大白菜抗根肿病新基因CRw紧密连锁的SNP分子标记及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种大白菜抗根肿病新基因CRw紧密连锁的SNP分子标记及应用。本发明专利技术提供了双侧分子标记(BVRC‑A03033590标记和BVRC‑A03035160标记)。BVRC‑A03033590标记相应的SNP位点及其周边序列如序列表的序列4所示(SNP位点为序列4的第101位，命名为SNP位点甲，为T/A多态)。BVRC‑A03035160标记相应的SNP位点及其周边序列如序列表的序列8所示(SNP位点为序列8的第101位，命名为SNP位点乙，为T/A多态)。两个标记可以联合或者单独使用，用于大白菜抗根肿病分子标记辅助育种。本发明专利技术的应用将对加快大白菜抗根肿病育种进程起到重要作用。

SNP molecular marker closely linked to CRW, a new gene of Chinese cabbage resistant to root swelling disease and its application

【技术实现步骤摘要】
大白菜抗根肿病新基因CRw紧密连锁的SNP分子标记及应用
本专利技术涉及一种大白菜抗根肿病新基因CRw紧密连锁的SNP分子标记及应用。
技术介绍
十字花科蔬菜根肿病是由芸薹根肿菌(PlasmodiophorabrassicaeWoron)侵染引起的一种世界性病害。根肿病最早发现于地中海沿岸(英国，1737)和欧洲南部(前苏联列宁格勒，1872)。我国自1955年首次发现根肿病以来，现已扩散至全国各地。在根肿病抗病基因研究方面，国外很早就对芸薹种种质资源中的抗根肿病(CR)基因进行挖掘。目前报道的位于A03染色体的大白菜抗根肿病基因有5个，其中CRa是第一个被克隆的CR基因，该基因编码TIR-NBS-LRR(TNL)类蛋白，同时已开发出该基因的功能分子标记。Saito等(2006)将Crr3精细定位在A03连锁群BrSTS-33和BrSTS-78标记间0.35cM的区间内。Sakanoto等(2008)利用F2群体和STS标记，定位得到位于A03连锁群上的CRk新位点。朴钟云研究组先后在A03染色体上定位了CRb和CRd这2个CR基因。<本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于鉴定SNP位点甲的物质和/或用于鉴定SNP位点乙的应用，为如下(a)或(b)：(a)鉴定大白菜的根肿病抗性；(b)选育抗根肿病大白菜；/nSNP位点甲为大白菜基因组DNA中的序列表的序列4所示DNA分子中的第101位核苷酸；SNP位点乙为大白菜基因组DNA中的序列表的序列8所示DNA分子中的第101位核苷酸。/n

【技术特征摘要】
1.用于鉴定SNP位点甲的物质和/或用于鉴定SNP位点乙的应用，为如下(a)或(b)：(a)鉴定大白菜的根肿病抗性；(b)选育抗根肿病大白菜；
SNP位点甲为大白菜基因组DNA中的序列表的序列4所示DNA分子中的第101位核苷酸；SNP位点乙为大白菜基因组DNA中的序列表的序列8所示DNA分子中的第101位核苷酸。


2.一种鉴定大白菜的根肿病抗性的方法，为方法Ⅰ-1或方法Ⅰ-2；
方法Ⅰ-1包括如下步骤：检测供试大白菜基于SNP位点甲的基因型和基于SNP位点乙的基因型；如果供试大白菜基于SNP位点甲的基因型为TT纯合型且基于SNP位点乙的基因型为TT纯合型，供试大白菜为抗根肿病大白菜；
方法Ⅰ-2包括如下步骤：检测供试大白菜基于SNP位点甲携带的等位基因和基于SNP位点乙携带的等位基因；如果供试大白菜在SNP位点甲携带T等位基因且在SNP位点乙携带T等位基因，供试大白菜为抗根肿病大白菜；
SNP位点甲为大白菜基因组DNA中的序列表的序列4所示DNA分子中的第101位核苷酸；SNP位点乙为大白菜基因组DNA中的序列表的序列8所示DNA分子中的第101位核苷酸。


3.一种选育抗根肿病大白菜的方法，为方法Ⅰ-3或方法Ⅰ-4；
方法Ⅰ-3包括如下步骤：检测供试大白菜基于SNP位点甲的基因型和基于SNP位点乙的基因型；选择基于SNP位点甲的基因型为TT纯合型且基于SNP位点乙的基因型为TT纯合型的大白菜作为抗根肿病大白菜；
方法Ⅰ-4包括如下步骤：检测供试大白菜基于SNP位点甲携带的等位基因和基于SNP位点乙携带的等位基因；选择在SNP位点甲携带T等位基因且在SNP位点乙携带T等位基因的大白菜作为抗根肿病大白菜；
SNP位点甲为大白菜基因组DNA中的序列表的序列4所示DNA分子中的第101位核苷酸；SNP位点乙为大白菜基因组DNA中的序列表的序列8所示DNA分子中的第101位核苷酸。


4.一种鉴定大白菜的根肿病抗性的方法，为方法Ⅱ-1或方法Ⅱ-2；
方法Ⅱ-1：检测供试大白菜基于SNP位点甲的基因型；如果供试大白菜基于SNP位点甲的基因型为TT纯合型，供试大白菜为抗根肿病大白菜；
方法Ⅱ-2：检测供试大白菜基于SNP位点甲携带的等位基因；如果供试大白菜在SNP位点甲携带T等位基因，供试大白菜为抗根肿病大白菜；
SNP位点甲为大白菜基因组DNA中的序列表的序列4所示DN...

【专利技术属性】
技术研发人员：汪维红，余阳俊，张凤兰，于拴仓，苏同兵，温常龙，李佩荣，张德双，赵岫云，张建，
申请(专利权)人：北京市农林科学院，
类型：发明
国别省市：北京;11