【技术实现步骤摘要】
一种细菌的检测方法
本专利技术属于检测领域,具体涉及一种细菌的检测方法。
技术介绍
病原细菌是病原微生物的一种,存在于食品、水和环境中的病原细菌能够引起多种疾病的爆发,它能够引起细菌的感染并导致许多严重并发症。例如一些常见的致病菌:沙门氏菌(食物中毒),幽门螺杆菌(胃炎和肝炎),淋病奈瑟菌(性传播疾病),奈瑟菌(脑膜炎),金黄色葡萄球菌(烧伤,蜂窝织炎,脓肿,伤口感染,毒物综合征,肺炎和食物中毒)和链球菌属(肺炎、脑膜炎、耳部感染和咽炎)等。每年有超过3亿例由细菌感染引起的严重的甚至致命的疾病,死亡人数超过200万人,特别是随着细菌耐药性的增强,抗生素耐药性已经成为一个威胁全球健康的问题,到2050年估计除非采取行动,否则AMR导致死亡的人数每年可以增加到1000万人,到2050年对全球经济产生的累计成本达100万亿美元。在此基础上,到2050年,死亡人数惊人的达到每三秒钟就会有一个人死亡,人均治疗费用会达到一万美元。传统的细菌检测方法包括微生物培养法、免疫学方法、分子生物学方法等。细菌培养方法是临床细菌检测的标准方 ...
【技术保护点】
1.一种细菌的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:/n(1)构建标准液滴条形码文库/n(1.1)荧光素修饰ssDNA2/n将荧光素与ssDNA2混合,得到荧光素修饰的ssDNA2;/n(1.2)构建细菌特异性响应的探针/n将荧光素修饰的ssDNA2与对荧光基团起猝灭作用的材料混合,调节pH,然后静置、离心,得到细菌特异性响应的探针,然后测定探针的浓度,构建标准液滴条形码文库;/n(2)制备标准文库溶液/n将细菌特异性响应的探针与反应混合物封装在液滴中,制备标准文库溶液;其中,所述反应混合物包括双链DNA以及EXOIII;/n(3)检测细菌/n将待测菌液与步骤(2)制备的标准 ...
【技术特征摘要】
1.一种细菌的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)构建标准液滴条形码文库
(1.1)荧光素修饰ssDNA2
将荧光素与ssDNA2混合,得到荧光素修饰的ssDNA2;
(1.2)构建细菌特异性响应的探针
将荧光素修饰的ssDNA2与对荧光基团起猝灭作用的材料混合,调节pH,然后静置、离心,得到细菌特异性响应的探针,然后测定探针的浓度,构建标准液滴条形码文库;
(2)制备标准文库溶液
将细菌特异性响应的探针与反应混合物封装在液滴中,制备标准文库溶液;其中,所述反应混合物包括双链DNA以及EXOIII;
(3)检测细菌
将待测菌液与步骤(2)制备的标准文库溶液封装在液滴中,进行孵化反应,将荧光强度与标准液滴条形码文库进行比对,确定细菌种类。
2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(1.1)中,所述荧光素选自AMCA、FAM、TexasRed中的一种;和/或,所述ssDNA2的基因序列选自SEQIDNO.1-9之任意一种或几种。
3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(1.2)中,所述pH用柠檬酸盐、磷酸盐、醋酸盐中的一种或多种进行调节;和/或,所述pH=3-4;和/或,所述对荧光基团起猝灭作用的材料选自金球AuNPs、碳纳米管、石墨烯二维材料中的一种或多种;和/或,所述ssDNA2与所述对荧光基团起猝灭作用的材料的摩尔比为(100-150):1;和/或,所述静置的时间为12-18min;和/或,所述离心机的转速为9000-12000r。
4.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(2)中,所述细菌特异性响应的探针与反应混合物的体积比为(80-120):50;和/或,所述双链DNA和EXOIII的体积比为(25-35):(1-5)。
5.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述双链DNA的制备过程为:将细菌特异性响应的aptamer和与其互补的ssDNA1混合,然后置于水浴锅中加热至90-98℃,得到双链DNA。
6.根据权利要求5所述方法,其特征在于,所述ssDNA1的基因序列选自SEQIDNO.10-18之任...
【专利技术属性】
技术研发人员:李丽,邹奎,肖明书,裴昊,
申请(专利权)人:华东师范大学,
类型:发明
国别省市:上海;31
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