具备假阳性抑制功能的探针、其设计方法及其应用技术

本发明专利技术的目的为提供利用简单的双链形成来以高特异度检测、或定量短链的核酸的手段。本发明专利技术涉及多核苷酸碱基探针、以及其设计方法及利用方法，所述多核苷酸碱基探针具有下述这样的序列：在与具有至少1条序列号1～10中任一序列的靶序列互补的序列中，与靶序列中的序列号1～10中任一序列互补的部分中的至少1个碱基是经脱碱基化或经取代的。

Probes with False Positive Inhibitory Function, Their Design Method and Application

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】具备假阳性抑制功能的探针、其设计方法及其应用
本专利技术涉及可用于高特异性核酸检测中的探针、其设计方法及利用了该探针的核酸检测方法。
技术介绍
近年来，包括20个碱基左右的微RNA(miRNA)在内的低分子非编码RNA(ncRNA)因具有各种功能而受到瞩目。特别地，这些ncRNA水平与疾病相关时，可以用作标志物。在通过杂交使靶DNA或RNA与探针结合时，有时存在下述情况：在靶DNA或RNA的结合部分的序列(以下称为“结合序列”)中，存在有结合能力强的鸟嘌呤或胞嘧啶中的某一者连续多个而成的序列。这种情况下，探针也会结合到并非靶标的DNA或RNA(但具有与该序列相同的连续序列的DNA或RNA)上，因此存在容易出现假阳性的现象。一直以来，在要使探针结合到具有上述容易诱发假阳性的序列的长链靶DNA或RNA时，设计并利用针对完全不含鸟嘌呤或胞嘧啶中任一方连续多个而成的序列的位点的探针。通常认为基于杂交的特异性序列的检测需要18mer左右的探针长度。但是，对miRNA这样的由20mer左右的短的链长构成的靶序列进行检测时，无法设计完全不含鸟嘌呤或胞嘧啶中任一方连续多个而成的序列的探针，不能避免假本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.多核苷酸碱基探针，所述探针具有下述序列：在与具有至少1条序列号1～10中任一序列的靶序列互补的序列中，与所述靶序列中的该序列号1～10中任一序列互补的部分中的至少1个碱基经脱碱基化和/或经取代，并且/或者，经切割从而在末端具有至少1段下述互补序列，所述互补序列与所述靶序列中的序列号1～10中任一序列的2个碱基以下的序列互补。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2017.02.22 JP 2017-0305531.多核苷酸碱基探针，所述探针具有下述序列：在与具有至少1条序列号1～10中任一序列的靶序列互补的序列中，与所述靶序列中的该序列号1～10中任一序列互补的部分中的至少1个碱基经脱碱基化和/或经取代，并且/或者，经切割从而在末端具有至少1段下述互补序列，所述互补序列与所述靶序列中的序列号1～10中任一序列的2个碱基以下的序列互补。2.如权利要求1所述的多核苷酸碱基探针，所述多核苷酸碱基探针为10～50mer。3.如权利要求2所述的多核苷酸碱基探针，所述多核苷酸碱基探针为15～28mer。4.如权利要求1～3中任一项所述的多核苷酸碱基探针，其结合有标记。5.如权利要求1～4中任一项所述的多核苷酸碱基探针，其中，在与所述靶序列中的序列号1～10中任一序列互补的部分中，所述经脱碱基化或经取代的碱基中的至少1个位于与所述靶序列中的所述序列号1～10中任一序列互补的部分的内部。6.如权利要求1～5中任一项所述的多核苷酸碱基探针，其特征在于，在与所述靶序列中的序列号1～10中任一序列互补的序列中，所述经脱碱基化或经取代的碱基中的至少1个的比例为相对于3～5个的鸟嘌呤或胞嘧啶中的某一方而言为1个。7.如权利要求1～6中任一项所述的多核苷酸碱...

【专利技术属性】
技术研发人员：新岛结，高濑信太郎，铃木久史，池田寿文，
申请(专利权)人：株式会社友华，
类型：发明
国别省市：日本,JP