1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用制造技术

技术编号：22560506 阅读：161 留言：0更新日期：2019-11-16 09:49

本发明专利技术涉及SNP分子标记领域，具体而言，提供了1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用。发明专利技术人从NCBI数据库获得30个结核分枝杆菌谱系3的全基因组数据，在此基础上进行比对，构建结核分枝杆菌谱系3的进化树后，通过设置Fst系数筛选出最能代表结核分枝杆菌谱系3进化树上每一分枝的共1073个SNP位点。该1073个SNP位点对结核分枝杆菌谱系3的亚谱系判断、菌株水平鉴定和进化分析，甚至是成簇菌株分析都具有重要意义，用于检测这1073个SNP位点的物质及其构成的试剂盒与相关的检测方法都能实现结核分枝杆菌谱系3的亚谱系判断、菌株水平鉴定和进化分析。

Application of 1073 SNP loci in Mycobacterium tuberculosis pedigree 3

The invention relates to the field of SNP molecular marker, in particular to the application of 1073 SNP sites in Mycobacterium tuberculosis pedigree 3. The inventor obtained the whole genome data of 30 Mycobacterium tuberculosis pedigree 3 from NCBI database, and then compared them. After constructing the evolution tree of Mycobacterium tuberculosis pedigree 3, the inventor screened out 1073 SNP sites that best represent each branch on the evolution tree of Mycobacterium tuberculosis pedigree 3 by setting the FST coefficient. The 1073 SNP loci are of great significance to the sub lineage judgment, strain level identification and evolution analysis of Mycobacterium tuberculosis pedigree 3, even to the analysis of clustered strains. The kit and related detection methods used to detect the 1073 SNP loci and their components can realize the sub lineage judgment, strain level identification and evolution analysis of Mycobacterium tuberculosis pedigree 3.

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【技术实现步骤摘要】
1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用
本专利技术涉及SNP分子标记领域，具体而言，涉及1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用。
技术介绍
结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌感染引起的慢性传染病。引起结核病的病原菌为结核分枝杆菌(M.TBs)，目前M.TB分为7个谱系(lineage1-lineage7)，与lineage2和lineage4相比，lineage3古老、致病性弱、数量少、在全球流行区域局限，并且遗传多态性等遗传进化规律的研究极其落后。因此，有必要对结核分枝杆菌的谱系3进行细分，实现其菌株水平鉴定。目前，结核分枝杆菌的分型方法主要有：数目可变串联重复序列(variablenumbertandemrepeatsVNTR)分型、单核苷酸多态性(SNP)分型，以及全基因组序列(WholeGenomicSequences,WGS)分析技术。VNTR是最常用的分型方法，该方法实现了结核分枝杆菌菌株水平鉴定，操作简单、便捷，只需提取24个基因位点信息就可对其分型，并且结果易判读，然而，该方法存在同源异质性的缺点。WGS技术是目前M.TB最好的基因分型方法，不但具有高分辨率，而且克服了同源异质性的缺点，但是运用全部基因组信息分析运算量庞大。有鉴于此，特提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术的第一目的在于提供1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用，以缓解现有技术中缺少相关SNP位点的问题。本专利技术的第二目的在于提供用于...

【技术保护点】
1.1073个SNP位点针对结核分枝杆菌谱系3，在如下至少一种中的应用：/n1)亚谱系判断；/n2)菌株水平鉴定；/n3)进化分析；/n所述1073个SNP位点的物理位置来源于Accesion Number为NC_000962.3的结核分枝杆菌H37Rv的全基因组序列；/n具体包括：/nSNP位点1为结核分枝杆菌的染色体的1419位点，序列为C/G；/nSNP位点2为结核分枝杆菌的染色体的1829位点，序列为T/C；/nSNP位点3为结核分枝杆菌的染色体的2039位点，序列为G/C；/nSNP位点4为结核分枝杆菌的染色体的3446位点，序列为C/T；/nSNP位点5为结核分枝杆菌的染色体的9341位点，序列为C/T；/nSNP位点6为结核分枝杆菌的染色体的10043位点，序列为C/G；/nSNP位点7为结核分枝杆菌的染色体的10407位点，序列为G/T；/nSNP位点8为结核分枝杆菌的染色体的11410位点，序列为G/A；/nSNP位点9为结核分枝杆菌的染色体的12297位点，序列为C/T；/nSNP位点10为结核分枝杆菌的染色体的12990位点，序列为G/A；/nSNP位点11为结核...

【技术特征摘要】
1.1073个SNP位点针对结核分枝杆菌谱系3，在如下至少一种中的应用：
1)亚谱系判断；
2)菌株水平鉴定；
3)进化分析；
所述1073个SNP位点的物理位置来源于AccesionNumber为NC_000962.3的结核分枝杆菌H37Rv的全基因组序列；
具体包括：
SNP位点1为结核分枝杆菌的染色体的1419位点，序列为C/G；
SNP位点2为结核分枝杆菌的染色体的1829位点，序列为T/C；
SNP位点3为结核分枝杆菌的染色体的2039位点，序列为G/C；
SNP位点4为结核分枝杆菌的染色体的3446位点，序列为C/T；
SNP位点5为结核分枝杆菌的染色体的9341位点，序列为C/T；
SNP位点6为结核分枝杆菌的染色体的10043位点，序列为C/G；
SNP位点7为结核分枝杆菌的染色体的10407位点，序列为G/T；
SNP位点8为结核分枝杆菌的染色体的11410位点，序列为G/A；
SNP位点9为结核分枝杆菌的染色体的12297位点，序列为C/T；
SNP位点10为结核分枝杆菌的染色体的12990位点，序列为G/A；
SNP位点11为结核分枝杆菌的染色体的13376位点，序列为C/G；
SNP位点12为结核分枝杆菌的染色体的16643位点，序列为C/T；
SNP位点13为结核分枝杆菌的染色体的17842位点，序列为G/C；
SNP位点14为结核分枝杆菌的染色体的24007位点，序列为G/T；
SNP位点15为结核分枝杆菌的染色体的24904位点，序列为G/A；
SNP位点16为结核分枝杆菌的染色体的28082位点，序列为G/C；
SNP位点17为结核分枝杆菌的染色体的37450位点，序列为C/G；
SNP位点18为结核分枝杆菌的染色体的39030位点，序列为C/T；
SNP位点19为结核分枝杆菌的染色体的40675位点，序列为C/G；
SNP位点20为结核分枝杆菌的染色体的42519位点，序列为C/G；
SNP位点21为结核分枝杆菌的染色体的47241位点，序列为C/G；
SNP位点22为结核分枝杆菌的染色体的53128位点，序列为A/C；
SNP位点23为结核分枝杆菌的染色体的59223位点，序列为C/T；
SNP位点24为结核分枝杆菌的染色体的61742位点，序列为G/C；
SNP位点25为结核分枝杆菌的染色体的63885位点，序列为A/G；
SNP位点26为结核分枝杆菌的染色体的65083位点，序列为G/A；
SNP位点27为结核分枝杆菌的染色体的65631位点，序列为G/A；
SNP位点28为结核分枝杆菌的染色体的66632位点，序列为C/T；
SNP位点29为结核分枝杆菌的染色体的68380位点，序列为T/G；
SNP位点30为结核分枝杆菌的染色体的79379位点，序列为A/C；
SNP位点31为结核分枝杆菌的染色体的83069位点，序列为T/C；
SNP位点32为结核分枝杆菌的染色体的84931位点，序列为A/G；
SNP位点33为结核分枝杆菌的染色体的89451位点，序列为C/A；
SNP位点34为结核分枝杆菌的染色体的93729位点，序列为C/G；
SNP位点35为结核分枝杆菌的染色体的99223位点，序列为C/G；
SNP位点36为结核分枝杆菌的染色体的99604位点，序列为C/G；
SNP位点37为结核分枝杆菌的染色体的99870位点，序列为C/A；
SNP位点38为结核分枝杆菌的染色体的100029位点，序列为G/C；
SNP位点39为结核分枝杆菌的染色体的100137位点，序列为T/C；
SNP位点40为结核分枝杆菌的染色体的100465位点，序列为C/G；
SNP位点41为结核分枝杆菌的染色体的101314位点，序列为G/A；
SNP位点42为结核分枝杆菌的染色体的103930位点，序列为G/C；
SNP位点43为结核分枝杆菌的染色体的104830位点，序列为C/A；
SNP位点44为结核分枝杆菌的染色体的111821位点，序列为C/T；
SNP位点45为结核分枝杆菌的染色体的113872位点，序列为C/T；
SNP位点46为结核分枝杆菌的染色体的117389位点，序列为C/T；
SNP位点47为结核分枝杆菌的染色体的117566位点，序列为T/G；
SNP位点48为结核分枝杆菌的染色体的122499位点，序列为C/T；
SNP位点49为结核分枝杆菌的染色体的123745位点，序列为G/A；
SNP位点50为结核分枝杆菌的染色体的130693位点，序列为C/G；
SNP位点51为结核分枝杆菌的染色体的132954位点，序列为C/G；
SNP位点52为结核分枝杆菌的染色体的133524位点，序列为G/A；
SNP位点53为结核分枝杆菌的染色体的135503位点，序列为G/A；
SNP位点54为结核分枝杆菌的染色体的140750位点，序列为G/C；
SNP位点55为结核分枝杆菌的染色体的142113位点，序列为C/G；
SNP位点56为结核分枝杆菌的染色体的144865位点，序列为C/T；
SNP位点57为结核分枝杆菌的染色体的145164位点，序列为G/C；
SNP位点58为结核分枝杆菌的染色体的149838位点，序列为C/A；
SNP位点59为结核分枝杆菌的染色体的153818位点，序列为G/C；
SNP位点60为结核分枝杆菌的染色体的160736位点，序列为C/G；
SNP位点61为结核分枝杆菌的染色体的168176位点，序列为G/T；
SNP位点62为结核分枝杆菌的染色体的170277位点，序列为C/T；
SNP位点63为结核分枝杆菌的染色体的175911位点，序列为C/A；
SNP位点64为结核分枝杆菌的染色体的187990位点，序列为C/A；
SNP位点65为结核分枝杆菌的染色体的198401位点，序列为G/T；
SNP位点66为结核分枝杆菌的染色体的200736位点，序列为A/G；
SNP位点67为结核分枝杆菌的染色体的204866位点，序列为T/G；
SNP位点68为结核分枝杆菌的染色体的206128位点，序列为C/G；
SNP位点69为结核分枝杆菌的染色体的206386位点，序列为T/C；
SNP位点70为结核分枝杆菌的染色体的208425位点，序列为C/T；
SNP位点71为结核分枝杆菌的染色体的208811位点，序列为G/A；
SNP位点72为结核分枝杆菌的染色体的218816位点，序列为G/C；
SNP位点73为结核分枝杆菌的染色体的231581位点，序列为G/A；
SNP位点74为结核分枝杆菌的染色体的233212位点，序列为C/T；
SNP位点75为结核分枝杆菌的染色体的233238位点，序列为C/T；
SNP位点76为结核分枝杆菌的染色体的233963位点，序列为A/G；
SNP位点77为结核分枝杆菌的染色体的235716位点，序列为T/C；
SNP位点78为结核分枝杆菌的染色体的237116位点，序列为C/T；
SNP位点79为结核分枝杆菌的染色体的241758位点，序列为G/A；
SNP位点80为结核分枝杆菌的染色体的257071位点，序列为C/T；
SNP位点81为结核分枝杆菌的染色体的267617位点，序列为C/T；
SNP位点82为结核分枝杆菌的染色体的276633位点，序列为C/T；
SNP位点83为结核分枝杆菌的染色体的283496位点，序列为G/A；
SNP位点84为结核分枝杆菌的染色体的284146位点，序列为T/G；
SNP位点85为结核分枝杆菌的染色体的288715位点，序列为C/T；
SNP位点86为结核分枝杆菌的染色体的301839位点，序列为C/T；
SNP位点87为结核分枝杆菌的染色体的304045位点，序列为G/A；
SNP位点88为结核分枝杆菌的染色体的307823位点，序列为G/A；
SNP位点89为结核分枝杆菌的染色体的310972位点，序列为C/T；
SNP位点90为结核分枝杆菌的染色体的316184位点，序列为C/G；
SNP位点91为结核分枝杆菌的染色体的323414位点，序列为T/C；
SNP位点92为结核分枝杆菌的染色体的327789位点，序列为C/T；
SNP位点93为结核分枝杆菌的染色体的330340位点，序列为G/A；
SNP位点94为结核分枝杆菌的染色体的330710位点，序列为A/G；
SNP位点95为结核分枝杆菌的染色体的332231位点，序列为G/A；
SNP位点96为结核分枝杆菌的染色体的332522位点，序列为G/C；
SNP位点97为结核分枝杆菌的染色体的334151位点，序列为A/G；
SNP位点98为结核分枝杆菌的染色体的334153位点，序列为T/C；
SNP位点99为结核分枝杆菌的染色体的335642位点，序列为A/G；
SNP位点100为结核分枝杆菌的染色体的335643位点，序列为G/T；
SNP位点101为结核分枝杆菌的染色体的335651位点，序列为G/C；
SNP位点102为结核分枝杆菌的染色体的335654位点，序列为G/A；
SNP位点103为结核分枝杆菌的染色体的335847位点，序列为C/A；
SNP位点104为结核分枝杆菌的染色体的335919位点，序列为T/G；
SNP位点105为结核分枝杆菌的染色体的335920位点，序列为C/G；
SNP位点106为结核分枝杆菌的染色体的335922位点，序列为C/G；
SNP位点107为结核分枝杆菌的染色体的335927位点，序列为A/G；
SNP位点108为结核分枝杆菌的染色体的335929位点，序列为T/C；
SNP位点109为结核分枝杆菌的染色体的336728位点，序列为G/A；
SNP位点110为结核分枝杆菌的染色体的336957位点，序列为T/C；
SNP位点111为结核分枝杆菌的染色体的336975位点，序列为T/G；
SNP位点112为结核分枝杆菌的染色体的336976位点，序列为T/C；
SNP位点113为结核分枝杆菌的染色体的338561位点，序列为G/A；
SNP位点114为结核分枝杆菌的染色体的338618位点，序列为C/G；
SNP位点115为结核分枝杆菌的染色体的338648位点，序列为T/G；
SNP位点116为结核分枝杆菌的染色体的338669位点，序列为T/C；
SNP位点117为结核分枝杆菌的染色体的338682位点，序列为T/G；
SNP位点118为结核分枝杆菌的染色体的338683位点，序列为C/G；
SNP位点119为结核分枝杆菌的染色体的338685位点，序列为C/G；
SNP位点120为结核分枝杆菌的染色体的338690位点，序列为A/G；
SNP位点121为结核分枝杆菌的染色体的338692位点，序列为T/C；
SNP位点122为结核分枝杆菌的染色体的338810位点，序列为G/C；
SNP位点123为结核分枝杆菌的染色体的338876位点，序列为G/A；
SNP位点124为结核分枝杆菌的染色体的338903位点，序列为G/C；
SNP位点125为结核分枝杆菌的染色体的339230位点，序列为G/C；
SNP位点126为结核分枝杆菌的染色体的342381位点，序列为G/A；
SNP位点127为结核分枝杆菌的染色体的342382位点，序列为C/T；
SNP位点128为结核分枝杆菌的染色体的348386位点，序列为C/T；
SNP位点129为结核分枝杆菌的染色体的350088位点，序列为C/A；
SNP位点130为结核分枝杆菌的染色体的350388位点，序列为G/T；
SNP位点131为结核分枝杆菌的染色体的353197位点，序列为C/T；
SNP位点132为结核分枝杆菌的染色体的358567位点，序列为C/T；
SNP位点133为结核分枝杆菌的染色体的367508位点，序列为C/G；
SNP位点134为结核分枝杆菌的染色体的369886位点，序列为C/G；
SNP位点135为结核分枝杆菌的染色体的371102位点，序列为A/T；
SNP位点136为结核分枝杆菌的染色体的379028位点，序列为G/A；
SNP位点137为结核分枝杆菌的染色体的390447位点，序列为G/C；
SNP位点138为结核分枝杆菌的染色体的390593位点，序列为C/A；
SNP位点139为结核分枝杆菌的染色体的394767位点，序列为C/A；
SNP位点140为结核分枝杆菌的染色体的402836位点，序列为G/A；
SNP位点141为结核分枝杆菌的染色体的404845位点，序列为A/C；
SNP位点142为结核分枝杆菌的染色体的409532位点，序列为C/A；
SNP位点143为结核分枝杆菌的染色体的409554位点，序列为C/G；
SNP位点144为结核分枝杆菌的染色体的411274位点，序列为G/C；
SNP位点145为结核分枝杆菌的染色体的411819位点，序列为C/T；
SNP位点146为结核分枝杆菌的染色体的415693位点，序列为G/A；
SNP位点147为结核分枝杆菌的染色体的417810位点，序列为C/T；
SNP位点148为结核分枝杆菌的染色体的422678位点，序列为G/A；
SNP位点149为结核分枝杆菌的染色体的428921位点，序列为G/A；
SNP位点150为结核分枝杆菌的染色体的430561位点，序列为G/T；
SNP位点151为结核分枝杆菌的染色体的430674位点，序列为T/C；
SNP位点152为结核分枝杆菌的染色体的431525位点，序列为T/G；
SNP位点153为结核分枝杆菌的染色体的431587位点，序列为C/G；
SNP位点154为结核分枝杆菌的染色体的433727位点，序列为C/G；
SNP位点155为结核分枝杆菌的染色体的442689位点，序列为T/C；
SNP位点156为结核分枝杆菌的染色体的455024位点，序列为G/A；
SNP位点157为结核分枝杆菌的染色体的457392位点，序列为G/A；
SNP位点158为结核分枝杆菌的染色体的466808位点，序列为G/C；
SNP位点159为结核分枝杆菌的染色体的473310位点，序列为A/G；
SNP位点160为结核分枝杆菌的染色体的475987位点，序列为C/T；
SNP位点161为结核分枝杆菌的染色体的476612位点，序列为G/A；
SNP位点162为结核分枝杆菌的染色体的480350位点，序列为T/G；
SNP位点163为结核分枝杆菌的染色体的482268位点，序列为T/C；
SNP位点164为结核分枝杆菌的染色体的484623位点，序列为G/A；
SNP位点165为结核分枝杆菌的染色体的485730位点，序列为C/T；
SNP位点166为结核分枝杆菌的染色体的491940位点，序列为T/C；
SNP位点167为结核分枝杆菌的染色体的495890位点，序列为C/T；
SNP位点168为结核分枝杆菌的染色体的519183位点，序列为C/T；
SNP位点169为结核分枝杆菌的染色体的519844位点，序列为C/T；
SNP位点170为结核分枝杆菌的染色体的521871位点，序列为C/T；
SNP位点171为结核分枝杆菌的染色体的523541位点，序列为C/G；
SNP位点172为结核分枝杆菌的染色体的541153位点，序列为C/T；
SNP位点173为结核分枝杆菌的染色体的542104位点，序列为C/A；
SNP位点174为结核分枝杆菌的染色体的549873位点，序列为C/T；
SNP位点175为结核分枝杆菌的染色体的550630位点，序列为T/C；
SNP位点176为结核分枝杆菌的染色体的551206位点，序列为T/C；
SNP位点177为结核分枝杆菌的染色体的555492位点，序列为G/A；
SNP位点178为结核分枝杆菌的染色体的573699位点，序列为C/A；
SNP位点179为结核分枝杆菌的染色体的575920位点，序列为C/T；
SNP位点180为结核分枝杆菌的染色体的580797位点，序列为A/AG；
SNP位点181为结核分枝杆菌的染色体的597411位点，序列为G/C；
SNP位点182为结核分枝杆菌的染色体的608684位点，序列为C/G；
SNP位点183为结核分枝杆菌的染色体的620043位点，序列为C/G；
SNP位点184为结核分枝杆菌的染色体的622788位点，序列为G/C；
SNP位点185为结核分枝杆菌的染色体的623877位点，序列为C/T；
SNP位点186为结核分枝杆菌的染色体的625493位点，序列为T/G；
SNP位点187为结核分枝杆菌的染色体的632600位点，序列为C/T；
SNP位点188为结核分枝杆菌的染色体的633562位点，序列为C/T；
SNP位点189为结核分枝杆菌的染色体的634425位点，序列为G/A；
SNP位点190为结核分枝杆菌的染色体的635139位点，序列为G/C；
SNP位点191为结核分枝杆菌的染色体的642657位点，序列为T/G；
SNP位点192为结核分枝杆菌的染色体的643217位点，序列为G/T；
SNP位点193为结核分枝杆菌的染色体的645005位点，序列为C/T；
SNP位点194为结核分枝杆菌的染色体的656523位点，序列为C/T；
SNP位点195为结核分枝杆菌的染色体的662858位点，序列为G/T；
SNP位点196为结核分枝杆菌的染色体的663878位点，序列为T/C；
SNP位点197为结核分枝杆菌的染色体的665568位点，序列为G/A；
SNP位点198为结核分枝杆菌的染色体的666022位点，序列为C/G；
SNP位点199为结核分枝杆菌的染色体的671718位点，序列为G/A；
SNP位点200为结核分枝杆菌的染色体的673188位点，序列为C/G；
SNP位点201为结核分枝杆菌的染色体的679507位点，序列为T/G；
SNP位点202为结核分枝杆菌的染色体的680820位点，序列为C/T；
SNP位点203为结核分枝杆菌的染色体的684660位点，序列为A/C；
SNP位点204为结核分枝杆菌的染色体的697126位点，序列为G/A；
SNP位点205为结核分枝杆菌的染色体的697478位点，序列为C/T；
SNP位点206为结核分枝杆菌的染色体的705091位点，序列为G/A；
SNP位点207为结核分枝杆菌的染色体的708056位点，序列为T/C；
SNP位点208为结核分枝杆菌的染色体的717018位点，序列为G/A；
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SNP位点447为结核分枝杆菌的染色体的1788613位点，序列为C/T；
SNP位点448为结核分枝杆菌的染色体的1788627位点，序列为C/G；
SNP位点449为结核分枝杆菌的染色体的1789564位点，序列为C/T；
SNP位点450为结核分枝杆菌的染色体的1789565位点，序列为C/A；
SNP位点451为结核分枝杆菌的染色体的1789933位点，序列为G/A；
SNP位点452为结核分枝杆菌的染色体的1794072位点，序列为C/T；
SNP位点453为结核分枝杆菌的染色体的1816370位点，序列为C/T；
SNP位点454为结核分枝杆菌的染色体的1816590位点，序列为C/T；
SNP位点455为结核分枝杆菌的染色体的1832509位点，序列为C/G；
SNP位点456为结核分枝杆菌的染色体的1834159位点，序列为G/A；
SNP位点457为结核分枝杆菌的染色体的1836417位点，序列为C/A；
SNP位点458为结核分枝杆菌的染色体的1839685位点，序列为G/C；
SNP位点459为结核分枝杆菌的染色体的1846072位点，序列为G/C；
SNP位点460为结核分枝杆菌的染色体的1851457位点，序列为C/G；
SNP位点461为结核分枝杆菌的染色体的1851984位点，序列为G/A；
SNP位点462为结核分枝杆菌的染色体的1852877位点，序列为A/C；
SNP位点463为结核分枝杆菌的染色体的1853083位点，序列为C/A；
SNP位点464为结核分枝杆菌的染色体的1853492位点，序列为G/C；
SNP位点465为结核分枝杆菌的染色体的1861245位点，序列为G/C；
SNP位点466为结核分枝杆菌的染色体的1861334位点，序列为C/T；
SNP位点467为结核分枝杆菌的染色体的1873700位点，序列为G/A；
SNP位点468为结核分枝杆菌的染色体的1878552位点，序列为G/A；
SNP位点469为结核分枝杆菌的染色体的1881051位点，序列为G/C；
SNP位点470为结核分枝杆菌的染色体的1889978位点，序列为C/A；
SNP位点471为结核分枝杆菌的染色体的1900207位点，序列为T/A；
SNP位点472为结核分枝杆菌的染色体的1902358位点，序列为G/C；
SNP位点473为结核分枝杆菌的染色体的1904947位点，序列为C/T；
SNP位点474为结核分枝杆菌的染色体的1905674位点，序列为C/A；
SNP位点475为结核分枝杆菌的染色体的1913814位点，序列为C/G；
SNP位点476为结核分枝杆菌的染色体的1918811位点，序列为A/G；
SNP位点477为结核分枝杆菌的染色体的1919627位点，序列为G/A；
SNP位点478为结核分枝杆菌的染色体的1919896位点，序列为G/A；
SNP位点479为结核分枝杆菌的染色体的1925830位点，序列为G/T；
SNP位点480为结核分枝杆菌的染色体的1927329位点，序列为C/A；
SNP位点481为结核分枝杆菌的染色体的1929349位点，序列为C/T；
SNP位点482为结核分枝杆菌的染色体的1931459位点，序列为A/G；
SNP位点483为结核分枝杆菌的染色体的1931979位点，序列为C/T；
SNP位点484为结核分枝杆菌的染色体的1932668位点，序列为T/A；
SNP位点485为结核分枝杆菌的染色体的1940344位点，序列为G/A；
SNP位点486为结核分枝杆菌的染色体的1942128位点，序列为G/A；
SNP位点487为结核分枝杆菌的染色体的1946999位点，序列为T/G；
SNP位点488为结核分枝杆菌的染色体的1952524位点，序列为C/T；
SNP位点489为结核分枝杆菌的染色体的1954957位点，序列为G/T；
SNP位点490为结核分枝杆菌的染色体的1969241位点，序列为C/G；
SNP位点491为结核分枝杆菌的染色体的1973198位点，序列为C/A；
SNP位点492为结核分枝杆菌的染色体的1982901位点，序列为G/T；
SNP位点493为结核分枝杆菌的染色体的1983195位点，序列为A/G；
SNP位点494为结核分枝杆菌的染色体的1983198位点，序列为C/G；
SNP位点495为结核分枝杆菌的染色体的1998790位点，序列为C/T；
SNP位点496为结核分枝杆菌的染色体的1998792位点，序列为T/A；
SNP位点497为结核分枝杆菌的染色体的2004772位点，序列为G/A；
SNP位点498为结核分枝杆菌的染色体的2010880位点，序列为T/G；
SNP位点499为结核分枝杆菌的染色体的2014688位点，序列为G/A；
SNP位点500为结核分枝杆菌的染色体的2015124位点，序列为C/A；
SNP位点501为结核分枝杆菌的染色体的2024455位点，序列为C/G；
SNP位点502为结核分枝杆菌的染色体的2025977位点，序列为C/G；
SNP位点503为结核分枝杆菌的染色体的2030634位点，序列为G/C；
SNP位点504为结核分枝杆菌的染色体的2030720位点，序列为C/T；
SNP位点505为结核分枝杆菌的染色体的2039715位点，序列为C/T；
SNP位点506为结核分枝杆菌的染色体的2040061位点，序列为C/T；
SNP位点507为结核分枝杆菌的染色体的2053185位点，序列为C/A；
SNP位点508为结核分枝杆菌的染色体的2058864位点，序列为G/A；
SNP位点509为结核分枝杆菌的染色体的2061729位点，序列为G/C；
SNP位点510为结核分枝杆菌的染色体的2065914位点，序列为G/C；
SNP位点511为结核分枝杆菌的染色体的2074092位点，序列为C/T；
SNP位点512为结核分枝杆菌的染色体的2080460位点，序列为C/T；
SNP位点513为结核分枝杆菌的染色体的2087942位点，序列为T/C；
SNP位点514为结核分枝杆菌的染色体的2087943位点，序列为A/T；
SNP位点515为结核分枝杆菌的染色体的2096856位点，序列为C/T；
SNP位点516为结核分枝杆菌的染色体的2101040位点，序列为C/A；
SNP位点517为结核分枝杆菌的染色体的2105272位点，序列为C/T；
SNP位点518为结核分枝杆菌的染色体的2105602位点，序列为C/T；
SNP位点519为结核分枝杆菌的染色体的2113915位点，序列为C/A；
SNP位点520为结核分枝杆菌的染色体的2114012位点，序列为G/C；
SNP位点521为结核分枝杆菌的染色体的2123484位点，序列为A/G；
SNP位点522为结核分枝杆菌的染色体的2133791位点，序列为G/A；
SNP位点523为结核分枝杆菌的染色体的2151780位点，序列为G/T；
SNP位点524为结核分枝杆菌的染色体的2153550位点，序列为T/C；
SNP位点525为结核分枝杆菌的染色体的2155168位点，序列为C/G；
SNP位点526为结核分枝杆菌的染色体的2158066位点，序列为G/C；
SNP位点527为结核分枝杆菌的染色体的2158451位点，序列为G/A；
SNP位点528为结核分枝杆菌的染色体的2164116位点，序列为T/C；
SNP位点529为结核分枝杆菌的染色体的2166287位点，序列为C/T；
SNP位点530为结核分枝杆菌的染色体的2167310位点，序列为A/G；
SNP位点531为结核分枝杆菌的染色体的2170797位点，序列为T/C；
SNP位点532为结核分枝杆菌的染色体的2178981位点，序列为C/G；
SNP位点533为结核分枝杆菌的染色体的2180693位点，序列为T/C；
SNP位点534为结核分枝杆菌的染色体的2186127位点，序列为G/A；
SNP位点535为结核分枝杆菌的染色体的2188298位点，序列为C/T；
SNP位点536为结核分枝杆菌的染色体的2196715位点，序列为G/C；
SNP位点537为结核分枝杆菌的染色体的2196964位点，序列为A/C；
SNP位点538为结核分枝杆菌的染色体的2197293位点，序列为C/A；
SNP位点539为结核分枝杆菌的染色体的2197313位点，序列为A/C；
SNP位点540为结核分枝杆菌的染色体的2197331位点，序列为C/A；
SNP位点541为结核分枝杆菌的染色体的2197332位点，序列为C/A；
SNP位点542为结核分枝杆菌的染色体的2212049位点，序列为G/A；
SNP位点543为结核分枝杆菌的染色体的2216336位点，序列为C/T；
SNP位点544为结核分枝杆菌的染色体的2217799位点，序列为A/G；
SNP位点545为结核分枝杆菌的染色体的2230127位点，序列为G/A；
SNP位点546为结核分枝杆菌的染色体的2241241位点，序列为C/T；
SNP位点547为结核分枝杆菌的染色体的2243491位点，序列为G/T；
SNP位点548为结核分枝杆菌的染色体的2244564位点，序列为A/C；
SNP位点549为结核分枝杆菌的染色体的2250970位点，序列为T/G；

【专利技术属性】
技术研发人员：朱晨迪，李卫民，李青，贾俊楠，
申请(专利权)人：北京市结核病胸部肿瘤研究所，
类型：发明
国别省市：北京;11

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