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根据分子动力学模拟预测牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统的方法技术方案

技术编号:21836004 阅读:95 留言:0更新日期:2019-08-10 19:16
本发明专利技术涉及一种根据分子动力学模拟预测牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统的方法。本发明专利技术主要包括1):构建牛磺酸修饰的氧化石墨烯装载5‑氟尿嘧啶的分子动力学模型,并且导出构型文件;2):完成控制文件;3):用分子动力学的方法计算出各组分的均方位移MSD数据;4):将得到的MSD数据绘制成MSD与时间对应的曲线;5):计算MSD与时间对应曲线的斜率;6):用爱因斯坦定律求得扩散系数。本发明专利技术通过对牛磺酸修饰的氧化石墨烯装载5‑氟尿嘧啶纳米载药系统的分子动力学模拟和对扩散系数进行求解,实现从理论角度对整个实验过程的预测,为实验设计和实验操作提供极大的参考。

Prediction of Taurine Modified Graphene Oxide Nano-drug-loading System Based on Molecular Dynamics Simulation

【技术实现步骤摘要】
根据分子动力学模拟预测牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统的方法
本专利技术属于纳米给药
,特别涉及一种根据分子动力学模拟预测牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统的方法。
技术介绍
分子动力学模拟是指通过在原子、分子水平上求解多体问题,而从微观的角度研究物质枝江相互作用的一种重要的计算计模拟方法。同时,通过使用不同的软件模块,得到体系中各分子、原子的微观状态随时间的动态变化。而MaterialsStudio(MS)分子模拟软件是一种功能强大且应用于材料科学领域的新一代软件。并且,MS软件不同模块可以提供多种结构确定、性质预测及模拟的方法。近年来通过计算机辅助设计的手段来模拟和研究药物与载体之间的相互作用越来越受到人们的关注。许多研究者通过对药物与载体进行模拟,可以深入探究药物与载体的作用机制和作用位点,同时也为实验的设计和操作提供有力的依据。而石墨烯作为一种新型纳米材料,其具有大的比表面积,丰富的π电子堆积,非常容易通过π-π堆叠或者氢键等非共价键作用力与药物进行相互作用。因此,近年来,一些研究人员开始利用计算机模拟的方法来研究以石墨烯为基础的纳米药物载体与药物之间的相互作用力,同本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.根据分子动力学模拟预测牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统的方法,其特征在于,其步骤为:步骤1)构建牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统分子动力学模型,得到构型文件;步骤2)使用步骤1)中得到的构型文件进行分子动力学模拟,动力参数设定为:压力为101.325kPa;系统控温:设定初始温度为298K,后升温到所需测定扩散系数的温度,最后保持该温度;完成并得到控制文件;步骤3)运用分子动力学方法计算并输出各组分的均方位移MSD数据;步骤4)将MSD数据绘制成MSD对时间的曲线;步骤5)计算出MSD对时间的斜率;步骤6)根据爱因斯坦扩散定律求出扩散系数。

【技术特征摘要】
1.根据分子动力学模拟预测牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统的方法,其特征在于,其步骤为:步骤1)构建牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统分子动力学模型,得到构型文件;步骤2)使用步骤1)中得到的构型文件进行分子动力学模拟,动力参数设定为:压力为101.325kPa;系统控温:设定初始温度为298K,后升温到所需测定扩散系数的温度,最后保持该温度;完成并得到控制文件;步骤3)运用分子动力学方法计算并输出各组分的均方位移MSD数据;步骤4)将MSD数据绘制成MSD对时间的曲线;步骤5)计算出MSD对时间的斜率;步骤6)根据爱因斯坦扩散定律求出扩散系数。2.根据权利要求1所述的根据分子动力学模拟预测牛磺酸修饰的氧化石墨烯纳米载药系统的方法,其特征在于:所述的步骤1)中,具体方法为:基于MaterialsStudio软件建立的以牛磺酸修饰的氧化石墨烯和5-氟尿嘧啶为基础的三维分子动力学模型:1.1)使用chemoffice2014绘制模型药物5-FU的化学结构式,并使用Poly...

【专利技术属性】
技术研发人员:韩佳婧刘宇
申请(专利权)人:辽宁大学
类型:发明
国别省市:辽宁,21

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