一种细菌的检测方法技术

技术编号:24076404 阅读:57 留言:0更新日期:2020-05-09 02:52
本发明专利技术公开了一种细菌的检测方法,首先,用荧光素对ssDNA2进行荧光编码得到细菌特异性响应的探针,通过测定探针的浓度构建一个标准的液滴条形码文库,然后将细菌特异性响应的探针和双链DNA以及EXOIII封装在液滴中用于制备标准文库溶液,最后将待测菌液和标准文库溶液混合,然后封装于液滴中,孵化反应,此时溶液中的探针在核酸机器人的酶切信号循环放大作用下逐步释放荧光素到溶液中,使得溶液的荧光强度增强,通过测定液滴中的荧光强度并与标准液滴条形码文库进行比对分析,可以快速鉴别不同种类的细菌。该检测方法具有特异性好,灵敏度高以及高通量检测等优点,在灵敏度、准确度、检测时间上都优于传统检测方法;同时本发明专利技术检测方法为细菌快速诊断试剂盒的研发奠定了基础。

A detection method of bacteria

【技术实现步骤摘要】
一种细菌的检测方法
本专利技术属于检测领域,具体涉及一种细菌的检测方法。
技术介绍
病原细菌是病原微生物的一种,存在于食品、水和环境中的病原细菌能够引起多种疾病的爆发,它能够引起细菌的感染并导致许多严重并发症。例如一些常见的致病菌:沙门氏菌(食物中毒),幽门螺杆菌(胃炎和肝炎),淋病奈瑟菌(性传播疾病),奈瑟菌(脑膜炎),金黄色葡萄球菌(烧伤,蜂窝织炎,脓肿,伤口感染,毒物综合征,肺炎和食物中毒)和链球菌属(肺炎、脑膜炎、耳部感染和咽炎)等。每年有超过3亿例由细菌感染引起的严重的甚至致命的疾病,死亡人数超过200万人,特别是随着细菌耐药性的增强,抗生素耐药性已经成为一个威胁全球健康的问题,到2050年估计除非采取行动,否则AMR导致死亡的人数每年可以增加到1000万人,到2050年对全球经济产生的累计成本达100万亿美元。在此基础上,到2050年,死亡人数惊人的达到每三秒钟就会有一个人死亡,人均治疗费用会达到一万美元。传统的细菌检测方法包括微生物培养法、免疫学方法、分子生物学方法等。细菌培养方法是临床细菌检测的标准方法,但是检测过程繁琐本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种细菌的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:/n(1)构建标准液滴条形码文库/n(1.1)荧光素修饰ssDNA2/n将荧光素与ssDNA2混合,得到荧光素修饰的ssDNA2;/n(1.2)构建细菌特异性响应的探针/n将荧光素修饰的ssDNA2与对荧光基团起猝灭作用的材料混合,调节pH,然后静置、离心,得到细菌特异性响应的探针,然后测定探针的浓度,构建标准液滴条形码文库;/n(2)制备标准文库溶液/n将细菌特异性响应的探针与反应混合物封装在液滴中,制备标准文库溶液;其中,所述反应混合物包括双链DNA以及EXOIII;/n(3)检测细菌/n将待测菌液与步骤(2)制备的标准文库溶液封装在液滴中...

【技术特征摘要】
1.一种细菌的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)构建标准液滴条形码文库
(1.1)荧光素修饰ssDNA2
将荧光素与ssDNA2混合,得到荧光素修饰的ssDNA2;
(1.2)构建细菌特异性响应的探针
将荧光素修饰的ssDNA2与对荧光基团起猝灭作用的材料混合,调节pH,然后静置、离心,得到细菌特异性响应的探针,然后测定探针的浓度,构建标准液滴条形码文库;
(2)制备标准文库溶液
将细菌特异性响应的探针与反应混合物封装在液滴中,制备标准文库溶液;其中,所述反应混合物包括双链DNA以及EXOIII;
(3)检测细菌
将待测菌液与步骤(2)制备的标准文库溶液封装在液滴中,进行孵化反应,将荧光强度与标准液滴条形码文库进行比对,确定细菌种类。


2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(1.1)中,所述荧光素选自AMCA、FAM、TexasRed中的一种;和/或,所述ssDNA2的基因序列选自SEQIDNO.1-9之任意一种或几种。


3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(1.2)中,所述pH用柠檬酸盐、磷酸盐、醋酸盐中的一种或多种进行调节;和/或,所述pH=3-4;和/或,所述对荧光基团起猝灭作用的材料选自金球AuNPs、碳纳米管、石墨烯二维材料中的一种或多种;和/或,所述ssDNA2与所述对荧光基团起猝灭作用的材料的摩尔比为(100-150):1;和/或,所述静置的时间为12-18min;和/或,所述离心机的转速为9000-12000r。


4.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤(2)中,所述细菌特异性响应的探针与反应混合物的体积比为(80-120):50;和/或,所述双链DNA和EXOIII的体积比为(25-35):(1-5)。


5.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述双链DNA的制备过程为:将细菌特异性响应的aptamer和与其互补的ssDNA1混合,然后置于水浴锅中加热至90-98℃,得到双链DNA。


6.根据权利要求5所述方法,其特征在于,所述ssDNA1的基因序列选自SEQIDNO.10-18之任...

【专利技术属性】
技术研发人员:李丽邹奎肖明书裴昊
申请(专利权)人:华东师范大学
类型:发明
国别省市:上海;31

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