一种样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统技术方案

本发明专利技术提供一种样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统。所述方法包括：拍摄得到样本玻片整体图像，所述样本玻片整体图像是未经显微放大的样本玻片照片，由第一拍摄装置对样本玻片直接拍摄得到；将所述样本玻片整体图像输入染色区域识别模块，识别得到所述样本玻片的染色区域；对所述样本玻片的染色区域的各位置依次进行显微放大拍摄，得到染色区域各位置对应的局部显微图像，所述局部显微图像由连接于显微镜镜筒的第二拍摄装置拍摄得到；将所述染色区域各位置对应的局部显微图像输入图像拼接模块，拼接得到染色区域显微图像。本发明专利技术避免了对样本玻片非染色区域的扫描，更快速的得到染色区域的显微图像，提高了病理诊断效率。

A scanning and image processing method of sample slide and digital microscope system

【技术实现步骤摘要】
一种样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统
本专利技术涉及医学样本玻片扫描和图像处理
，尤其涉及一种样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统。
技术介绍
在医学病理学检查中，需要取一定量的病变组织作为样本，用病理学方法制成样本玻片，用显微镜进一步检查病变以做出诊断。在制作样本玻片过程中通常要对样本进行染色，以便对样本更清楚的观察并做出诊断。随着数字显微镜技术的发展，现有技术可以使用样本玻片扫描的方式对样本玻片进行全面扫描，既在显微镜的放大下依次拍摄样本玻片各个局部位置的显微图像，并拼接得到完整的病理显微大图，病理学医生通过显示器观察病理图像并做出诊断。近年来，随着病理筛查和诊断的需要，医院需要检查的样本数量迅速增长，病理学诊断仍存在医疗资源紧张的问题，样本玻片扫描速度和诊断效率有待进一步提高。
技术实现思路
以提高样本玻片扫描速度和病理诊断效率为目的，本专利技术提供一种样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统。本专利技术提供一种样本玻片扫描和图像处理方法，包括：拍摄得到样本玻片整体图像，所述样本玻片整体图像是未经显微放大的样本玻片照片，由第一拍摄装置对样本玻片直接拍摄得到；将所述样本玻片整体图像输入染色区域识别模块，识别得到所述样本玻片的染色区域；对所述样本玻片的染色区域的各位置依次进行显微放大拍摄，得到染色区域各位置对应的局部显微图像，所述局部显微图像由连接于显微镜镜筒的第二拍摄装置拍摄得到；将所述染色区域各位置对应的局部显微图像输入图像拼接模块，拼接得到染色区域显微图像。可选地，所述第一拍摄装置配置有照明装置，所述样本玻片整体图像在所述照明装置的照明下拍摄得到。可选地，所述方法还包括：将所述染色区域显微图像输入深度学习辅助诊断模块进行图像分析，得到染色区域显微图像的辅助诊断结果。可选地，所述方法还包括：在依次对染色区域各位置对应的局部显微图像拍摄过程中，实时将拍摄得到的所述局部显微图像输入深度学习辅助诊断模块进行图像分析，得到各局部显微图像的辅助诊断结果；根据各局部显微图像的辅助诊断结果，得到染色区域显微图像的辅助诊断结果。可选地，所述辅助诊断结果包括对特定疾病的阴阳性分类结果或对图像中的病灶区域检测结果。可选地，所述辅助诊断结果是对所述局部显微图像的阴阳性分类；在依次对各局部显微图像进行图像分析的过程中，若出现阳性分类，实时进行提示。可选地，所述染色区域识别模块包括训练后的神经网络目标检测器或/和训练后的神经网络分割器。可选地，所述将所述样本玻片整体图像输入染色区域识别模块，识别得到所述样本玻片的染色区域，具体步骤包括：将所述样本玻片整体图像输入所述训练后的神经网络目标检测器进行目标检测，得到染色区域目标检测结果；将所述样本玻片整体图像输入所述训练后的神经网络分割器进行图像分割，得到染色区域分割结果。可选地，所述对所述样本玻片的染色区域的各位置依次进行显微放大拍摄，具体步骤包括：对染色区域目标检测结果的范围进行平均划分得到多个拍摄焦点；判断各拍摄焦点是否在染色区域分割结果范围内；根据染色区域分割结果范围内的各拍摄焦点得到染色区域的焦平面；根据所述染色区域的焦平面，依次进行显微放大拍摄得到染色区域各位置的局部显微图像。本专利技术还提供一种数字显微镜系统，其特征在于，包括：可移动载物台，用于承载样本玻片；镜筒，配置有物镜和目镜，用于对样本玻片进行显微放大；第一拍摄装置，用于对样本玻片直接拍摄得到未经显微放大的样本玻片整体图像；第二拍摄装置，连接于所述镜筒，用于拍摄得到样本玻片染色区域的显微放大后的局部显微图像；控制模块，用于控制载物台的移动及第一拍摄装置和第二拍摄装置的拍摄；计算单元，配置有染色区域识别模块和图像拼接模块；所述染色区域识别模块配置为识别得到所述样本玻片的染色区域；所述图像拼接模块配置为将所述染色区域各位置对应的局部显微图像拼接得到染色区域显微图像。可选地，所述计算单元还配置有深度学习辅助诊断模块；用于对所述染色区域显微图像或局部显微图像进行图像分析得到辅助诊断结果。可选地，所述深度学习辅助诊断模块还用于根据各局部显微图像的辅助诊断结果，得到染色区域显微图像的辅助诊断结果。可选地，数字显微镜系统还包括输出显示装置，用于输出显示所述染色区域显微图像和/或所述辅助诊断结果。可选地，在依次对各局部显微图像进行图像分析的过程中，若出现阳性分类，所述输出显示装置实时进行提示。本专利技术通过先使用第一拍摄装置拍摄样本玻片整体图像，并使用染色区域识别模块识别样本玻片中的染色区域，使用连接于显微镜镜筒的第二拍摄装置结合载物台的移动仅对染色区域进行扫描，得到染色区域各位置对应的局部显微图像，并拼接得到完整的染色区域显微图像。本专利技术避免了对样本玻片非染色区域(样本玻片中没有样本的区域)的扫描，更快速的得到染色区域的显微图像，提高了病理诊断效率。附图说明图1是一种样本玻片扫描和图像处理方法实施例流程图。图2是另一种样本玻片扫描和图像处理方法实施例流程图。图3是一个样本玻片整体图像及染色区域识别示意图。图4是一种数字显微镜系统实施例示意图。具体实施方式以下通过特定的具体实例说明本专利技术的实施方式，本领域技术人员可由本说明书所揭露的内容轻易地了解本专利技术的其他优点与功效。本专利技术还可以通过另外不同的具体实施方式加以实施或应用，本说明书中的各项细节也可以基于不同观点与应用，在没有背离本专利技术的精神下进行各种修饰或改变。需说明的是，在不冲突的情况下，以下实施例及实施例中的特征可以相互组合。需要说明的是，以下实施例中所提供的图示仅以示意方式说明本专利技术的基本构想，遂图式中仅显示与本专利技术中有关的组件而非按照实际实施时的组件数目、形状及尺寸绘制，其实际实施时各组件的型态、数量及比例可为一种随意的改变，且其组件布局型态也可能更为复杂。本实施例的目的在于提供一种样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统，以提高样本玻片扫描速度和病理诊断效率为目的。以下将详细阐述本实施例的样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统的原理及实施方式，使本领域技术人员不需要创造性劳动即可理解本专利技术的样本玻片扫描和图像处理方法及数字显微镜系统。如图1所示，是本专利技术一种样本玻片扫描和图像处理方法实施例。在本事实例中，首先进行样本玻片扫描，包括以下具体步骤。步骤S100，拍摄得到样本玻片整体图像。拍摄得到的样本玻片整体图像如图3-a所示。本事实例中，样本玻片整体图像是未经显微放大的样本玻片照片，由配置于显微镜上的第一拍摄装置对样本玻片直接拍摄得到。在一些实施例中，为了拍摄获得更清晰的样本玻片整体图像，第一拍摄装置配置有照明装置，所述样本玻片整体图像在所述照明装置的照明下拍摄得到。步骤S200，将样本玻片整体图像输入染色区域识别模块，识别得到样本玻片的染色区域。在本实施例中，染色区域识别模块包括一个或多个经过训练的神经网络模型。本事实例中的神经网本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，包括：/n拍摄得到样本玻片整体图像，所述样本玻片整体图像是未经显微放大的样本玻片照片，由第一拍摄装置对样本玻片直接拍摄得到；/n将所述样本玻片整体图像输入染色区域识别模块，识别得到所述样本玻片的染色区域；/n对所述样本玻片的染色区域的各位置依次进行显微放大拍摄，得到染色区域各位置对应的局部显微图像，所述局部显微图像由连接于显微镜镜筒的第二拍摄装置拍摄得到；/n将所述染色区域各位置对应的局部显微图像输入图像拼接模块，拼接得到染色区域显微图像。/n

【技术特征摘要】
1.一种样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，包括：
拍摄得到样本玻片整体图像，所述样本玻片整体图像是未经显微放大的样本玻片照片，由第一拍摄装置对样本玻片直接拍摄得到；
将所述样本玻片整体图像输入染色区域识别模块，识别得到所述样本玻片的染色区域；
对所述样本玻片的染色区域的各位置依次进行显微放大拍摄，得到染色区域各位置对应的局部显微图像，所述局部显微图像由连接于显微镜镜筒的第二拍摄装置拍摄得到；
将所述染色区域各位置对应的局部显微图像输入图像拼接模块，拼接得到染色区域显微图像。


2.根据权利要求1所述的样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，所述第一拍摄装置配置有照明装置，所述样本玻片整体图像在所述照明装置的照明下拍摄得到。


3.根据权利要求1所述的样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，所述方法还包括：
将所述染色区域显微图像输入深度学习辅助诊断模块进行图像分析，得到染色区域显微图像的辅助诊断结果。


4.根据权利要求1所述的样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，所述方法还包括：
在依次对染色区域各位置对应的局部显微图像拍摄过程中，实时将拍摄得到的所述局部显微图像输入深度学习辅助诊断模块进行图像分析，得到各局部显微图像的辅助诊断结果；
根据各局部显微图像的辅助诊断结果，得到染色区域显微图像的辅助诊断结果。


5.根据权利要求3或4所述的样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，所述辅助诊断结果包括对特定疾病的阴阳性分类结果或对图像中的病灶区域检测结果。


6.根据权利要求1所述的样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，所述辅助诊断结果是对所述局部显微图像的阴阳性分类；
在依次对各局部显微图像进行图像分析的过程中，若出现阳性分类，实时进行提示。


7.根据权利要求1所述的样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，所述染色区域识别模块包括训练后的神经网络目标检测器或/和训练后的神经网络分割器。


8.根据权利要求7所述的样本玻片扫描和图像处理方法，其特征在于，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：姜辰希，房劬，
申请(专利权)人：上海杏脉信息科技有限公司，
类型：发明
国别省市：上海;31