异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用制造技术

技术编号:24699081 阅读:108 留言:0更新日期:2020-06-30 22:58
本发明专利技术公开了异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用。本发明专利技术提供了特定DNA片段或其相关生物材料在培育抗旱棉花品种或品系或提高棉花抗旱性中的应用;所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自SSR分子标记JAAS6365(SEQ ID No.1)起至SSR分子标记JAAS5604(SEQ ID No.2)止的片段;所述相关生物材料为含有所述特定DNA片段的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系。本发明专利技术所提供的染色体片段在抗旱棉花育种中具有重要应用价值,同时本发明专利技术开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的抗旱棉花品种提供分子基础。

Drought resistance related SSR sequence of abnormal cotton and its application

【技术实现步骤摘要】
异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用
本专利技术涉及棉花育种领域,具体涉及异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用。
技术介绍
棉花是世界上重要的经济作物和纺织工业原料,其生产状况对世界经济的发展具有重要的影响。近年来,随着全球气候的不断恶化和生态环境的破坏,盐碱干旱地域面积越大越大。棉属(Gossypiumspp.)有四个栽培种,其中陆地棉(GossypiumhirsutumL.)因产量高主导了世界棉花生产。但是,由于长期的人工选择,陆地棉遗传基础狭窄,其抗旱性与其它作物相比虽较强,但干旱和沙漠化依然对棉花产量和纤维品质造成了持续性的危害。因此,加强棉花的抗旱育种研究,培育耐旱新品种/品系尤为重要。棉属二倍体野生种为棉花育种提供了丰富的基因资源,从野生棉渐渗外源基因进入陆地棉基因库是陆地棉遗传改良行之有效的方法。国内外已有不少利用二倍体野生棉进行陆地棉遗传改良的报道,但由于染色体倍性水平和遗传结构的差异,棉属二倍体野生种在陆地棉遗传改良中的利用还是十分有限的。棉属二倍体B组野生种异常棉(G.anomalum)起源于非洲,主要分布在安哥拉的海岸地带和非洲的西南部以及大沙漠的南部边境,具有较强的耐旱性等,是陆地棉遗传改良的宝贵基因资源。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用。第一方面,本专利技术要求保护特定DNA片段或其相关生物材料在如下任一中的应用:(A1)培育抗旱棉花品种或品系;(A2)提高棉花的抗旱性。所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自SSR分子标记JAAS6365起至SSR分子标记JAAS5604止的片段。所述SSR分子标记JAAS6365的核苷酸序列如SEQIDNo.1所示。所述SSR分子标记JAAS5604的核苷酸序列如SEQIDNo.2所示。所述相关生物材料为含有所述特定DNA片段的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系。所述载体可为人工染色体载体,如细菌人工染色体或酵母人工染色体等。所述重组菌和所述转基因细胞系含有所述人工染色体载体。进一步地,所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。在所述应用中,可以用所述特定DNA片段替换受体亲本原有染色体片段,得到抗旱性提高的棉花品种或品系。第二方面,本专利技术要求保护SSR分子标记或成套SSR分子标记在筛选特定DNA片段以培育抗旱性提高的棉花品种或品系中的应用。所述SSR分子标记为如下(a1)-(a3)中任一;所述成套SSR分子标记由如下(a1)-(a3)组成;(a1)SSR分子标记JAAS6365:核苷酸序列如SEQIDNo.1所示的DNA分子;(a2)SSR分子标记JAAS5604:核苷酸序列如SEQIDNo.2所示的DNA分子;(a3)SSR分子标记JAAS0803:核苷酸序列如SEQIDNo.3所示的DNA分子。所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。进一步地,所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。第三方面,本专利技术要求保护引物对或成套引物对或含有所述引物对或所述成套引物对的试剂盒在筛选特定DNA片段以培育抗旱性提高的棉花品种或品系中的应用。所述引物对为如下(b1)-(b3)中任一;所述成套引物对由如下(b1)-(b3)组成;(b1)用于鉴定所述SSR分子标记JAAS6365的引物对1:根据SEQIDNo.1设计得到;(b2)用于鉴定所述SSR分子标记JAAS5604的引物对2:根据SEQIDNo.2设计得到;(b3)用于鉴定所述SSR分子标记JAAS0803的引物对3:根据SEQIDNo.3设计得到。所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。进一步地,所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。在本专利技术的具体实施方式中,所述引物对1由SEQIDNo.4和SEQIDNo.5所示的两条单链DNA组成;所述引物对2由SEQIDNo.6和SEQIDNo.7所示的两条单链DNA组成;所述引物对3由SEQIDNo.8和SEQIDNo.9所示的两条单链DNA组成。所述试剂盒中还可含有PCR扩增缓冲液、双蒸水、DNA聚合酶、dNTP等中的任一种或多种。第四方面,本专利技术要求保护SSR分子标记或成套SSR分子标记或特定DNA片段在鉴定或者辅助鉴定棉花抗旱性中的应用。所述SSR分子标记为如下(a1)-(a3)中任一;所述成套SSR分子标记由如下(a1)-(a3)组成;(a1)SSR分子标记JAAS6365:核苷酸序列如SEQIDNo.1所示的DNA分子;(a2)SSR分子标记JAAS5604:核苷酸序列如SEQIDNo.2所示的DNA分子;(a3)SSR分子标记JAAS0803:核苷酸序列如SEQIDNo.3所示的DNA分子。所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。进一步地,所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。第五方面,本专利技术要求保护引物对或成套引物对或含有所述引物对或所述成套引物对的试剂盒在鉴定或者辅助鉴定棉花抗旱性中的应用;所述引物对为如下(b1)-(b3)中任一;所述成套引物对由如下(b1)-(b3)组成;(b1)用于鉴定所述SSR分子标记JAAS6365的引物对1:根据SEQIDNo.1设计得到;(b2)用于鉴定所述SSR分子标记JAAS5604的引物对2:根据SEQIDNo.2设计得到;(b3)用于鉴定所述SSR分子标记JAAS0803的引物对3:根据SEQIDNo.3设计得到。在本专利技术的具体实施方式中,所述引物对1由SEQIDNo.4和SEQIDNo.5所示的两条单链DNA组成;所述引物对2由SEQIDNo.6和SEQIDNo.7所示的两条单链DNA组成;所述引物对3由SEQIDNo.8和SEQIDNo.9所示的两条单链DNA组成。所述试剂盒中还可含有PCR扩增缓冲液、双蒸水、DNA聚合酶、dNTP等中的任一种或多种。第六方面,本专利技术要求保护一种培育抗旱性提高的棉花品种或品系的方法,包括如下步骤:用至少含有位于异常棉5号染色体上自SSR分子标记JAAS6365起至SSR分子标记JAAS5604止本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.特定DNA片段或其相关生物材料在如下任一中的应用:/n(A1)培育抗旱棉花品种或品系;/n(A2)提高棉花的抗旱性;/n所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自SSR分子标记JAAS6365起至SSR分子标记JAAS5604止的片段;/n所述SSR分子标记JAAS6365的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;/n所述SSR分子标记JAAS5604的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;/n所述相关生物材料为含有所述特定DNA片段的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系。/n

【技术特征摘要】
1.特定DNA片段或其相关生物材料在如下任一中的应用:
(A1)培育抗旱棉花品种或品系;
(A2)提高棉花的抗旱性;
所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自SSR分子标记JAAS6365起至SSR分子标记JAAS5604止的片段;
所述SSR分子标记JAAS6365的核苷酸序列如SEQIDNo.1所示;
所述SSR分子标记JAAS5604的核苷酸序列如SEQIDNo.2所示;
所述相关生物材料为含有所述特定DNA片段的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系。


2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。


3.SSR分子标记或成套SSR分子标记在筛选特定DNA片段以培育抗旱性提高的棉花品种或品系中的应用;
所述SSR分子标记为如下(a1)-(a3)中任一;所述成套SSR分子标记由如下(a1)-(a3)组成;
(a1)SSR分子标记JAAS6365:核苷酸序列如SEQIDNo.1所示的DNA分子;
(a2)SSR分子标记JAAS5604:核苷酸序列如SEQIDNo.2所示的DNA分子;
(a3)SSR分子标记JAAS0803:核苷酸序列如SEQIDNo.3所示的DNA分子;
所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。


4.引物对或成套引物对或含有所述引物对或所述成套引物对的试剂盒在筛选特定DNA片段以培育抗旱性提高的棉花品种或品系中的应用;
所述引物对为如下(b1)-(b3)中任一;所述成套引物对由如下(b1)-(b3)组成;
(b1)引物对1:根据SEQIDNo.1设计得到;
(b2)引物对2:根据SEQIDNo.2设计得到;
(b3)引物对3:根据SEQIDNo.3设计得到;
所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自所述SSR分子标记JAAS6365起至所述SSR分子标记JAAS5604止的片段。


5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:所述引物...

【专利技术属性】
技术研发人员:徐珍珍徐鹏沈新莲郭琪孟珊
申请(专利权)人:江苏省农业科学院
类型:发明
国别省市:江苏;32

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