肠杆菌科作为缺血性脑卒中生物标志物的用途制造技术

本发明专利技术涉及生物标志物领域，特别是涉及肠杆菌科作为缺血性脑卒中生物标志物的用途。本发明专利技术发明专利技术人发现，肠杆菌科可以作为一个新的生物标记物来评估卒中的风险、诊断卒中的种类、评估卒中的预后等，包括早期恢复结局和远期功能结局是有十分意义的，从而可以被开发为精准医学中的新型生物标志物。

The use of Enterobacteriaceae as biomarker of ischemic stroke

【技术实现步骤摘要】
肠杆菌科作为缺血性脑卒中生物标志物的用途
本专利技术涉及生物标志物领域，特别是涉及肠杆菌科作为缺血性脑卒中生物标志物的用途。
技术介绍
识别脑卒中不良结局的风险对于临床管理非常重要，但并非所有患者都能通过以往的标准化治疗获得满意的恢复。而对于医生和患者来说，识别具有较高不良EI风险的患者对于医生调整治疗计划或开发新的治疗方法是十分重要的。
技术实现思路
鉴于以上所述现有技术的缺点，本专利技术的目的在于提供肠杆菌科(Enterobacteriaceae)作为缺血性脑卒中生物标志物的用途，用于解决现有技术中的问题。为实现上述目的及其他相关目的，本专利技术一方面提供用于检测肠杆菌科的物质在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估缺血性脑卒中的治疗效果和/或判断缺血性脑卒中的预后。在本专利技术一些实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测粪便样品中的肠杆菌科的物质。在本专利技术一些实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测肠道中的肠杆菌科的物质。在本专利技术一些实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测肠杆菌科富集程度的物质。在本专利技术一些实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质为检测细菌16SrRNA的物质。在本专利技术一些实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测大肠肠道中的肠杆菌科的物质。在本专利技术一些实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质为检测细菌16SrRNAV4区的物质。在本专利技术一些实施方式中，所述试剂盒是根据样品中肠杆菌科的富集程度，评估缺血性脑卒中的治疗效果和/或判断缺血性脑卒中的预后。在本专利技术一些实施方式中，所述样品为粪便样品。在本专利技术一些实施方式中，所述缺血性脑卒中为NIHSS≥4。在本专利技术一些实施方式中，所述缺血性脑卒中选自完全性卒中。在本专利技术一些实施方式中，所述缺血性脑卒中为急性期。在本专利技术一些实施方式中，所述评估缺血性脑卒中的治疗效果和/或判断缺血性脑卒中的预后具体指评估缺血性脑卒中患者的早期恢复结局和/或远期功能结局。本专利技术另一方面提供用于检测肠杆菌科的物质在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估对象是否易发预后性较差的缺血性脑卒中。本专利技术另一方面提供用于检测肠杆菌科的物质在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于诊断缺血性脑卒中。附图说明图1显示为本专利技术在建模队列中EI与不良EI亚组的菌群的比较。(A)PCoA图显示，EI组与不良EI组之间的细菌群落存在显著差异。(B)EI和不良EI患者的科，门和属的主要细菌类群的平均相对丰度。(C)LEfSe确定了两组之间差异最大的分类群。只有肠杆菌科和肠杆菌类群的LDA有效阈值>4。(D)箱形图显示与EI组相比，不良EI组中肠杆菌科的丰度。PC，主要坐标分析(PCoA)。EI，EI患者(n＝15)；不良EI，无EI的患者(n＝21)。图2显示为本专利技术在验证队列中比较EI的微生物群落和不良EI亚群的示意图，其中，(A)PCoA图显示在验证队列中EI组和不良EI组之间的细菌群落没有显着差异；(B)EI和不良EI患者在科水平的主要细菌类群的平均相对丰度；(C)LEfSe识别两组之间差异最大的分类群。只有γ-变形菌门，肠杆菌科，肠杆菌目，变形菌门分类群符合LDA有效阈值>4；(D)箱形图显示与EI组相比，不良EI组中肠杆菌科的丰度。PC，主要坐标分析(PCoA)。EI，EI患者(n＝37)；不良EI，无EI的患者(n＝51)。图3显示为本专利技术不良EI结局的预测性能示意图，其中，(A)该模型(肠杆菌科+空腹血糖)对不良EI结局的预测性能在建模队列中为78.8％(曲线下面积[AUC]估计为78.8％)，而肠杆菌科对不良EI的预测性能具有相似的效率(AUC估计，76.9％)；(B)验证队列中，不良EI结局的肠杆菌科的曲线下面积为70.2％，而肠杆菌科加空腹血糖的预测模型为73.3％。图4显示为本专利技术预测90天最佳结局和良好结局的模型示意图，其中，(A)在预测90天最佳结局和良好结局的模型中加入不良EI结局显著增加了它们的预测性能；(B)加入不良EI结局能增加90天最佳结局和良好结局(C)肠杆菌科的加入也增加了整个患者队列(合并建模及验证队列)中90天最佳结局和良好结局的预测性能。具体实施方式本专利技术专利技术人经过大量研究发现，肠杆菌科与缺血性脑卒中的诊断、治疗效果和/或判断缺血性脑卒中的预后有着密切关系，在此基础上完成了本专利技术。本专利技术第一方面提供用于检测肠杆菌科的物质在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估缺血性脑卒中的治疗效果和/或判断缺血性脑卒中的预后。所述缺血性脑卒中是指由于脑的供血动脉闭塞供血不足导致的脑组织坏死的总称，血管闭塞原因可以是脑栓塞、脑血栓形成等。脑卒中主要包括出血性脑卒中和缺血性脑卒中。其中，缺血性脑卒中占卒中的60-70％。缺血性脑卒中主要包括：短暂性脑缺血发作(TIA)；完全性卒中(CS)。在本专利技术一具体实施方式中，优选针对完全性卒中。在本专利技术另一具体实施方式中，所述缺血性脑卒中为中重度卒中患者(NIHSS评分≥4，NIHSS(美国国立卫生研究院卒中量表，NationalInstituteofHealthstrokescale)的评分方法可以参见WilliamsLS,YilmazEY,Lopez-YunezAM.RetrospectiveAssessmentofInitialStrokeSeveritywithTheNIHStrokeScale.Stroke.2000；31:858–862)。在本专利技术另一具体实施方式中，所述缺血性脑卒中为急性期，所述急性期通常指起病7天以内。本专利技术中，所述用于检测肠杆菌科的物质可以是本领域各种适用于检测肠杆菌科的检测产品，例如，可以是PCR试剂盒、FISH试剂盒等，所述检测产品针对的对象可以是粪便样品，从而可以较好地反映大肠肠道菌群，还可以是检测细菌的16SrRNA，优选可以为检测细菌的16SrRNAV4区，从而获取样品中肠杆菌科的信息。在本专利技术一具体实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质可以为用于检测粪便样品中的肠杆菌科的物质。在本专利技术另一具体实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质可以为用于检测肠道中的肠杆菌科的物质，优选为大肠肠道，待检测的样品通常是反应出患者肠道中肠杆菌科的情况。在本专利技术另一具体实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质可以为用于检测肠杆菌科富集程度的物质，所述富集程度可以是一定量的样品中(例如，单位体积、单位质量等)肠杆菌科的含量、在菌群中所占的百分比等。在本专利技术另一具体实施方式中，所述用于检测肠杆菌科的物质和/或试剂盒的使用方法可以包括如下步骤：获取样品中肠道菌群总DNA，扩增细菌16SrRNAV4区基因特征标签序列，根据扩增结果获取样品中肠杆菌科的富集信息，对于菌的种类的划分，可以采用OTU(OperationalTaxonomicUnits，分类操作单元)方法。本专利技术中，所述试剂盒是根据样品本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于检测肠杆菌科的物质在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估缺血性脑卒中的治疗效果和/或判断缺血性脑卒中的预后。/n

【技术特征摘要】
1.用于检测肠杆菌科的物质在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于评估缺血性脑卒中的治疗效果和/或判断缺血性脑卒中的预后。


2.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测粪便样品中的肠杆菌科的物质；
和/或，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测肠道中的肠杆菌科的物质；
和/或，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测肠杆菌科富集程度的物质；
和/或，所述用于检测肠杆菌科的物质为检测细菌16SrRNA的物质。


3.如权利要求2所述的用途，其特征在于，所述用于检测肠杆菌科的物质为用于检测大肠肠道中的肠杆菌科的物质；
和/或，所述用于检测肠杆菌科的物质为检测细菌16SrRNAV4区的物质。


4.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述试剂盒是根据样品中肠杆菌科的富集程度，评...

【专利技术属性】
技术研发人员：周宏伟，尹恝，夏耿红，高徐璇，曾秀丽，朱佳佳，何彦，游超，徐开宇，谭楚红，徐若霆，吴齐恒，陈琼，
申请(专利权)人：南方医科大学珠江医院，南方医科大学南方医院，
类型：发明
国别省市：广东;44