【技术实现步骤摘要】
单核苷酸多态性检测汉族人群吸烟成瘾方法
本专利技术涉及生物遗传医学
，具体涉及中国汉族人群吸烟成瘾易感基因单核苷酸多态性位点检测试剂盒及其应用。
技术介绍
吸烟成瘾作为一种慢性精神类疾病，全球范围内每年约造成600万人的非正常死亡。由于缺少有效的治疗方法和戒烟手段，以及一些国家和地区对于吸烟成瘾的危害认识有限，在2020年每年因为吸烟导致的非正常死亡人数将达到1000万人。根据中国疾控中心报告显示，在2015年中国有过吸烟经历的成年男性比例高达52.1％，烟民总数超过3亿，6000万人每天吸烟量超过1包，由于吸烟导致非正常死亡的人数高达130万。由于吸烟带来的经济损失在2014年约为3500亿元。数据显示，中国烟民戒烟成功率仅14.4％，而如果仅靠个人意志不借助医疗戒烟的话，成功率仅有3％-5％。在过去的几十年中，连锁分析、候选基因关联分析以及全基因组关联分析的广泛应用，为吸烟成瘾找到了大量的易感位点。对于吸烟成瘾来说，遗传因素和环境因素都起到了重要的作用。其中，遗传因素对于吸烟成瘾的贡献大约为0.56。尽管对...
【技术保护点】
1.单核苷酸多态性检测汉族人群吸烟成瘾方法，其特征在于，包括有以下步骤：/n步骤一：通过搜索查阅数据库以及之前在欧裔样本的研究结果，确定与吸烟成瘾相关的18个易感基因、203个单核苷酸多态性位点，并定制Taqman OpenArray芯片进行基因分型；/n步骤二：为血液样本提取DNA和RNA；/n步骤三：基于基因分型的结果，结合样本吸烟相关的表型，利用候选基因关联分析，对汉族人群中特有的吸烟成瘾易感位点进行初步筛选，将关联分析P值小于0.05的单核苷酸多态性位点纳入下一步分析；/n步骤四：基于基因分型、基因组甲基化测序、转录组测序的结果，找出具有潜在生物学功能的单核苷酸多态...
【技术特征摘要】
1.单核苷酸多态性检测汉族人群吸烟成瘾方法，其特征在于，包括有以下步骤：
步骤一：通过搜索查阅数据库以及之前在欧裔样本的研究结果，确定与吸烟成瘾相关的18个易感基因、203个单核苷酸多态性位点，并定制TaqmanOpenArray芯片进行基因分型；
步骤二：为血液样本提取DNA和RNA；
步骤三：基于基因分型的结果，结合样本吸烟相关的表型，利用候选基因关联分析，对汉族人群中特有的吸烟成瘾易感位点进行初步筛选，将关联分析P值小于0.05的单核苷酸多态性位点纳入下一步分析；
步骤四：基于基因分型、基因组甲基化测序、转录组测序的结果，找出具有潜在生物学功能的单核苷酸多态性位点，对单核苷酸多态性位点进行打分，保留最可能对吸烟成瘾具有贡献并具有潜在生物学意义的位点，构成中国汉族人群吸烟成瘾的基因检测试剂盒。
2.根据权利要求1所述的单核苷酸多态性检测汉族人群吸烟成瘾方法，其特征在于：所述步骤一中，通过搜索查阅数据库及之前在欧裔样本的研究结果，确定与吸烟成瘾相关的18个易感基因、203个单核苷酸多态性位点为：
1）提供了一组与吸烟成瘾相关的18个候选基因；
A.尼古丁受体家族的基因：CHRNA3-CHRNB4-CHRNA5、CHRNB3-CHRNA6、CHRNA2、CHRNB2、CHRNA7、CHRNA4；
B.尼古丁代谢的相关基因：CYP2B6；
C.神经递质系统中的相关基因：GRIN3A、DRD2-ANKK1-TTC12-NCAM1、HTR3A、HTR3B、SLC6A4；
2）提供了与吸烟成瘾相关的203个单核苷酸多态性位点；
3）根据203个单核苷酸多态性位点，将所选择的位点及对应的探针信息提交给ThermoFisherScientific公司，定制TaqmanOpenArray芯片，根据样本的数量和单核苷酸多态性位点数目选择最优的模块组合。
3.根据权利要求1所述的单核苷酸多态性检测汉族人群吸烟成瘾方法，其特征在于：所述步骤二中，，DNA样本用于基因分型实验和甲基化测序，RNA样本用于转录组测序，利用IlluminaX10测序仪为样本进行测序，通过Illumina二代测序，获得样本甲基化和转录组的原始测序数据，之后...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘强，马云龙，李明定，
申请(专利权)人：刘强，马云龙，
类型：发明
国别省市：山西;14
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。