双特异性抗MUC16-CD3抗体和抗MUC16药物结合物制造技术

本公开提供了抗粘蛋白16抗体：结合到MUC16和CD3并且在表达MUC16的肿瘤存在下通过CD3复合物活化T细胞的双特异性抗体(bsAb)；结合到人类和MUC16的人类IgG抗体(单特异性抗体)；活体内抑制肿瘤生长的抗MUC16抗体药物结合物。所述抗体适用于治疗各种癌症，包括卵巢癌。

Bispecific Anti-MUC16-CD3 Antibody and Anti-MUC16 Drug Binding

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】双特异性抗MUC16-CD3抗体和抗MUC16药物结合物参考序列表本申请以引用的方式并入序列表，其以计算机可读形式、以文件10295WO01-Sequence.txt提交，于2017年9月22日创建并含有893,983个字节。
本专利技术涉及抗体及其抗原结合片段，其对粘蛋白16(MUC16)具有特异性，以及其使用方法。本专利技术还涉及结合MUC16和CD3的双特异性抗原结合分子，和其使用方法。本专利技术还涉及抗体-药物结合物，其包含抗MUC16抗体或其片段和治疗剂(例如细胞毒性剂)。
技术介绍
粘蛋白16(MUC16)，也称为癌抗原125、癌瘤抗原125、碳水化合物抗原125或CA-125，是单一跨膜结构域高度糖基化整合膜糖蛋白，其在卵巢癌中大量表达。MUC16由三个主要结构域组成：细胞外N端结构域；散布有海胆精子，肠激酶和集聚蛋白(SEA)结构域的大串联重复结构域；以及包含一段跨膜区域和短胞质尾区的羧基端结构域。蛋白质裂解可以引起MUC16的大部分细胞外部分脱落到血流中。MUC16在癌症(包括卵巢癌、乳腺癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、肝内胆管癌-肿块形成类型、子宫颈腺癌和胃肠道腺癌)以及包括发炎性肠病、肝硬化、心力衰竭、腹膜感染和腹部手术的疾病和病症中过度表达(Haridas,D.等人,2014,FASEBJ.,28:4183-4199)。证实癌细胞上的表达可以保护肿瘤细胞免受免疫系统的影响。(Felder,M.等人,2014,《分子癌症(MolecularCancer)》,13:129)。已经研究了使用针对MUC16的抗体治疗卵巢癌的方法。奥戈伏单抗(Oregovomab)和阿戈伏单抗(abgovomab)是具有有限成功率的抗MUC16抗体。(Felder,见上文,Das,S.和Batra,S.K.2015,《癌症研究(CancerRes.)》75:4660-4674)。CD3是在与T细胞受体复合物(TCR)相关的T细胞上表达的同型二聚体或异二聚体抗原并且是T细胞活化所需的。功能性CD3由以下四种不同链中的两种的二聚体结合形成：ε、ζ、δ和γ。CD3二聚体排列包括γ/ε、δ/ε和ζ/ζ。已证实针对CD3的抗体在T细胞上聚集CD3，从而以类似于由肽负荷的MHC分子参与TCR的方式引起T细胞活化。因此，已提出抗CD3抗体用于涉及T细胞活化的治疗目的。此外，已提出能够结合CD3和靶抗原的双特异性抗体用于治疗用途，包括靶向针对表达靶抗原的组织和细胞的T细胞免疫应答。靶向MUC16的抗原结合分子，包括抗体-药物结合物，以及结合MUC16和CD3的双特异性抗原结合分子将适用于其中需要特异性靶向和T细胞介导的杀伤表达MUC16的细胞的治疗情形。
技术实现思路
在第一方面中，本专利技术提供抗体和其抗原结合片段，其结合于人类MUC16。根据本专利技术的这一方面的抗体尤其适用于靶向表达MUC16的细胞。本专利技术还提供结合人类MUC16和人类CD3的双特异性抗体和其抗原结合片段。根据本专利技术的这一方面的双特异性抗体尤其适用于靶向表达CD3的T细胞，并用于刺激T细胞活化，例如在T细胞介导的表达MUC16的细胞的杀伤是有益或所需的情况下。例如，双特异性抗体可以引导针对特异性MUC16表达细胞(例如卵巢肿瘤细胞)的CD3介导的T细胞活化。本专利技术的例示性抗MUC16抗体列举于本文中的表1和2中。表1阐述例示性抗MUC16抗体的重链可变区(HCVR)和轻链可变区(LCVR)的氨基酸序列标识符，以及重链互补决定区(HCDR1、HCDR2和HCDR3)和轻链互补决定区(LCDR1、LCDR2和LCDR3)。表2阐述编码例示性抗MUC16抗体的HCVR、LCVR、HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3的核酸分子的序列标识符。本专利技术提供抗体或其抗原结合片段，其包含HCVR，所述HCVR包含选自表1中列举的HCVR氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或与其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含LCVR，所述LCVR包含选自表1中列举的LCVR氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或与其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含HCVR和LCVR氨基酸序列对(HCVR/LCVR)，所述氨基酸序列对包含表1中列举的HCVR氨基酸序列中的任一个和与其配对的表1中列举的LCVR氨基酸序列中的任一个。根据某些实施例，本专利技术提供抗体或其抗原结合片段，其包含表1中列举的例示性抗MUC16抗体中的任一个内所含的HCVR/LCVR氨基酸序列对。在某些实施例中，HCVR/LCVR氨基酸序列对具有SEQIDNO:18/26(例如H1H8767P)。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含重链CDR1(HCDR1)，所述重链CDR1包含选自表1中列举的HCDR1氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含重链CDR2(HCDR2)，所述重链CDR2包含选自表1中列举的HCDR2氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含重链CDR3(HCDR3)，所述重链CDR3包含选自表1中列举的HCDR3氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含轻链CDR1(LCDR1)，所述轻链CDR1包含选自表1中列举的LCDR1氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含轻链CDR2(LCDR2)，所述轻链CDR2包含选自表1中列举的LCDR2氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含轻链CDR3(LCDR3)，所述轻链CDR3包含选自表1中列举的LCDR3氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列或其具有至少90％、至少95％、至少98％或至少99％序列一致性的大体上类似序列。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR3和LCDR3氨基酸序列对(HCDR3/LCDR3)，所述氨基酸序列对包含表1中列举的HCDR3氨基酸序列中的任一个和与其配对的表1中列举的LCDR3氨基酸序列中的任一个。根据某些实施例，本专利技术提供抗体或其抗原结合片段，其包含表1中列举的例示性抗MUC16抗体中的任一个内所含的HCDR3/LCDR3氨基酸序列对。在某些实施例中，HCDR3/LCDR3氨基酸序列对具有SEQIDNO:24/32(例如H1H8767P)。本专利技术还提供抗体或其抗原结合片段，其包含表1中列举的例示性抗MUC16抗体中的任一个中所含的六个CDR的集合(即，HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种双特异性抗原结合分子，其包含特异性结合人类CD3的第一抗原结合域，和特异性结合人类MUC16的第二抗原结合域。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.09.23 US 62/399,249;2017.09.14 US 62/558,7111.一种双特异性抗原结合分子，其包含特异性结合人类CD3的第一抗原结合域，和特异性结合人类MUC16的第二抗原结合域。2.一种双特异性抗体，其包含结合人类CD3的第一结合臂和结合人类MUC16的第二结合臂，其中所述第一结合臂包含有包含SEQIDNO:1961的氨基酸序列的重链和包含SEQIDNO:1960的氨基酸序列的轻链，并且其中所述第二结合臂包含有包含SEQIDNO:1959的氨基酸序列的重链和包含SEQIDNO:1960的氨基酸序列的轻链。3.一种双特异性抗体，其包含结合人类CD3的第一结合臂和结合人类MUC16的第二结合臂，其中所述第一结合臂包含有包含SEQIDNO:1962的氨基酸序列的重链和包含SEQIDNO:1960的氨基酸序列的轻链，并且其中所述第二结合臂包含有包含SEQIDNO:1959的氨基酸序列的重链和包含SEQIDNO:1960的氨基酸序列的轻链。4.一种经分离的抗体或其抗原结合片段，其以小于约53nM的结合解离平衡常数(KD)值结合人类粘蛋白16(MUC16)，如在25℃下，在表面等离子共振分析法中测量。5.一种经分离的抗体或其抗原结合片段，其以大于约15分钟的解离半衰期(t1/2)结合人类MUC16，如在25℃下，在表面等离子共振分析法中测量。6.根据权利要求4或5所述的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或其抗原结合片段与包含如表1中所阐述的HCVR/LCVR氨基酸序列对的参考抗体竞争结合于人类MUC16。7.根据权利要求6所述的抗体或抗原结合片段，其中所述参考抗体包含选自由以下组成的组的HCVR/LCVR氨基酸序列对：SEQIDNO:2/10；18/26；34/42；50/58；66/74；82/90；98/106；114/122；130/138；146/154；162/170；178/186；194/394；202/210；218/226；234/242；250/1936；258/266；274/1936；282/290；298/306；314/322；330/338；346/354；362/370；和378/386。8.根据权利要求4至7中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或其抗原结合片段与包含如表1中所阐述的HCVR/LCVR氨基酸序列对的参考抗体结合于人类MUC16上的同一表位。9.根据权利要求8所述的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或其抗原结合片段与包含选自由以下组成的组的HCVR/LCVR氨基酸序列对的参考抗体结合于人类MUC16上的同一表位：SEQIDNO:2/10；18/26；34/42；50/58；66/74；82/90；98/106；114/122；130/138；146/154；162/170；178/186；194/394；202/210；218/226；234/242；250/1936；258/266；274/1936；282/290；298/306；314/322；330/338；346/354；362/370；和378/386。10.一种经分离的抗体或其抗原结合片段，其结合人类MUC16，其中所述抗体或抗原结合片段包含：(a)具有如表1中所阐述的氨基酸序列的重链可变区(HCVR)的互补决定区(CDR)；和(b)具有如表1中所阐述的氨基酸序列的轻链可变区(LCVR)的CDR。11.根据权利要求10所述的经分离的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或抗原结合片段包含选自由以下组成的组的HCVR/LCVR氨基酸序列对的重链和轻链CDR：SEQIDNO:2/10；18/26；34/42；50/58；66/74；82/90；98/106；114/122；130/138；146/154；162/170；178/186；194/394；202/210；218/226；234/242；250/1936；258/266；274/1936；282/290；298/306；314/322；330/338；346/354；362/370；和378/386。12.根据权利要求11所述的经分离的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或抗原结合片段包含分别选自由以下组成的组的HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3结构域：SEQIDNO:4-6-8-12-14-16；20-22-24-28-30-32；36-38-40-44-46-48；52-54-56-60-62-64；68-70-72-76-78-80；84-86-88-92-94-96；100-102-104-108-110-112；116-118-120-124-126-128；132-134-136-140-142-144；148-150-152-156-158-160；164-166-168-172-174-176；180-182-184-188-190-192；196-198-200-396-398-400；204-206-208-212-214-216；220-222-224-228-230-232；236-238-240-244-246-248；252-254-256-1938-1940-1942；260-262-264-268-270-272；276-278-280-1938-1940-1942；284-286-288-292-294-296；300-302-304-308-310-312；316-318-320-324-326-328；332-334-336-340-342-344；348-350-352-356-358-360；364-366-368-372-374-376；和380-382-384-388-390-392。13.一种经分离的抗体或其抗原结合片段，其结合人类MUC16，其中所述抗体或抗原结合片段包含：(a)重链可变区(HCVR)，其具有选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、202、218、234、250、258、274、282、298、314、330、346、362和378；和(b)轻链可变区(LCVR)，其具有选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:10；26；42；58、74；90；106；122；138；154；170；186；210；226、242；266；290；306；322；338；354；370；386；1936和394。14.根据权利要求13所述的经分离的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或抗原结合片段包含选自由以下组成的组的HCVR/LCVR氨基酸序列对：SEQIDNO:2/10；18/26；34/42；50/58；66/74；82/90；98/106；114/122；130/138；146/154；162/170；178/186；194/394；202/210；218/226；234/242；250/1936；258/266；274/1936；282/290；298/306；314/322；330/338；346/354；362/370；和378/386。15.一种经分离的抗体或其抗原结合片段，其在SEQIDNO:1902的残基428到残基481范围内的表位内结合人类MUC16。16.根据权利要求15所述的经分离的抗体或抗原结合片段，其与SEQIDNO:1902的氨基酸残基428-434、429-434、453-467、459-467、460-467和/或474-481相互作用。17.一种双特异性抗原结合分子，其包含结合人类CD3的第一抗原结合域和结合人类MUC16的第二抗原结合域，其中所述第二抗原结合域是衍生自根据权利要求4至16中任一项所述的抗体或抗原结合片段。18.根据权利要求1或权利要求17所述的双特异性抗原结合分子，其中所述第一抗原结合域结合表达人类CD3的人类细胞和表达食蟹猕猴CD3的食蟹猕猴细胞。19.根据权利要求1或权利要求17所述的双特异性抗原结合分子，其中所述抗原结合分子结合人类CD3和人类MUC16并且诱导T细胞介导表达MUC16的细胞发生细胞杀伤。20.根据权利要求1或权利要求17所述的双特异性抗原结合分子，其中所述抗原结合分子抑制具有人类卵巢癌异种移植物的免疫功能不全小鼠中的肿瘤生长。21.根据权利要求1或权利要求17所述的双特异性抗原结合分子，其中所述抗原结合分子抑制具有人类卵巢癌异种移植物的免疫功能不全小鼠中已建立肿瘤的肿瘤生长。22.根据权利要求1或17至21中任一项所述的双特异性抗原结合分子，其中所述抗原结合分子以小于约31pM的EC50值诱导T细胞介导的肿瘤细胞杀伤，如在活体外T细胞介导的肿瘤细胞杀伤分析法中测量。23.根据权利要求1或17至22中任一项所述的双特异性抗原结合分子，其中所述第二抗原结合域以小于约7nM的KD值特异性结合人类MUC16，如在活体外表面等离子共振结合分析法中测量。24.根据权利要求1或17至23中任一项所述的双特异性抗原结合分子，其中所述第二抗原结合域以小于约5nM、小于约2nM、小于约1nM、小于约800pM或小于约600pM的KD值特异性结合每一种人类MUC16，如在活体外表面等离子共振结合分析法中测量。25.根据权利要求1或17至24中任一项所述的双特异性抗原结合分子，其为双特异性抗体或其双特异性抗原结合片段。26.根据权利要求1或17至25中任一项所述的双特异性抗原结合分子，其中特异性结合人类MUC16的所述第二抗原结合域包含：来自重链可变区(HCVR)的重链互补决定区(HCDR1、HCDR2和HCDR3)，所述重链可变区包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、202、218、234、250、258、274、282、298、314、330、346、362和378；和来自轻链可变区(LCVR)的轻链互补决定区(LCDR1、LCDR2和LCDR3)，所述轻链可变区包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:10；26；42；58；74；90；106；122；138；154；170；186；210；226、242；266；290；306；322；338；354；370；386；1936和394。27.根据权利要求1或17至25中任一项所述的双特异性抗原结合分子，其中特异性结合人类MUC16的所述第二抗原结合域包含三个重链互补决定区(A2-HCDR1、A2-HCDR2和A2-HCDR3)和三个轻链互补决定区(A2-LCDR1、A2-LCDR2和A2-LCDR3)，其中A2-HCDR1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:4、20、36、52、68、84、100、116、132、148、164、180、196、204、220、236、252、260、276、284、300、316、332、348、364和380；A2-HCDR2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:6、22、38、54、70、86、102、118、134、150、166、182、198、206、222、238、254、262、278、286、302、318、334、350、366和382；A2-HCDR3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:8、24、40、56、72、88、104、120、136、152、168、184、200、208、224、240、256、264、280、304、320、336、352、368和384；A2-LCDR1包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:12、28、44、60、76、92、108、124、140、156、172、188、396、212、228、244、396、268、396、292、308、324、340、356、372、1938和388；A2-LCDR2包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:14、30、46、62、78、94、110、126、142、158、174、190、398、214、230、246、398、270、398、294、310、326、342、358、374、1940和390；并且A2-LCDR3包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQIDNO:16、32、48、64、80、96、112、128、144、160、176、192、400、216、232、248、400、272、400、296、312、328、344、360、376、1942和392。28.根据权利要求1或17至25中任一项所述的双特异性抗原结合分子，其中特异性结合人类MUC16的所述第二抗原...

【专利技术属性】
技术研发人员：L·哈伯，E·史密斯，M·凯利，J·R·基尔什内尔，S·库切，A·克劳福德，T·尼托利，Y·刘，
申请(专利权)人：瑞泽恩制药公司，
类型：发明
国别省市：美国,US