鉴定新型冠状病毒的引物探针及在三重荧光RPA的应用制造技术

技术编号:24399413 阅读:87 留言:0更新日期:2020-06-06 04:47
本发明专利技术公开了一种快速筛查检测新型冠状病毒(SARS‑CoV2)以及其他类SARS冠状病毒的三重RPA引物、探针、鉴定方法以及鉴定试剂盒。本发明专利技术在SARS‑CoV2病毒的N基因序列区域设计第一套引物、探针(标记为FAM);在类SARS病毒保守区域E基因序列设计第二套引物、探针(标记为HEX);在SARS‑CoV2病毒的S基因序列特异性区域设计第三套引物、探针(标记为Cy5,与其他类SARS病毒均不同)。相比目前WHO以及国家CDC推荐的新型冠状病毒确诊所用qPCR核酸检测方法,本发明专利技术具有敏感度高、快速以及有效区分新型冠状病毒和其他类SARS病毒的优点,可将病毒核酸检测时限从90min缩短到20min,可满足新型冠状病毒以及其他类SARS病毒的快速筛查需求。

Identification of novel coronavirus primers and application in three fluorescent RPA

【技术实现步骤摘要】
鉴定新型冠状病毒的引物探针及在三重荧光RPA的应用
本专利技术属于应用生物
,具体涉及筛查鉴定新型冠状病毒以及其他类SARS冠状病毒的特异性快速筛查检测引物、探针、鉴定方法及鉴定试剂盒。
技术介绍
新型冠状病毒(SARS-CoV2)导致的肺炎疫情(COVID-19)目前席卷全球,其对经济、社会、人民正常的生活影响巨大,而对新冠病毒病例的快速诊断就成为切断传染源、控制疫情传播的重要手段。尤其是当前国内疫情趋于平稳,国外疫情严峻,输入性病例增加,对核酸排查的精准性要求更高。目前国家CDC和WHO均推荐了荧光定量PCR作为新型冠状病毒确诊方法,然而实际应用过程中时效性不是特别好,反转录荧光PCR耗时90min,还需要专门的荧光PCR仪进行数据分析。相比荧光定量PCR,荧光恒温RPA具有快速、准确、对仪器设备要求低等优势;此外,本专利技术三重RPA可用于鉴定区分新型冠状病毒与其他类SARS病毒,这对疫病防控及筛查其他类似疫病有重大影响。
技术实现思路
本专利技术提供了一组用于鉴定新型冠状病毒(SARS-CoV2)的引物本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于鉴定新型冠状病毒(SARS-CoV2)的引物和探针,所述的引物和探针包括第一套引物探针,所述第一套引物探针包括如下的正向引物NF、反向引物NR和探针NP:/n正向引物NF:/nAAGACCTTAAATTCCCTCGAGGACAAGGCGTTC;/n反向引物NR:/nAGGTAGTAGAAATACCATCTTGGACTGAGATCT3’;/n探针NP:/nCACCAATAGCAGTCCAGATGACCAAATTGGC/i6FAMdT/A/idSp//iBHQ1dT/ACCGAAGAGCTACCAG/iSpC3/。/n

【技术特征摘要】
1.用于鉴定新型冠状病毒(SARS-CoV2)的引物和探针,所述的引物和探针包括第一套引物探针,所述第一套引物探针包括如下的正向引物NF、反向引物NR和探针NP:
正向引物NF:
AAGACCTTAAATTCCCTCGAGGACAAGGCGTTC;
反向引物NR:
AGGTAGTAGAAATACCATCTTGGACTGAGATCT3’;
探针NP:
CACCAATAGCAGTCCAGATGACCAAATTGGC/i6FAMdT/A/idSp//iBHQ1dT/ACCGAAGAGCTACCAG/iSpC3/。


2.根据权利要求1所述的用于鉴定新型冠状病毒(SARS-CoV2)的引物和探针,其特征在于,还包括第二套引物探针,所述第二套引物探针包括如下的正向引物EF、反向引物ER和探针EP:
正向引物EF:
GACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGTACTTCT;
反向引物ER:
AGACTCACGTTAACAATATTGCAGCAGTACGCA;
探针EP:
TTCGTGGTATTCTTGCTAGTTACACTAGCCA/iHEXdT/C/idSp//iBHQ1dT/TACTGCGCTTCGATTG/iSpC3/。


3.根据权利要求2所述的用于鉴定新型冠状病毒(SARS-CoV2)的引物和探针,其特征在于,还包括第三套引物探针,所述第三套引物探针包括如下的正向引物SF、反向引物SR和探针SP:
正向引...

【专利技术属性】
技术研发人员:吕继洲张舟袁向芬林祥梅吴绍强王彩霞邓俊花冯春燕
申请(专利权)人:中国检验检疫科学研究院
类型:发明
国别省市:北京;11

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