The invention discloses a primer group, kit and detection method for SMN1 gene detection. The base to be tested is located at the 3 'end of the primer by lamp technology, and the auxiliary mutation base is on the second base at the 3' end of the auxiliary mutation primer. The amplified primer is artificially mutated during the design of the primer by neighboring bases of the tested site, and the obtained primer can accurately identify during the amplification process The base to be determined at the 3 'end of the primer. It can significantly improve the recognition ability of the 3 'end of the primer of BST DNA polymerase, avoid the design and use of the probe, reduce the cost of detection, and improve the stability of the detection reagent preservation; the RING-mediated isothermal amplification technology has a high sensitivity, only a small number of patients' oral swabs after boiling release of DNA can be used as templates for amplification, greatly simplifying the operation steps.
【技术实现步骤摘要】
一种SMN1基因检测的引物组、试剂盒及检测方法
本专利技术属于分子生物学
,具体涉及一种SMN1基因检测引物组、试剂盒及检测方法。
技术介绍
脊髓型肌萎缩症(Spinalmuscularatrophy,SMA)是一类相对常见的常染色体隐性遗传病,以脊髓前角运动神经元退化变性和丢失导致的肌无力和肌萎缩为主要临床特征。SMA发病率为1/10000~1/6000,携带率为1/50~1/40。SMA的发病原因主要是由于位于5q13.2上的运动神经元存活基因1(survivalmotorneurongene1,SMN1)上的7号外显子第6个碱基由C突变为T,导致SMN蛋白功能缺陷所致的遗传性神经肌肉病。SMN是一个广泛表达的管家蛋白,可作为亚单位与Sm蛋白结合,以SMN复合体形式募集Sm核蛋白和小核核糖核酸(snRNAs)组装成核糖核蛋白复合物(snRNPs)。目前已经研制出了针对SMA的有效药物,但仍需要早发现早治疗,尤其是针对婴儿期的SMA患者治疗效果更佳。因此,实施新生儿SMA筛查对于进行症状前诊断至关重要。目前, ...
【技术保护点】
1.一种SMN1基因检测的引物组,其特征在于,该引物组为以下A、B、C、D四组中的任一种;/n所述的A组包括引物A-F3-W、A-F3-M、A-B3、A-FIP、A-BIP、A-LF和A-LB:/nA-F3-W:5’-CCTTTATTTTCCTTACAGGGTT
【技术特征摘要】
1.一种SMN1基因检测的引物组,其特征在于,该引物组为以下A、B、C、D四组中的任一种;
所述的A组包括引物A-F3-W、A-F3-M、A-B3、A-FIP、A-BIP、A-LF和A-LB:
A-F3-W:5’-CCTTTATTTTCCTTACAGGGTTVC-3’;
A-F3-M:5’-CCTTTATTTTCCTTACAGGGTTVT-3’;
A-B3:5’-CTAGTAGGGATGTAGATTAACC-3’;
A-FIP:5’-AAAGTAAGATTCACTTTCATAATGCTGACAAAATCAAAAAGAAGGAAGGT-3’;
A-BIP:5’-GGTTTGTGGAAAACAAATGTTTTTGAGGCATCAAAATTCTTTAATATT-3’;
A-LF:5’-GACTTACTCCTTAATTTAAGGAAT-3’;
A-LB:5’-GTTCAGATGTTAAAAAGTTGAAA-3’;
所述的B组包括引物B-F3、B-B3-W、B-B3-M、B-FIP、B-BIP、B-LF和B-LB:
B-F3:5’-CCTTAACTGCAGCCTAATAAT-3’;
B-B3-W:5’-TCCTTCTTTTTGATTTTGTCVG-3’;
B-B3-M:5’-TCCTTCTTTTTGATTTTGTCVA-3’;
B-FIP:5’-GCATTTTGTTTCACAAGACATTTTACGGATAACTTTTAAAGTACATTAA-3’;
B-BIP:5’-CATCCATATAAAGCTATCTATATACCTGTAAGGAAAATAAAGGAAGTT-3’;
B-LF:5’-CAACAAAATATGATCAGAAATTAA-3’;
B-LB:5’-GCTATCTATGTCTATATAGCTAT-3’;
所述的C组包括引物C-F3、C-B3、C-FIP-W、C-FIP-M、C-BIP、C-LF和C-LB:
C-F3:5’-CTATGTCTATATAGCTATTTTTTTT-3’;
C-B3:5’-TGATTGTTTTACATTAACCTTTCA-3’;
C-FIP-W:5’-GCTGGCAGACTTACTCCTTAATTTTATTTTCCTTACAGGGTTVC-3’;
C-FIP-M:5’-GCTGGCAGACTTACTCCTTAATTTTATTTTCCTTACAGGGTTVT-3’;
C-BIP:5’-ATGAAAGTGAATCTTACTTTTGTAAATTAACATCTGAACTTTTTAAATGTT-3’;
C-LF:5’-GCACCTTCCTTCTTTTTGATTT-3’;
C-LB:5’-GGTTTGTGGAAAACAAATGTTTT-3’;
所述的D组包括引物D-F3、D-B3、D-FIP、D-BIP-W、D-BIP-M、D-LF和D-LB:
D-F3:5’-AGTACATTAAAAGACTATCAACTT-3’;
D-B3:5’-ACTCCTTAATTTAAGGAATGTGA-3’;
D-FIP:5’-ATATAGATAGCTTTATATGGATGTTATTTCTGATCATATTTTGTTGAATAA-3’;
D-BIP-W:5’-GCTATCTATGTCTATATAGCTATTTTTCCTTCTTTTTGATTTTGTCVG-3’;
D-BIP-M:5’-GCTATCTATGTCTATATAGCTATTTTTCC...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈万金,闫亚平,王柠,张鑫,
申请(专利权)人:陕西师范大学,福建医科大学附属第一医院,
类型:发明
国别省市:陕西;61
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