一种代谢-蛋白互作网络集成方法技术

本发明专利技术涉及生物信息学中生物网络子领域，一种代谢‑蛋白互作网络集成方法，该方法包括代谢网络转换，R‑P‑R网络构建，网络对接三个步骤；代谢网络是代谢物‑代谢物之间的关系联结而成，而蛋白互作网络是蛋白‑蛋白之间的关系联结而成，从节点信息上来看，利用蛋白作为桥梁，找到代谢网络和蛋白互作网络的共性，将其集成为一个网络。

A metabolic protein interaction network integration method

【技术实现步骤摘要】
一种代谢-蛋白互作网络集成方法
本专利技术涉及生物信息学中生物网络子领域，具体涉及一种代谢-蛋白互作网络集成方法。
技术介绍
生物细胞网络主要包括代谢网络、转录调控网络、信号转导网络、蛋白互作网络等。近些年来，国内外的研究者们展开了基因组规模信号转导网络、基因调控网络、代谢网络模型的构建以及分析，构建出了诸多细胞网络的数据库。在生物领域中，围绕着不同的生物细胞网络模型，许多生物研究团队已经进行了深入的研究和探讨，他们应用不同的生物信息学工具对相关网络进行分析，但随着对单一生物网络的深入研究，研究者们逐渐发现了单一网络的不足之处。研究者们认识到，生物体内各组成成分(基因、蛋白质、代谢物)都是和其他组分共同作用才能体现出其功能的，单一细胞网络的构建整理出单独的某个组分之间的联系，而集成网络可以将这些单独组分的细胞网络联系在一起，构成一个更大的生物网络，能够更好地模拟生物学中的关键活动，因此以单一网络为基础所进行的多个网络的集成工作，已经成为生物细胞网络研究的热点。网络集成中，代谢网络是被研究者研究的最为透彻、深入的一个细胞网络。目前已构建的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种代谢-蛋白互作网络集成方法，其特征在于，该方法包括代谢网络转换，R-P-R网络构建，网络对接三个步骤；代谢网络是代谢物-代谢物之间的关系联结而成，而蛋白互作网络是蛋白-蛋白之间的关系联结而成，从节点信息上来看，利用蛋白作为桥梁，找到代谢网络和蛋白互作网络的共性，将其集成为一个网络。/n

【技术特征摘要】
1.一种代谢-蛋白互作网络集成方法，其特征在于，该方法包括代谢网络转换，R-P-R网络构建，网络对接三个步骤；代谢网络是代谢物-代谢物之间的关系联结而成，而蛋白互作网络是蛋白-蛋白之间的关系联结而成，从节点信息上来看，利用蛋白作为桥梁，找到代谢网络和蛋白互作网络的共性，将其集成为一个网络。


2.根据权利要求1所述的一种代谢-蛋白互作网络集成方法，其特征在于，具体步骤为：
(1)代谢网络转换：通常代谢网络是以代谢物图的形式呈现，即以代谢物为节点，以反应为边；
(2)R-P-R网络构建：在代谢网络中，每一个反应都是由酶催化的，每一个代谢反应都对应着一个或多个蛋白-反应关系/P代谢网络P-R关系；根据代谢网络中蛋白/催化酶，与反应间的催化关系，将蛋白-反应关系/P-R关系添加到R-R网络中，形成R-P-R代谢网络；
(3)网络对接：在蛋白互作网络中，包含大量蛋白-蛋白关系/P-P关系，蛋白互作...

【专利技术属性】
技术研发人员：郝彤，孙金生，郜晨晨，
申请(专利权)人：天津师范大学，
类型：发明
国别省市：天津;12