检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用制造技术

本发明专利技术提供了检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用，属于食管鳞癌预后检测技术领域；本发明专利技术中，所述菌群所述菌群包括食管鳞癌患者癌组织中克罗诺杆菌属(Cronobacter)、食管鳞癌患者癌旁组织中盐单胞菌科(Family Halomonadaceae)和食管鳞癌患者癌旁组织中肉杆菌菌属(Carnobacterium)中的一种或几种。本发明专利技术为食管鳞癌预后预测提供了微生物相关证据，为食管鳞癌患者预后预测提供了参考依据。

The application of the reagent for the detection of flora in the preparation of the reagent or kit for the prognosis prediction of esophageal squamous cell carcinoma patients

【技术实现步骤摘要】
检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用
本专利技术涉及食管鳞癌预后检测
，尤其涉及检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用。
技术介绍
食管癌是中国最常见的严重危害人民健康的恶性肿瘤之一，95％为食管鳞癌，具有恶性程度高、转移快、术后生存质量差及明显的区域发病率等特点。现有技术中，Gao等通过qPCR测序技术检测了食管鳞癌患者癌组织菌群分布情况，结果发现牙龈卟啉单胞菌在癌组织当中丰度较高，且牙龈卟啉单胞菌是食管鳞癌患者预后的影响因素，相比于牙龈卟啉单胞菌阴性患者，阳性患者的生存率较低。Yamamura等通过qPCR测序检测了食管鳞癌患者癌组织具核梭菌的分布情况，结果显示具核梭菌在癌组织当中丰度较高，相比于具核梭菌检测阴性患者，阳性患者的生存率较低，具核梭菌是食管鳞状细胞癌患者预后的危险因素。但是仅对某一种特定的菌进行预后分析，并未考虑组织中其他菌群的影响，存在鉴定指标单一，代表性不足的问题。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供检测菌群的试剂在制备食管鳞癌预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用，利用本专利技术的检测菌群的试剂对食管鳞癌预后进行检测，代表性好，结果可靠。为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：本专利技术提供了检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用，所述菌群包括食管鳞癌患者癌组织中克罗诺杆菌属(Cronobacter)、食管鳞癌患者癌旁组织中盐单胞菌科(FamilyHalomonadaceae)和食管鳞癌患者癌旁组织中肉杆菌菌属(Carnobacterium)中的一种或几种。本专利技术提供了检测肉杆菌菌属(Carnobacterium)的试剂在制备食管鳞癌患者术后化疗预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用。本专利技术提供了一种食管鳞癌患者预后预测标志物，所述食管鳞癌患者预后预测标志物包括食管鳞癌患者癌组织中克罗诺杆菌属(Cronobacter)、食管鳞癌患者癌旁组织中盐单胞菌科(FamilyHalomonadaceae)和食管鳞癌患者癌旁组织中肉杆菌菌属(Carnobacterium)中的一种或几种。本专利技术提供了一种食管鳞癌患者术后化疗预后预测标志物，所述食管鳞癌患者术后化疗预后预测标志物包括肉杆菌菌属(Carnobacterium)。本专利技术的有益效果：本专利技术提供了检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用，所述菌群包括食管鳞癌患者癌组织中克罗诺杆菌属(Cronobacter)、食管鳞癌患者癌旁组织中盐单胞菌科(FamilyHalomonadaceae)和食管鳞癌患者癌旁组织中肉杆菌菌属(Carnobacterium)中的一种或几种；所述克罗诺杆菌属(Cronobacter)为食管鳞癌患者的癌组织中菌群，与食管鳞癌患者的预后有关，克罗诺杆菌属(Cronobacter)阳性患者的预后较好(HR＝0.436，95％CI:0.272-0.698)；所述盐单胞菌科(FamilyHalomonadaceae)为食管鳞癌患者的癌旁组织中菌群，与食管鳞癌患者的预后有关，盐单胞菌科阳性患者的预后较好(HR＝0.161，95％CI:0.058-0.447)；所述肉杆菌菌属(Carnobacterium)为食管鳞癌术后化疗患者的癌旁组织中菌群，与食管鳞癌术后化疗患者预后有关，未检出肉杆菌菌属(Carnobacterium)的患者，术后化疗者预后劣于单纯手术者(HR＝2.650，95％CI＝1.199-5.856，P＝0.016)；而对于体内存在肉杆菌菌属(Carnobacterium)且接受手术+化疗的患者的预后较好(HR＝0.150，95％CI＝0.033-0.686，P＝0.014)，因此临床使用化疗治疗食管鳞癌术后患者，可以参考其体内是否存在肉杆菌菌属(Carnobacterium)进行选择是否选择化疗方案，为实现食管鳞癌患者术后的精准化治疗提供参考依据。本专利技术为食管鳞癌预后预测提供了微生物相关证据，为食管鳞癌患者预后预测提供了参考依据。附图说明图1为实施例1流程图；图2为实施例1中部分食管鳞癌患者的癌组织基因组DNA检测图，其中编号为A25～A30癌组织样本对应的泳道为3～8泳道；图3为实施例1中部分食管鳞癌患者的癌旁组织基因组DNA检测图，其中编号为B1～B5癌旁组织样本对应的泳道为3～7泳道；图4为实施例1中部分食管鳞癌患者的癌组织16SrRNAV3-V4区检测图，其中编号为A37，A59，A58，A99癌组织样本对应的泳道为2～5泳道；图5为实施例1中部分食管鳞癌患者的癌旁组织16SrRNAV3-V4区检测图，其中编号为B31、B59、B32和B43癌旁组织样本对应的泳道为2～4、6泳道；图6-A为实施例1中癌组织中产碱菌科(Alcaligenaceae)分布情况不同患者生存曲线；图6-B为实施例1中癌组织中克罗诺杆菌属(Cronobacter)分布情况不同患者生存曲线；图6-C为实施例1中癌组织中瘤胃球菌属(Ruminococcus)分布情况不同患者生存曲线；图6-D为实施例1中癌组织中气球菌属(Aerococcus)分布情况不同患者生存曲线；图6-E为实施例1中癌组织中都柏林克洛诺斯氏菌(Cronobacterdublinensis)分布情况不同患者生存曲线；图6-F为实施例1中癌组织中水草盐孢菌(Salinisporatropica)分布情况不同患者生存曲线；图6-G为实施例1中癌组织中卡托氏菌属(Catonella)分布情况不同患者生存曲线；图6-H为实施例1中癌组织中坦纳氏普拉沃氏菌(Prevotellatannerae)分布情况不同患者生存曲线；图7为实施例2流程图；图8为实施例2中部分食管鳞癌患者癌组织的基因组DNA检测图，其中编号为A25～29癌组织样本对应的泳道为3～7泳道；图9为实施例2中部分食管鳞癌患者癌旁组织的基因组DNA检测图，其中编号为B16～20癌旁组织样本对应的泳道为3～7泳道；图10为实施例2中部分食管鳞癌患者16SrRNAV3-V4区检测图，其中编号为B18，B29，B19，B20癌旁组织样本对应的泳道为2，3，4，6泳道；图11-A为实施例2中癌旁组织中间孢囊菌科(Intrasporangiaceae)分布情况不同患者生存曲线；图11-B为实施例2中癌旁组织中间生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)分布情况不同患者生存曲线；图11-C为实施例2中癌旁组织中盐单胞菌科(Halomonadaceae)分布情况不同患者生存曲线；图11-D为实施例2中癌旁组织中硝化螺旋菌属(Nitrospira)分布情况不同患者生存曲线；图11-E为实施例2中癌旁组织中甲基杆菌属(Methylobacterium)分布情况不同患者生存曲线；<本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用，所述菌群包括食管鳞癌患者癌组织中克罗诺杆菌属(Cronobacter)、食管鳞癌患者癌旁组织中盐单胞菌科(Family Halomonadaceae)和食管鳞癌患者癌旁组织中肉杆菌菌属(Carnobacterium)中的一种或几种。/n

【技术特征摘要】
1.检测菌群的试剂在制备食管鳞癌患者预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用，所述菌群包括食管鳞癌患者癌组织中克罗诺杆菌属(Cronobacter)、食管鳞癌患者癌旁组织中盐单胞菌科(FamilyHalomonadaceae)和食管鳞癌患者癌旁组织中肉杆菌菌属(Carnobacterium)中的一种或几种。


2.检测肉杆菌菌属(Carnobacterium)的试剂在制备食管鳞癌患者术后化疗预后预测标志物的试剂或试剂盒中的应用。
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【专利技术属性】
技术研发人员：胡志坚，林征，刘双，相智声，谢倩雯，
申请(专利权)人：福建医科大学，
类型：发明
国别省市：福建;35