【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于鉴定或监测肺病的方法和系统交叉引用本申请要求于2017年6月2日提交的美国临时申请62/514,595和于2017年8月17日提交的美国临时申请62/546,936的优先权，每个申请均通过引用整体并入本文。
技术介绍
当前存在一些可用于检测肺部病况如肺癌的方法。这种当前的用于肺部病况的临床护理途径的缺点在于高比率的不必要的侵入性程序、无法检测早期肺部病况或者评估受试者发展肺部病况的风险。
技术实现思路
本公开内容提供了用于确定受试者是否患有肺部病况或者处于患有肺部病况的风险的方法和系统，所述肺部病况例如肺癌。本公开内容的方法可以允许在一些情况下使用从受试者非侵入性地获得的样品(例如，鼻组织样品)，针对肺部病况的进展或消退对受试者进行筛查或监测。这可以有利地用于筛查对肺部病况无症状但可能在其他方面有发展肺部病况的风险的受试者(例如，暴露于香烟烟雾或空气污染的受试者)，或者监测患有或疑似患有肺部病况的受试者。本公开内容的一方面提供了用于筛查受试者的肺部病况的方法，所述方法包括(a)测定来自从受试者获得的第一样品...
【技术保护点】
1.一种用于筛查受试者的肺部病况的方法，其包括：/n(a)测定来自从受试者获得的第一样品的上皮组织，该上皮组织被(1)计算机分析发展所述肺部病况的一种或多种风险因子的存在，和(2)鉴定所述一种或多种风险因子的所述存在，以鉴定所述第一样品中与发展所述肺部病况的风险相关联的一种或多种生物标志物的存在或不存在；以及/n(b)在鉴定所述一种或多种生物标志物的所述存在或不存在后，(i)指导获得所述受试者的肺部区域的电子成像扫描，所述肺部区域疑似表现出所述肺部病况，或者(ii)测定来自所述受试者的第二样品的其他上皮组织。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170602 US 62/514,595;20170817 US 62/546,9361.一种用于筛查受试者的肺部病况的方法，其包括：
(a)测定来自从受试者获得的第一样品的上皮组织，该上皮组织被(1)计算机分析发展所述肺部病况的一种或多种风险因子的存在，和(2)鉴定所述一种或多种风险因子的所述存在，以鉴定所述第一样品中与发展所述肺部病况的风险相关联的一种或多种生物标志物的存在或不存在；以及
(b)在鉴定所述一种或多种生物标志物的所述存在或不存在后，(i)指导获得所述受试者的肺部区域的电子成像扫描，所述肺部区域疑似表现出所述肺部病况，或者(ii)测定来自所述受试者的第二样品的其他上皮组织。
2.根据权利要求1所述的方法，进一步包括在(b)之前，接收测定包括所述受试者的所述上皮组织的所述第一样品的请求。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述电子成像扫描是低剂量计算机断层成像(LDCT)扫描或磁共振成像(MRI)。
4.根据权利要求3所述的方法，其中所述LDCT扫描向所述受试者提供小于约5毫西弗(mSv)的辐射暴露。
5.根据权利要求1所述的方法，其中所述肺部病况是肺癌、慢性阻塞性肺病(COPD)、间质性肺病(ILD)或其任何组合。
6.根据权利要求1所述的方法，其中所述肺部病况是肺癌，并且其中所述肺癌包括：非小细胞肺癌；腺癌；鳞状细胞癌；大细胞癌；小细胞肺癌；或其任何组合。
7.根据权利要求1所述的方法，其中通过支气管镜检查获得所述第一样品或所述第二样品。
8.根据权利要求1所述的方法，其中通过细针抽吸获得所述第一样品或所述第二样品。
9.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一样品或所述第二样品包括粘膜上皮组织、鼻上皮组织、肺上皮组织或其任何组合。
10.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一样品或所述第二样品包括沿所述受试者的气道获得的上皮组织。
11.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一样品或所述第二样品的一部分进行细胞学测试，所述细胞学测试鉴定所述第一样品或所述第二样品是模糊的或可疑的。
12.根据权利要求11所述的方法，其中在鉴定所述第一样品或所述第二样品是模糊的或可疑的之后，对所述样品的第二部分进行(b)，所述第二部分包括所述上皮组织。
13.根据权利要求1所述的方法，其中所述第二样品与所述第一样品不同。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所述第二样品是与所述第一样品不同的样品类型。
15.根据权利要求1所述的方法，其中在第一时间点从所述受试者获得所述第一样品并且在第二时间点从所述受试者获得所述第二样品，其中所述第二时间点在所述第一时间点之后。
16.根据权利要求15所述的方法，其中所述第二时间点在所述第一时间点的约1-2年内。
17.根据权利要求1所述的方法，其中(a)包括将所述一种或多种生物标志物的所述存在或不存在与一种或多种生物标志物的参考集进行比较。
18.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者需要针对所述肺部病况的治疗。
19.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者疑似具有发展肺部病况的增加的风险。
20.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者相对于所述肺部病况无症状。
21.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者先前未接受过所述电子成像扫描。
22.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者先前未接受过明确诊断。
23.根据权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种风险因子包括：吸烟；环境烟雾暴露；氡气暴露；空气污染暴露；辐射暴露；工业物质暴露；遗传性或环境获得性基因突变；受试者的年龄；具有次级健康状况的受试者；或其任何组合。
24.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者具有两种或更多种风险因子。
25.根据权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括至少五种生物标志物。
26.根据权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种生物标志物包括以下中的一种或多种：基因或其片段；序列变体；融合；线粒体转录物；表观遗传修饰；拷贝数变异；杂合性丢失(LOH)；或其任何组合。
27.根据权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种生物标志物的所述存在或不存在包括表达水平。
28.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法鉴定所述受试者是否处于发展所述肺部病况的增加的风险中。
29.根据权利要求1所述的方法，其中(b)的所述鉴定包括采用经训练的算法。
30.根据权利要求29所述的方法，其中所述经训练的算法通过训练集训练，所述训练集包括从个体的气道获得的上皮细胞。
31.根据权利要求29所述的方法，其中所述经训练的算法通过训练集训练，所述训练集包括对所述肺部病况呈良性的样品和对所述肺部病况呈恶性的样品。
32.根据权利要求29所述的方法，其中所述经训练的算法通过训练集训练，所述训练集包括从具有一种或多种风险因子的受试者获得的样品。
33.根据权利要求1所述的方法，进一步包括在(a)之前，计算机分析所述受试者，以鉴定所述受试者中发展所述肺部病况的所述一种或多种风险因子的所述存在。
34.一种用于监测患有或疑似患有肺部病况的受试者的方法，其包括：
(a)测定第一样品，所述第一样品包括从疑似患有所述肺部病况的受试者获得的上皮组织，以鉴定与所述肺部病况相关联的一种或多种生物标志物的存在或不存在，其中所述受试者先前已接受过一个或多个肺结节的存在的阳性指示；以及
(b)在鉴定所述一种或多种生物标志物的所述存在或不存在后，基于来自(a)的结果(i)从所述受试者获得第二样品，或者(ii)指导所述受试者获得所述受试者的肺部区域的电子成像扫描。
35.根据权利要求34所述的方法，其中所述阳性指示通过电子成像扫描先前鉴定。
36.根据权利要求34所述的方法，其中所述一个或多个肺结节是至少两个肺结节。
37.根据权利要求34所述的方法，其中所述从所述受试者获得所述第二样品包括对所述受试者进行支气管镜检查、经胸壁针抽吸(TTNA)或电视辅助胸腔镜手术(...
【专利技术属性】
技术研发人员：G·C·肯尼迪，邦妮·H·安德森，
申请(专利权)人：威拉赛特公司，
类型：发明
国别省市：美国;US
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