用于候选药物药物不良反应预测的作用机理推导制造技术

实施例包括用于生成作用机理假说的方法、系统和计算机程序产品。各方面包括接收候选药物数据以及与候选药物数据相关联的多个预测的药物不良反应(ADR)。各方面包括接收候选药物的药物通路数据和该多个预测的药物不良反应中的每一个的药物不良反应通路数据。各方面包括构建通路网络，其中通路网络包括多个药物通路节点、多个ADR通路节点和多个通路连接。各方面还包括生成通路输出。

Derivation of mechanism of action for prediction of adverse drug reactions of candidate drugs

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于候选药物药物不良反应预测的作用机理推导
本专利技术总体上涉及药物不良反应预测，更具体地，涉及用于候选药物-药物不良反应的预测的作用机理假说推导。
技术介绍
药物不良反应(ADR)是由药物的正常使用引起的非预期的和潜在有害的反应。ADR代表全世界的重要公共健康问题。预测ADR对于安全药物开发和精确药物治疗是非常有价值和重要的。已经开发了机器学习模型以帮助开发和评估候选药物，例如帮助预测药物不良反应ADR。尽管一些机器学习模型可以有效地预测ADR，但是这样的模型可能缺乏生物学解释，并且输出可能难以从生物学角度解释。例如，机器学习模型的输出可以包括潜在ADR的识别和表示与ADR相关联的统计可能性的数值。因此，在本领域中需要解决上述问题。
技术实现思路
从第一方面来看，本专利技术提供了一种用于生成针对药物不良反应的作用机理假说的计算机实现的方法，该方法包括：由处理器接收识别候选药物的候选药物数据以及与候选药物数据相关联的多个预测的药物不良反应；由处理器接收候选药物的药物通路数据；由处理器接收针对该多个预测的药物不良反应中本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于生成针对药物不良反应的作用机理假说的计算机实现的方法，所述方法包括：/n由处理器接收识别候选药物的候选药物数据以及与所述候选药物数据相关联的多个预测的药物不良反应；/n由所述处理器接收候选药物的药物通路数据；/n由所述处理器接收针对所述多个预测的药物不良反应中的每一个的药物不良反应通路数据；/n由所述处理器构建通路网络，其中所述通路网络包括多个药物通路节点、多个药物不良反应通路节点和多个通路连接；以及/n生成通路输出。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170926 US 15/715,548;20171102 US 15/801,7141.一种用于生成针对药物不良反应的作用机理假说的计算机实现的方法，所述方法包括：
由处理器接收识别候选药物的候选药物数据以及与所述候选药物数据相关联的多个预测的药物不良反应；
由所述处理器接收候选药物的药物通路数据；
由所述处理器接收针对所述多个预测的药物不良反应中的每一个的药物不良反应通路数据；
由所述处理器构建通路网络，其中所述通路网络包括多个药物通路节点、多个药物不良反应通路节点和多个通路连接；以及
生成通路输出。


2.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，其中所述通路输出包括用于所述通路连接的可视化输出。


3.根据权利要求2所述的计算机实现的方法，其中，所述可视化输出可视地描绘所述通路连接中的每个通路连接的统计显著性。


4.根据前述权利要求中的任一项所述的计算机实现的方法，还包括动态通路输出，所述动态通路输出包括用于药物通路节点与药物不良反应节点之间的连接之一的基因的列表。


5.根据前述权利要求中任一项所述的计算机实现的方法，其中，构建所述通路网络包括：
识别所述药物的药物通路与所述药物不良反应的药物不良反应通路之间的通路连接，并对所述通路连接进行统计分析。


6.根据权利要求5所述的计算机实现的方法，其中统计分析所述通路连接包括将Jaccard指数应用于所述通路连接。


7.根据前述权利要求中任一项所述的计算机实现的方法，还包括将机器学习模型应用于所述候选药物以生成所述多个预测的药物不良反应。


8.一种用于生成针对药物不良反应的作用机理假说的处理系统，包括：
与一种或多种类型的存储器通信的处理器，所述处理器被配置为：
接收候选药物数据，所述候选药物数据识别候选药物以及与所述候选药物数据相关联的多个预测的药物不良反应；
接收所述候选药物的药物通路数据；
接收针对所述多个预测的药物不良反应中的每一个的药物不良反应通路数据；
构建通路网络，所述通路网络包括多个药物通路节点、多个药物不良反应通路节点和多个通路连接；以及
生成通路输出。


9.根据权利要求8所述的处理系统，其中所述通路输出包括用于所述通路连接的可视化输出。


10.如权利要求9所述的处理系统，其中所述可视化输出可视地描绘所述通路连接中的每个通路连接的统计显著性。


11.如权利要求8至10中任一项所述的处理系统，其中构建所述通路网络包括识别所述药物的药物通路与所述药物不良反应的药物不良反应通路之间的通路连接，并统计分...

【专利技术属性】
技术研发人员：J·维尔玛，罗衡，胡建英，张平，
申请(专利权)人：国际商业机器公司，
类型：发明
国别省市：美国;US