鱼病原体检测方法技术

本发明专利技术涉及一种检测鱼病原体的方法。此外，本发明专利技术并涉及用于检测鱼病原体的寡核苷酸对。

Detection method of Chlamydia

【技术实现步骤摘要】
鱼病原体检测方法
本专利技术关于检测鱼病原体的方法，特别是关于使用寡核苷酸对检测鱼病原体的方法。
技术介绍
水产动物是人类重要的能量、蛋白质与必需营养的来源之一。大量捕捞野生水产动物对海洋资源耗尽的疑虑，使得水产养殖业日益受到重视。根据联合国粮食及农业组织的统计，水产养殖对全球捕捞及养殖总产量的贡献逐步提升，从2000年的25.7％增至2016年的46.8％。然而，密集养殖加上管理不良可能造成水产动物容易感染疾病、死亡，而造成渔民的损失。此外，水产动物的病害多由细菌或病毒引起，细菌性疾病与病毒性疾病的处理方法相差甚远，一旦误诊，处理不当，就会造成巨大的损失。由此可见，在饲养渔场、虾场密集监控疾病对管理而言是不可或缺的一环。本专利技术即提供了快速、方便的鱼病原体检测方法以供产业利用。
技术实现思路
于一方面，本专利技术涉及一种鱼病原体检测方法，包含提供一可能含有一鱼病原体的一或多个核苷酸序列的样本；提供一寡核苷酸引物对，所述寡核苷酸引物对包含一第一引物与一第二引物，所述寡核苷酸引物对定义在所述病原体的一或多个核苷酸序列上一双股目标序列的二互补股的5’端；提供一聚合酶；在一容器中混合所述样本、所述寡核苷酸引物对、所述聚合酶、脱氧腺苷三磷酸(deoxyadenosinetriphosphates,dATPs)、脱氧胞核苷三磷酸(deoxycytidinetriphosphates,dCTPs)、脱氧鸟苷三磷酸(deoxyguanosinetriphosphates,dGTPs)，以及脱氧胸苷三磷酸(deoxythymidinetriphosphates,dTTPs)，以形成一聚合酶链锁反应(polymerasechainreaction,PCR)混合物；透过在一固定温度下加热所述容器的底部，使所述PCR混合物进行热对流聚合酶链锁反应(convectivepolymerasechainreaction,cPCR)，以形成一PCR产物；以及侦测所述PCR产物以辨识所述双股目标序列。在某些实施方案中，所述聚合酶链锁反应(PCR)混合物进一步包含一寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针包含一与所述双股目标序列的一区段互补的寡核苷酸探针序列、一附加于所述寡核苷酸探针上的一第一位置的荧光分子，以及一附加于所述寡核苷酸探针上的一第二位置的荧光抑制分子，当所述寡核苷酸探针未杂合于所述双股目标序列的所述区段时，所述荧光抑制分子大体上抑制所述荧光分子，且当所述寡核苷酸探针杂合于所述双股目标序列的所述区段时，所述荧光分子大体上未被抑制。于另一方面，本专利技术涉及一种用于侦测鱼病原体的寡核苷酸对，包含一第一引物与一第二引物。在某些实施方案中，所述寡核苷酸对进一步包含一寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针具有一寡核苷酸探针序列、一附加于所述寡核苷酸探针上的一第一位置的荧光分子，以及一附加于所述寡核苷酸探针上的一第二位置的荧光抑制分子。在某些实施方案中，所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(Piscinereovirus,PRV)，且所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:1与SEQIDNO:2、SEQIDNO:4与SEQIDNO:2、SEQIDNO:4与SEQIDNO:5、SEQIDNO:6与SEQIDNO:7、SEQIDNO:9与SEQIDNO:10，以及SEQIDNO:11与SEQIDNO:12。在某些实施方案中，所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且当所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:1与SEQIDNO:2时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因(GenBankaccessionNo.KY429943)的第71至第95个核苷酸之间的13至25个碱基对的寡核苷酸；在某些较佳实施方案中，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:3所示。在某些实施方案中，所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且当所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:4与SEQIDNO:2时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因(GenBankaccessionNo.KY429943)的第52至第95个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；在某些较佳实施方案中，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:3所示。在某些实施方案中，所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且当所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:4与SEQIDNO:5时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因(GenBankaccessionNo.KY429943)的第52至第100个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；在某些较佳实施方案中，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:3所示。在某些实施方案中，所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且当所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:6与SEQIDNO:7时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的Sigma3蛋白基因(GenBankaccessionNo.KX844958)的第343至第385个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；在某些较佳实施方案中，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:8所示。在某些实施方案中，所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且当所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:9与SEQIDNO:10时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的Sigma3蛋白基因(GenBankaccessionNo.KX844958)的第350至第380个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；在某些较佳实施方案中，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:8所示。在某些实施方案中，所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且当所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:11与SEQIDNO:12时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因(GenBankaccessionNo.KY429943)的第280至第315个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；在某些较佳实施方案中，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:13所示。在某些实施方案中，所述病原体为感染性胰脏坏死病毒(Infectiouspancreaticnecrosisvirus,IPNV)，且所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:14与SEQIDNO:15、SEQIDNO:17与SEQIDNO:18、SEQIDNO:20与SEQIDNO:21，以及SEQIDNO:23与SEQIDNO:24。在某些实施方案中，所述病原体为感染性胰脏坏死病毒(IPNV)，且当所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:14与SEQIDNO:15时，所述本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于侦测鱼病原体的寡核苷酸对，包含一第一引物与一第二引物，所述病原体选自由下列所组成之群组：鱼呼吸道与肠道病毒(Piscine reovirus,PRV)、感染性胰脏坏死病毒(Infectious pancreatic necrosis virus,IPNV)、感染性鲑鱼贫血病毒(Infectious salmon anemia virus,ISAV)、鱼心肌炎病毒(Piscine myocarditis virus,PMCV)、鲑鱼甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)、佩鲁兰新副变形虫(Neoparamoebaperurans)、Candidatus Branchiomonas cysticola(CBc)、微孢子虫Desmozoonlepeophtherii(Des)、鲑鱼腮痘病毒(Salmon gill poxvirus,SGPV)、鲑鱼立克次体(Piscirickettsia salmonis)，以及鲑鱼肾菌(Renibacterium salmoninarum)；/n其中所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:1与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4与SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6与SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:9与SEQ ID NO:10，以及SEQ ID NO:11与SEQ ID NO:12；/n其中所述病原体为感染性胰脏坏死病毒(IPNV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:14与SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:17与SEQ IDNO:18、SEQ ID NO:20与SEQ ID NO:21，以及SEQ ID NO:23与SEQ ID NO:24；/n其中所述病原体为感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:26与SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:29与SEQ IDNO:30、SEQ ID NO:32与SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:35与SEQ ID NO:36，以及SEQ ID NO:37与SEQ ID NO:38；/n其中所述病原体为鱼心肌炎病毒(PMCV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:39与SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:42与SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:45与SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:48与SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:51与SEQ IDNO:49，以及SEQ ID NO:52与SEQ ID NO:49；/n其中所述病原体为鲑鱼甲病毒(SAV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:53与SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:56与SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:59与SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:62与SEQ ID NO:63，以及SEQ ID NO:65与SEQID NO:66；/n其中所述病原体为佩鲁兰新副变形虫(N.perurans)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:68与SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:71与SEQID NO:72、SEQ ID NO:74与SEQ ID NO:75，以及SEQ ID NO:77与SEQ ID NO:78；/n其中所述病原体为Ca.B.cysticola时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:80与SEQ ID NO:81，以及SEQ ID NO:83与SEQ ID NO:84；/n其中所述病原体为微孢子虫D.lepeophtherii时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:86与SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89与SEQ IDNO:90、SEQ ID NO:92与SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:95与SEQ ID NO:97，以及SEQ ID NO:96与SEQ ID NO:97；/n其中所述病原体为鲑鱼腮痘病毒(SGPV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQ ID NO:99与SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:102与SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:105与SE...

【技术特征摘要】
20181005 US 62/741,6351.一种用于侦测鱼病原体的寡核苷酸对，包含一第一引物与一第二引物，所述病原体选自由下列所组成之群组：鱼呼吸道与肠道病毒(Piscinereovirus,PRV)、感染性胰脏坏死病毒(Infectiouspancreaticnecrosisvirus,IPNV)、感染性鲑鱼贫血病毒(Infectioussalmonanemiavirus,ISAV)、鱼心肌炎病毒(Piscinemyocarditisvirus,PMCV)、鲑鱼甲病毒(Salmonidalphavirus,SAV)、佩鲁兰新副变形虫(Neoparamoebaperurans)、CandidatusBranchiomonascysticola(CBc)、微孢子虫Desmozoonlepeophtherii(Des)、鲑鱼腮痘病毒(Salmongillpoxvirus,SGPV)、鲑鱼立克次体(Piscirickettsiasalmonis)，以及鲑鱼肾菌(Renibacteriumsalmoninarum)；
其中所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:1与SEQIDNO:2、SEQIDNO:4与SEQIDNO:2、SEQIDNO:4与SEQIDNO:5、SEQIDNO:6与SEQIDNO:7、SEQIDNO:9与SEQIDNO:10，以及SEQIDNO:11与SEQIDNO:12；
其中所述病原体为感染性胰脏坏死病毒(IPNV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:14与SEQIDNO:15、SEQIDNO:17与SEQIDNO:18、SEQIDNO:20与SEQIDNO:21，以及SEQIDNO:23与SEQIDNO:24；
其中所述病原体为感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:26与SEQIDNO:27、SEQIDNO:29与SEQIDNO:30、SEQIDNO:32与SEQIDNO:33、SEQIDNO:35与SEQIDNO:36，以及SEQIDNO:37与SEQIDNO:38；
其中所述病原体为鱼心肌炎病毒(PMCV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:39与SEQIDNO:40、SEQIDNO:42与SEQIDNO:43、SEQIDNO:45与SEQIDNO:46、SEQIDNO:48与SEQIDNO:49、SEQIDNO:51与SEQIDNO:49，以及SEQIDNO:52与SEQIDNO:49；
其中所述病原体为鲑鱼甲病毒(SAV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:53与SEQIDNO:54、SEQIDNO:56与SEQIDNO:57、SEQIDNO:59与SEQIDNO:60、SEQIDNO:62与SEQIDNO:63，以及SEQIDNO:65与SEQIDNO:66；
其中所述病原体为佩鲁兰新副变形虫(N.perurans)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:68与SEQIDNO:69、SEQIDNO:71与SEQIDNO:72、SEQIDNO:74与SEQIDNO:75，以及SEQIDNO:77与SEQIDNO:78；
其中所述病原体为Ca.B.cysticola时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:80与SEQIDNO:81，以及SEQIDNO:83与SEQIDNO:84；
其中所述病原体为微孢子虫D.lepeophtherii时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:86与SEQIDNO:87、SEQIDNO:89与SEQIDNO:90、SEQIDNO:92与SEQIDNO:93、SEQIDNO:95与SEQIDNO:97，以及SEQIDNO:96与SEQIDNO:97；
其中所述病原体为鲑鱼腮痘病毒(SGPV)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:99与SEQIDNO:100、SEQIDNO:102与SEQIDNO:103、SEQIDNO:105与SEQIDNO:106，以及SEQIDNO:108与SEQIDNO:109；
其中所述病原体为鲑鱼立克次体(P.salmonis)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:111与SEQIDNO:113、SEQIDNO:114与SEQIDNO:115、SEQIDNO:116与SEQIDNO:117、SEQIDNO:119与SEQIDNO:120，以及SEQIDNO:122与SEQIDNO:123；以及
其中所述病原体为鲑鱼肾菌(R.salmoninarum)时，所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:126与SEQIDNO:128、SEQIDNO:127与SEQIDNO:128、SEQIDNO:130与SEQIDNO:131、SEQIDNO:133与SEQIDNO:134，以及SEQIDNO:136与SEQIDNO:137。


2.如权利要求1所述的寡核苷酸对，进一步包含一寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针具有一寡核苷酸探针序列、一附加于所述寡核苷酸探针上的一第一位置的荧光分子，以及一附加于所述寡核苷酸探针上的一第二位置的荧光抑制分子。


3.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:1与SEQIDNO:2时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因的第71至第95个核苷酸之间的13至25个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:4与SEQIDNO:2时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因的第52至第95个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:4与SEQIDNO:5时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因的第52至第100个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:6与SEQIDNO:7时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的Sigma3蛋白基因的第343至第385个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:9与SEQIDNO:10时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的Sigma3蛋白基因的第350至第380个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:11与SEQIDNO:12时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)的L1区段基因的第280至第315个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸。


4.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为鱼呼吸道与肠道病毒(PRV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:1与SEQIDNO:2、SEQIDNO:4与SEQIDNO:2，以及SEQIDNO:4与SEQIDNO:5时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:3所示；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:6与SEQIDNO:7，以及SEQIDNO:9与SEQIDNO:10时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:8所示；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:11与SEQIDNO:12时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:13所示。


5.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为感染性胰脏坏死病毒(IPNV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:14与SEQIDNO:15时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性胰脏坏死病毒(IPNV)的VP5与多聚蛋白(polyprotein)基因的第2010至第2057个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:17与SEQIDNO:18时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性胰脏坏死病毒(IPNV)的VP5与多聚蛋白(polyprotein)基因的第2345至第2408个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:20与SEQIDNO:21时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性胰脏坏死病毒(IPNV)的VP5与多聚蛋白(polyprotein)基因的第2533至第2580个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:23与SEQIDNO:24时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性胰脏坏死病毒(IPNV)的VP5与多聚蛋白(polyprotein)基因的第2775至第2818个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸。


6.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为感染性胰脏坏死病毒(IPNV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:14与SEQIDNO:15时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:16所示；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:17与SEQIDNO:18时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:19所示；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:20与SEQIDNO:21时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:22所示；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:23与SEQIDNO:24时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:25所示。


7.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:26与SEQIDNO:27时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)的开放读码框(Openreadingframe,ORF)1与ORF2基因的第282至第328个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:29与SEQIDNO:30时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)的ORF1与ORF2基因的第79至第121个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:32与SEQIDNO:33时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)的ORF1与ORF2基因的第244至第273个核苷酸之间的13至30个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:35与SEQIDNO:36时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)的ORF1与ORF2基因的第237至第272个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:37与SEQIDNO:38时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)的ORF1与ORF2基因的第235至第286个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸。


8.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为感染性鲑鱼贫血病毒(ISAV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:26与SEQIDNO:27时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:28所示；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:29与SEQIDNO:30时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:31所示；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:32与SEQIDNO:33、SEQIDNO:35与SEQIDNO:36，以及SEQIDNO:37与SEQIDNO:38时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:34所示。


9.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为鱼心肌炎病毒(PMCV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:39与SEQIDNO:40时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼心肌炎病毒(PMCV)的基因组的第6266至第6306个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:42与SEQIDNO:43时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼心肌炎病毒(PMCV)的基因组的第5632至第5672个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:45与SEQIDNO:46时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼心肌炎病毒(PMCV)的基因组的第5693至第5747个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:48与SEQIDNO:49时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼心肌炎病毒(PMCV)的基因组的第6294至第6331个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:51与SEQIDNO:49时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼心肌炎病毒(PMCV)的基因组的第6271至第6331个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:52与SEQIDNO:49时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鱼心肌炎病毒(PMCV)的基因组的第6290至第6331个核苷酸之间的13至35个碱基对的寡核苷酸。


10.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为鱼心肌炎病毒(PMCV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:39与SEQIDNO:40时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:41所示；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:42与SEQIDNO:43时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:44所示；
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:45与SEQIDNO:46时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:47所示；以及
所述第一引物与所述第二引物的序列组合选自由下列所组成之群组：SEQIDNO:48与SEQIDNO:49、SEQIDNO:51与SEQIDNO:49，以及SEQIDNO:52与SEQIDNO:49时，所述寡核苷酸探针序列如SEQIDNO:50所示。


11.如权利要求2所述的寡核苷酸对，其中所述病原体为鲑鱼甲病毒(SAV)，且
所述第一引物与所述第二引物的序列组合为SEQIDNO:53与SEQIDNO:54时，所述寡核苷酸探针序列为一介于所述病原体鲑鱼甲病毒(SAV)的基因组的第611至第...

【专利技术属性】
技术研发人员：郭村勇，谢旺儒，陈台安，陈子翔，谢凯如，萧志奇，
申请(专利权)人：福又达生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：中国台湾;71