一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法技术

本发明专利技术公开了一种利用普通牛(Bos taurus)Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法。本发明专利技术利用基因组重测序结果，对主要肉牛和奶牛品种的Y染色体DNA序列进行扫描，发现了荷斯坦牛、红安格斯牛、夏洛来牛、盖普威牛、利木赞牛、西门塔尔牛、韩牛、海福特牛品种特有的Y染色体SNP位点，根据这些SNP位点在DNA水平上鉴别不同品种公牛，能有效用于上述各品种的引种及分子标记辅助育种，为快速建立遗传资源优良的普通牛种群奠定基础。

A method for identification of bull breeds by using single nucleotide genetic markers on Y chromosome of common cattle

【技术实现步骤摘要】
一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法
本专利技术属于生物
，涉及利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记(SNP)鉴定公牛品种的方法，可用于引种和育种的分子标记辅助鉴别。
技术介绍
单核苷酸多态(SNP，singlenucleotidepolymorphism)是同一物种不同个体基因组DNA的等位序列上单个核苷酸存在差别的现象。相同长度的单链DNA因其顺序不同或单个碱基差异，所形成的构象就会不同。人类基因组计划已经鉴别出了许多的SNPs，它是生物体基因组中存在最为广泛的一类变异，是由于单个核苷酸的插入、缺失、转换和颠换而引起的。哺乳动物Y染色体雄性特异区(Malespecificregion,Ychromosome；MSY)在减数分裂时不与X染色体发生重组，因此呈典型的父系遗传，仅存在于雄性个体。Y-SNPs标记已广泛用于世界牛群的遗传多样性和起源研究，已有发现普通牛有2种Y染色体单倍型Y1和Y2(etal.2005；Ginjaetal.2010)，但由于SNP数目非常有限，不能用于牛品种区分。...

【技术保护点】
1.一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法，其特征在于：包括以下步骤：/n提取待鉴定公牛的基因组DNA，对该基因组DNA在牛Y染色体参考基因组序列中各个与品种鉴定关联的特征SNP所对应的单核苷酸位点的多态性进行遍历检测，若检测到突变等位基因，则根据检出突变等位基因的位点确定待鉴定公牛的品种；/n其中，所述公牛的品种为利木赞牛及西门塔尔牛；/n所述利木赞牛的特征SNP定位在牛Y染色体参考基因组第9053955位，突变等位基因为碱基A；/n所述西门塔尔牛的特征SNP定位在牛Y染色体参考基因组第7966557位，突变等位基因为碱基G。/n

【技术特征摘要】
1.一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法，其特征在于：包括以下步骤：
提取待鉴定公牛的基因组DNA，对该基因组DNA在牛Y染色体参考基因组序列中各个与品种鉴定关联的特征SNP所对应的单核苷酸位点的多态性进行遍历检测，若检测到突变等位基因，则根据检出突变等位基因的位点确定待鉴定公牛的品种；
其中，所述公牛的品种为利木赞牛及西门塔尔牛；
所述利木赞牛的特征SNP定位在牛Y染色体参考基因组第9053955位，突变等位基因为碱基A；
所述西门塔尔牛的特征SNP定位在牛Y染色体参考基因组第7966557位，突变等位基因为碱基G。


2.根据权利要求1所述一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法，其特征在于：利用牛Y染色体的遗传变异信息可以准确区分普通牛品种来源信息。


3.根据权利要求1所述一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法，其特征在于：根据对不同品种公牛的个体Y染色体重测序结果，确定对应品种公牛的特征SNP在牛Y染色体参考基因组序列中的位点信息。


4.根据权利要求1所述一种利用普通牛Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定公牛品种的方法，其特征在于：所述特征SNP的确定标准如下：SNP位点必需雄性特异；同时，公牛个体在SNP位点的基因型均为...

【专利技术属性】
技术研发人员：李冉，姜雨，王喜宏，曹春娜，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：陕西;61