑,水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14靶位点的设定可以实现方便、高效的水稻基因组编辑,本专利技术方法能够在后代中分离获得无转基因标记的,带有香味且白叶枯病抗性显著提高的突变体,为优质抗病水稻育种提供了新的种质资源和创制方法。附图说明图1为本专利技术提供的靶位点示意图,其中,A为香味基因Badh2靶位点序列示意图;B为白叶枯病感病基因SWEET14启动子靶位点序列示意图;图2为本专利技术提供的香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14的CRISPR/Cas9载体构建图;图3为本专利技术提供的纯合突变体的抗白叶枯病接种鉴定图。具体实施方式本专利技术提供了一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法,包括以下步骤:利用CRISPR/Cas9系统抑制水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法,包括以下步骤:/n利用CRISPR/Cas9系统抑制水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14的表达;所述CRISPR/Cas9系统中,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQID NO.1所示,所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQ IDNO.2所示。/n

【技术特征摘要】
1.一种利用CRISPR/Cas9系统同时改良水稻香味和白叶枯病抗性的方法,包括以下步骤:
利用CRISPR/Cas9系统抑制水稻香味基因Badh2和白叶枯病感病基因SWEET14的表达;所述CRISPR/Cas9系统中,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。


2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述水稻香味基因Badh2的引导RNA靶位点的接头引物包括核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的接头正向引物32870-Gf和核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的接头反向引物32870-U6Ar;所述白叶枯病感病基因SWEET14的引导RNA靶位点的接头引物包括核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的接头正向引物31190pro-Gf和核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的接头反向引物31190pro-U6Br。


3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述CRISPR/Cas9系统中,靶点gRNA表达盒的构建方法包括以下步骤:
分别以pYLsgRNA-OsU6a/LacZ质粒和pYLsgRNA-OsU6b/LacZ质粒作为模版,进行二轮的巢式PCR扩增,构建含水稻香味基因Badh2靶位点序列的sgRNA表达盒U6a-Badh2-gRNA和含白叶枯病感病基因SWEET14基因靶位点序列的sgRNA表达盒U6b-SWEET14-gRNA;
第一轮包括两个独立的扩增反应:用引物对U-F/接头反向引物进行反应1,和引物对接头正向引物/gR-R进行反应2;反应的程序均为:94℃10s,60℃15s,68℃20s,28个循环;所述接头反向引物为核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的接头反向引物32870-U6Ar或核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的接头反向引物31190pro-U6Br;所述接头正向引物为核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的接头正向引物32870-Gf或核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘毅张安宁刘国兰孔德艳徐凯王飞名余新桥罗利军
申请(专利权)人:上海市农业生物基因中心
类型:发明
国别省市:上海;31

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