minor BCR-ABL1基因的检测方法技术

本公开提供了包括以下的方法：(1)在具有BCR基因的外显子2至14的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列的修饰核酸的存在下，以获得自对象的核酸试样作为模板、使用具有BCR基因的外显子1的一部分的碱基序列的正向引物、和具有与ABL1基因的外显子2至11的一部分互补的碱基序列的反向引物来进行PCR的步骤；和(2)当通过PCR使核酸扩增时，判断对象具有minor BCR‑ABL1基因的步骤。

Detection of minor BCR-ABL1 gene

The present disclosure provides the following methods: (1) in the presence of a base sequence having a part of exon 2 to 14 of BCR gene or a modified nucleic acid with complementary base sequence, a forward primer using a base sequence having a part of exon 1 of BCR gene and a part of exon 2 to 11 with abl1 gene is used to obtain a nucleic acid sample from the target as a template The reverse primer of complementary base sequence is used to carry out the PCR step; and (2) when the nucleic acid is amplified by PCR, the step of judging that the target has the minor BCR \u2011 abl1 gene is taken.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】minorBCR-ABL1基因的检测方法
本申请要求日本专利申请第2017-087666号的优先权，其全部内容通过引用合并于此。本公开涉及对象中minorBCR-ABL1基因的检测方法以及用于该目的的试剂盒。
技术介绍
BCR-ABL1融合基因是在慢性骨髓性白血病(CML)和费城染色体阳性急性淋巴性白血病(Ph+ALL)的患者中发现的染色体异常。表示为t(9；22)的9号染色体和22号染色体之间的染色体易位导致9号染色体的c-ABL1基因(带区域q34)与22号染色体的bcr基因(带区域q11)融合。融合基因编码嵌合BCR-ABL1蛋白。BCR-ABL1蛋白具有酪氨酸激酶活性，并且通过持续刺激细胞增殖信号和抑制细胞凋亡导致造血干细胞的无限增殖。最近开发的靶向BCR-ABL1蛋白的酪氨酸激酶抑制剂，例如伊马替尼(imatinib)，已改善对CML和Ph+ALL的治疗结果。根据BCR的切断点的不同，BCR-ABL1可主要分为Major型BCR-ABL1(M-BCR-ABL1)和minor型BCR-ABL1(m-BCR-ABL1)。在本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测对象中minor BCR-ABL1基因的方法，其包括：/n(1)在具有BCR基因的外显子2至14的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列的修饰核酸的存在下，以获得自对象的核酸试样作为模板、使用具有BCR基因的外显子1的一部分的碱基序列的正向引物、和具有与ABL1基因的外显子2至11的一部分互补的碱基序列的反向引物来进行PCR的步骤；和/n(2)当通过PCR使核酸扩增时，判断对象具有minor BCR-ABL1基因的步骤。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170426 JP 2017-0876661.一种检测对象中minorBCR-ABL1基因的方法，其包括：
(1)在具有BCR基因的外显子2至14的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列的修饰核酸的存在下，以获得自对象的核酸试样作为模板、使用具有BCR基因的外显子1的一部分的碱基序列的正向引物、和具有与ABL1基因的外显子2至11的一部分互补的碱基序列的反向引物来进行PCR的步骤；和
(2)当通过PCR使核酸扩增时，判断对象具有minorBCR-ABL1基因的步骤。


2.根据权利要求1所述的方法，其中所述修饰核酸具有BCR基因的外显子2至13的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列。


3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述修饰核酸具有BCR基因的外显子12和13的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列。


4.根据权利要求1至3任一项所述的方法，其中所述修饰核酸包括约10个至约30个核苷酸。


5.根据权利要求1至4任一项所述的方法，其中所述修饰核酸包括SEQIDNO:8的碱基序列。


6.根据权利要求1至5任一项所述的方法，其中所述修饰核酸包括PNA部分。


7.根据权利要求1至6任一项所述的方法，其中所述核酸试样为通过对获得自对象的RNA试样进行逆转录而得到的cDNA。


8.根据权利要求1至7任一项所述的方法，其中所述核酸试样为在具有与BCR基因的外显子2至14的一部分互补的碱基序列的修饰核酸的存在下，对获得自对象的RNA试样进行逆转录而得到的cDNA。


9.根据权利要求8所述的方法，其中用于逆转录的修饰...

【专利技术属性】
技术研发人员：葛城肃典，田中秀明，伊藤隆太，古贺大辅，
申请(专利权)人：大塚制药株式会社，
类型：发明
国别省市：日本;JP