源于肠道的诊断胰腺炎的生物标志物、筛选方法及其用途技术

本发明专利技术涉及源于肠道的诊断胰腺炎的生物标志物、筛选方法及其用途，所述生物标志物由uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group、Anaerococcus_prevotii_g__Anaerococcus、unclassified_g__Eubacterium_hallii_group组成，所述生物标志物在肠道菌群中富集。通过检测所述生物标志物的丰度可有效识别出患有该病的患者，可简化胰腺炎检测和诊断步骤，极大的提高胰腺炎的诊治效率。

Biomarkers, screening methods and application of intestinal origin in the diagnosis of pancreatitis

【技术实现步骤摘要】
源于肠道的诊断胰腺炎的生物标志物、筛选方法及其用途
本专利技术涉及生物技术、疾病诊断和生物医药领域，具体涉及源于肠道的诊断胰腺炎的生物标志物、筛选方法及其用途。
技术介绍
急性胰腺炎(Acutepancreatitis，AP)是引起急性腹痛的常见疾病之一，它是由多种病因导致胰腺内的胰酶被激活，引起胰腺组织自身消化、水肿、出血，胰腺局部发生炎症反应为主要特征的疾病，病情严重者可发生全身炎性反应综征(Systemicinflammatoryresponsesyndrome，SIRS)，并伴有器官功能障碍(Organdsfunction,OD)。急性胰腺炎的临床表现多种多样，特异性低，对于不良预后的预测敏感性低于40％(SteinbergWM.Predictorsofseverityofacutepancreatitis[J].GastroenterolC1inNAm,1990,19(4):849-61.)，且AP发生全身炎性反应综合征的病理学基础尚未明确。由于AP病因多样、发病机制复杂、死亡率较高，急性胰腺炎的总体病死率达5％～10％，重度急性胰腺炎(Severeacutepancreatitis，SAP)患者病死率高达36％～50％(LankischPG,ApteM,BanksPA.Acutepancreatitis[J].Lancet,2015,386(9988):85-96)，因此尽早判断急性胰腺炎患者的严重程度，鉴别病情变化，及时对患者进行密切监测和积极治疗，对提高患者生存率和减轻经济压力等至关重要。肠道微生物是存在于人体肠道中的微生物群落，是人体的“第二基因组”。人肠道菌群和宿主构成一个相互关联的整体，具有重要作用，包括形成微生物屏障防止病原菌定植、执行免疫调节及代谢功能。肠道微生物数量、结构及稳定性的改变，尤其是菌群的失衡会改变机体的免疫状态。研究表明肠道菌群失衡与某些疾病的发生发展息息相关，包括糖尿病、帕金森症等，然而有时肠道菌群失衡并不直接导致疾病的表达，而作为疾病标记。随着人体基因组测序完成及高通量测序技术的高速发展，基因筛查成为诊断的方向。因此通过对肠道菌群的研究筛选出与疾病相关性高的生物标志物有重要意义。一方面，利用疾病有关的生物标记物可以提供诊断疾病的方法。另一方面，通过将获得的生物标志物中的某些保护性微生物进行分离、纯化、培养和加上制成益生菌，可以用于改善并恢复肠道微生物平衡，对于疾病治疗具有重要意义。
技术实现思路
本专利技术的目的之一在于提供一种诊断胰腺炎的生物标志物。本专利技术的目的之二在于提供一种检测所述生物标志物的试剂盒。本专利技术的目的之三在于提供一种用于治疗胰腺炎的药物。本专利技术的目的之四在于提供一种生产或筛选上述药物的方法。本专利技术的目的之五在于提供一种能够准确有效诊断胰腺炎的方法。为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：本专利技术提供了一种诊断胰腺炎的生物标志物，所述生物标志物选自以下物种中的至少一个：uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group、Anaerococcus_prevotii_g__Anaerococcus、unclassified_g__Eubacterium_hallii_group。以上物种均是在分类学上种水平的分类。本专利技术提供的胰腺炎微生物标志物是专利技术人通过对大量胰腺炎个体和大量健康对照个体的粪便样本中的微生物的丰度的差异比较分析、以及验证，而确定下来的，明确了肠道微生物中胰腺炎相关的微生物标志物。利用所称的胰腺炎标志物，能够确定个体处于患有胰腺炎状态的概率或者处于健康状态的概率，能够用于非侵入性的早期发现或辅助检测胰腺炎。本专利技术还提供了一种用于诊断胰腺炎的试剂盒，该试剂盒含有对前面所述的生物标志物进行检测的试剂。具体地，所述试剂盒包括提取微生物基因组DNA等核酸物质的试剂，或检测所提取的DNA等核酸的试剂。作为可选择的，所述试剂盒包括提取微生物的蛋白、菌体成分、代谢产物的试剂，或检测这些蛋白、菌体成分、代谢产物的试剂。优选地，检测这些蛋白、菌体成分、代谢产物的试剂包括抗原、抗体、化学标记、显色或发光试剂。利用上述试剂盒，可以确定前面所述的生物标志物在肠道菌群中的相对丰度，因此可以通过所得到的相对丰度值与预定的临界值进行比较。从而确定对象个体为胰腺炎个体或者为健康个体的概率，以及用于监控胰腺炎患者的治疗效果的效率。本专利技术还提供了前面所述的生物标志物在制备预防或治疗胰腺炎的药物和/或在制备功能性食品中的用途。本专利技术还提供了一种用于预防或治疗胰腺炎的药物或功能性食品。本专利技术还提供生产或筛选上述药物或功能性食品的方法，所述方法包括筛选促使所述生物标志物的相对丰度或绝对丰度降低或升高的物质作为所述药物或功能性食品的步骤。具体的，针对uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group设计的功能性食品或药物能够增加uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group的丰度或含量。针对unclassified_g__Eubacterium_hallii_group设计的功能性食品或药物能够增加unclassified_g__Eubacterium_hallii_group的丰度或含量。针对Anaerococcus_prevotii_g__Anaerococcus设计的功能性食品或药物能够减少Anaerococcus_prevotii_g__Anaerococcus的丰度或含量。具体地，针对uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group设计的功能性食品或药物包含uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group。针对unclassified_g__Eubacterium_hallii_group设计的功能性食品或药物包含unclassified_g__Eubacterium_hallii_group。促使uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group或unclassified_g__Eubacterium_hallii_group相对丰度或绝对丰度升高的物质作为所述药物或功能性食品。促使Anaerococcus_prevotii_g__Anaerococcus相对丰度或绝对丰度降低的物质作为所述药物或功能性食品。本专利技术还提供了一种确定对象异常状态的方法。根据本专利技术的实施例，该方法包括步骤：(1)确定所述个体的粪便样本中的前面所述的生物标志物的丰度；(2)分别将步骤(1)中确定的生物标志物的丰度与其在对照组中的丰度进行比较，依据获得的比较结果确定所述个体的状态，所述对照组由一组或多组相同状态的个体的粪便样本组成，所述状态包括患有胰腺炎状态和健康状态。本专利技术提出了一种利用所述生物标志物诊断胰腺炎状态或预测胰腺炎患者个体治疗疗效的系统。所述系统包括：核酸样本分离单元，所述核酸样本分离单元适于从检测对象中分离肠道菌群核酸样本：测序单元，所述测序单元与所述核酸样本分离单元相连，并且适于对所分离本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种诊断胰腺炎的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物选自以下物种中的至少一个：uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group、Anaerococcus_prevotii_g__Anaerococcus、unclassified_g__Eubacterium_hallii_group。

【技术特征摘要】
1.一种诊断胰腺炎的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物选自以下物种中的至少一个：uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group、Anaerococcus_prevotii_g__Anaerococcus、unclassified_g__Eubacterium_hallii_group。2.权利要求1所述的生物标志物在制备诊断胰腺炎的试剂盒中的应用。3.一种诊断胰腺炎的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒含有对权利要求1所述的生物标志物进行检测的试剂。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂盒包括提取微生物基因组DNA等核酸物质的试剂，或检测所提取的DNA等核酸物质的试剂。5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂盒包括提取微生物蛋白、菌体成分、代谢产物的试剂，或检测所述微生物蛋白、菌体成分、代谢产物的试剂。6.一种预防或治疗胰腺炎的药物或功能性食品，其特征在于，针对uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group设计的功能性食品或药物能够增加uncultured_bacterium_g__Eubacterium_hallii_group的丰度或含量；针对unclassified_g__Eubacterium_hallii_group设计的功能性食品或药物能够增加unclassified_g__Eubacterium_hallii_...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴东，柏小寅，张晟瑜，李佳宁，施文，李玥，李景南，杨爱明，
申请(专利权)人：中国医学科学院北京协和医院，
类型：发明
国别省市：北京,11