代谢组与其他组学联合分析方法及装置制造方法及图纸

本发明专利技术实施例提供一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置，方法包括：对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系；将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选；对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，根据每个所述数据对的限制性对应分析结果，确定最终保留的数据对，根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。本发明专利技术实施例实现了代谢组与其他组学的联合分析，且分析结果更加精确。

The method and device of combined analysis of metabonomics and other histology

【技术实现步骤摘要】
代谢组与其他组学联合分析方法及装置
本专利技术属于生物信息分析
，尤其涉及一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置。
技术介绍
代谢组学是随着质谱技术和信息技术不断发展而兴起的一门组学研究，以生物体内的全套代谢产物为研究对象。代谢组在疾病诊断与防治、新药筛选与开发和生态学研究中起着关键作用。目前，转录组、蛋白组、代谢组、微生物组等各种组学的发展促进了对生物生理活动的理解，但是单一的组学研究难以阐释生物体复杂的生命活动。不同组学的研究展示了生物体在不同时空下的状态，要想获得生物整体的活动机理，就需要将各种组学进行整合。将多种组学进行联合分析，有利于系统地解释生物的内在机理，而如何将代谢组与其他组学数据进行有效整合并挖掘出关键的信息是亟待解决的问题。现有的多组学联合分析方法大多以相关性分析为主，但相关性分析对组学数据之间关联关系的分析并不精确。
技术实现思路
为克服上述现有的多组学联合分析方法分析结果不精确的问题或者至少部分地解决上述问题，本专利技术实施例提供一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置。根据本专利技术实施例的第一方面，提供一种代谢组与其他组学联合分析方法，包括：对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系；将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选；对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，根据每个所述数据对的限制性对应分析结果，确定最终保留的数据对，根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。具体地，对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系的步骤包括：基于omicade4软件将所述代谢组的数据和所述其他组学的数据投影到相同的维度空间；根据所述维度空间中代谢组的任一数据的坐标和任一其他组学的任一数据的坐标与原点的连线之间的夹角，确定所述代谢组的任一数据和任一所述其他组学中的任一数据之间的关联性；初步确定大于第一预设阈值的关联性对应的代谢组的数据和其他组学的数据之间存在关联关系。具体地，对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析的步骤具体包括：对所述代谢组的数据的表达量文件和所述其他组学的数据的表达量文件进行差异分析；对所述代谢组的数据的差异分析结果和所述其他组学的数据的差异分析结果进行多重协惯量分析。具体地，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选的步骤包括：基于spearman方法对每个所述数据对进行相关性分析，获取每个所述数据对的相关性系数和相关性P值，筛选出相关性系数大于第二预设阈值且相关系P值小于第三预设阈值的数据对。具体地，对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，根据每个所述数据对的限制性对应分析结果，确定最终保留的数据对的步骤包括：基于vegan软件对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，获取每个所述数据对的打分结果；其中，将所述数据对中代谢组的数据作为所述限制性对应分析的限制性条件；根据每个所述数据对的打分结果确定最终保留的数据对。具体地，所述其他组学包括转录组、蛋白组和微生物组中的一种或多种。具体地，根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系的步骤之后还包括：若具有转录组基因的生物产生的代谢物为预设代谢物，则根据最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系，获取与所述预设代谢物具有关联关系的其他组学的数据；若所述生物具有与所述预设代谢物具有关联关系的其他组学的数据，则确定所述转录组基因具有预设差异基因。根据本专利技术实施例第二方面提供一种代谢组与其他组学联合分析装置，包括：获取模块，用于对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系；筛选模块，用于将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选；确定模块，用于对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，根据每个所述数据对的限制性对应分析结果，确定最终保留的数据对，根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。根据本专利技术实施例的第三个方面，还提供一种电子设备，包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序，所述处理器调用所述程序指令能够执行第一方面的各种可能的实现方式中任一种可能的实现方式所提供的代谢组与其他组学联合分析方法。根据本专利技术实施例的第四个方面，还提供一种非暂态计算机可读存储介质，所述非暂态计算机可读存储介质存储计算机指令，所述计算机指令使所述计算机执行第一方面的各种可能的实现方式中任一种可能的实现方式所提供的代谢组与其他组学联合分析方法。本专利技术实施例提供一种代谢组与其他组学联合分析方法及装置，该方法通过在对代谢组和其他组学数据进行多重协惯量分析，初步确定代谢组与其他组学之间数据的关联关系之后，进一步对存在关联关系的代谢组数据和其他组学数据进行相关性分析，筛选出较为准确的分析结果，然后对筛选出的存在关联关系的数据进行深入的限制性对应分析，最终确定代谢组与其他组学之间数据的关联关系，从而实现了代谢组与其他组学的联合分析，且分析结果更加精确。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。图1为本专利技术实施例提供的代谢组与其他组学联合分析方法整体流程示意图；图2为本专利技术实施例提供的代谢组与其他组学联合分析装置整体结构示意图；图3为本专利技术实施例提供的电子设备整体结构示意图。具体实施方式为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。在本专利技术的一个实施例中提供一种代谢组与其他组学联合分析方法，图1为本专利技术实施例提供的代谢组与其他组学联合分析方法整体流程示意图，该方法包括：S101，对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种代谢组与其他组学联合分析方法，其特征在于，包括：/n对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系；/n将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选；/n对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，根据每个所述数据对的限制性对应分析结果，确定最终保留的数据对，根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。/n

【技术特征摘要】
1.一种代谢组与其他组学联合分析方法，其特征在于，包括：
对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系；
将存在关联关系的代谢组的数据和其他组学的数据作为一个数据对，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选；
对筛选出的每个所述数据对进行限制性对应分析，根据每个所述数据对的限制性对应分析结果，确定最终保留的数据对，根据最终保留的数据对最终确定所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系。


2.根据权利要求1所述的代谢组与其他组学联合分析方法，其特征在于，对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析，获取所述代谢组与所述其他组学之间数据的关联关系的步骤包括：
基于omicade4软件将所述代谢组的数据和所述其他组学的数据投影到相同的维度空间；
根据所述维度空间中代谢组的任一数据的坐标和任一其他组学的任一数据的坐标与原点的连线之间的夹角，确定所述代谢组的任一数据和任一所述其他组学中的任一数据之间的关联性；
初步确定大于第一预设阈值的关联性对应的代谢组的数据和其他组学的数据之间存在关联关系。


3.根据权利要求1所述的代谢组与其他组学联合分析方法，其特征在于，对代谢组的数据，以及除所述代谢组以外的一种或多种其他组学的数据进行多重协惯量分析的步骤具体包括：
对所述代谢组的数据的表达量文件和所述其他组学的数据的表达量文件进行差异分析；
对所述代谢组的数据的差异分析结果和所述其他组学的数据的差异分析结果进行多重协惯量分析。


4.根据权利要求1所述的代谢组与其他组学联合分析方法，其特征在于，对每个所述数据对进行相关性分析，根据每个所述数据对的相关性分析结果对所述数据对进行筛选的步骤包括：
基于spearman方法对每个所述数据对进行相关性分析，获取每个所述数据对的相关性系数和相关性P值，筛选出相关性系数大于第二预设阈值且相关系P值小于第三预设阈值的数据对。


5.根据权利要求1所述的代谢组与其他组学联合分析方法，其特征在于，对筛...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑洪坤，秦刚，张蕾，梁若冰，
申请(专利权)人：北京百迈客生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：北京;11