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基于空洞卷积网络的电阻抗图像重建方法技术

技术编号:21302745 阅读:30 留言:0更新日期:2019-06-12 08:46
本发明专利技术涉及一种基于空洞卷积网络的电阻抗图像重建方法,包括下列步骤:从已有的人体胸腔影像图像集中提取待测肺部形状和胸腔轮廓形状,得到肺部和胸腔的二值图像;根据二值图像建立相应的包括传感器模型和待测内含物在内的EIT仿真模型,胸腔轮廓形状用于建立传感器模型,肺部形状用于建立一定电导率的内含物;考虑模型误差,在EIT仿真模型基础上进行数据增强;求解上一步骤处理后的仿真模型正问题,得到图像重建所需的边界测量电压,建立CNN模型,测量电压和胸腔二值图像作为CNN模型的输入,以待测肺部图像作为CNN模型的输出。

Electrical impedance image reconstruction method based on void convolution network

The present invention relates to a method of electrical impedance image reconstruction based on void convolution network, which includes the following steps: extracting the lung shape and the contour shape of the thorax from the existing human thoracic image set, obtaining the binary image of the lung and thorax; establishing the corresponding EIT simulation model including sensor model and the contents to be measured according to the binary image, and using the contour shape of the thorax. In the establishment of sensor model, the shape of lung is used to establish the content of a certain conductivity; considering the model error, data enhancement is carried out on the basis of EIT simulation model; solving the forward problem of simulation model after the previous step, obtaining the boundary measurement voltage needed for image reconstruction, establishing CNN model, measuring voltage and chest binary image as the input of CNN model, and taking the lungs map to be measured as the input of CNN model. As the output of CNN model.

【技术实现步骤摘要】
基于空洞卷积网络的电阻抗图像重建方法
本专利技术属于电阻抗层析成像
,涉及构建网络训练数据集以及基于空洞残差网络的电阻抗成像网络。
技术介绍
电阻抗层析成像(ElectricalImpedanceTomography简称EIT)是一种非侵入式的成像技术,它通过场域的边界测量值重建出场域内部的电导率分布。相比其它成像技术如计算机断层扫描(ComputedTomography,简称CT)和核磁共振成像(MagneticResonanceImaging简称MRI),EIT有着无辐射、结构简单、速度快等优点,在医学临床监测、多相流流型监测以及地址勘探等领域有着广阔的发展前景。然而,由于EIT固有的“软场”特性,其重建图像往往分辨率较低,并且受测量误差和模型误差影响较大,这限制了EIT技术的进一步推广。EIT的“软场”的特性在数学上表现为逆问题的非线性和病态性。传统重建算法通过线性化的方法进行近似和减小模型误差的影响,并引入正则化项来减弱逆问题的病态性。最近,一些直接非线性的重建算法被提出,比如level-set、D-bar等,而基于神经网络的重建算法也属于此类。近几年来,伴随着深度学习在计算机视觉和图像处理领域的迅速发展和广泛应用,众多深度网络特别是卷积神经网络(ConvolutionalNeuralNetwork简称CNN)也纷纷被引入到医学成像领域中来。这些数据驱动的新型成像技术被视为医学成像领域继解析法、迭代法后的第三个发展阶段,它们利用由大量数据训练好的网络,来补充或代替传统成像算法中人为定义的模型,将大数据内在的信息自动地融入到成像过程中。其中一种较为简便易行的办法是在图像域设计并训练一个对粗糙的重建图像加以后处理的CNN,使CNN能学习到医学成像过程中产生的噪声以及伪影等,并在输出图像中移除这些不利因素,这可以被视为一个图像增强或者说图像变换过程,在计算机视觉和图像处理领域这方面已经有许多有效而易于使用的网络模型。E.Kang等人2017年在《医学物理》(MedicalPhysics)第44卷,e360-e375页发表的题为《一种利用定向小波进行低剂量x线CT重建的深度卷积神经网络》(Adeepconvolutionalneuralnetworkusingdirectionalwaveletsforlow-doseX-rayCTreconstruction.)的文章提出了一种在小波域对低剂量CT影像去除噪声的CNN,网络经训练后可将带噪声的小波系数转换为去噪后的纯净小波系数;Q.Yang等人2017年在《IEEE医学成像期刊》(IEEETransactionsonMedicalImaging)第37卷,1348-1357页发表的题为《基于Wasserstein距离和感知损失的生成对抗性网络的低剂量CT图像去噪》(LowDoseCTImageDenoisingUsingaGenerativeAdversarialNetworkwithWassersteinDistanceandPerceptualLoss)的文章提出了一种用生成对抗网络和感知损失对低剂量CT进行降噪的方法,GAN可以从统计角度减弱噪声分布的强度,而感知损失可以在一个可学习的特征域内指导网络训练。除此之外,一种更彻底的策略是充分利用原始测量数据的有效信息,设计一个网络由原始测量数据直接重建得到图像,实现数据从信号域到图像域的转换,而如何设计这一个转换模型将是很有挑战的任务,以往这一过程都通过一些人为设计的传统成像算法,如FBP、ART、正则化方法等实现,而在基于CNN的方法中这一过程则通过对大量数据的学习得到。B.Zhu等人2017年在《自然》(Nature)第555卷,487页发表的题为《基于域变换流形学习的图像重建方法》(Imagereconstructionbydomain-transformmanifoldlearning)的文章中将成像视为一个流形学习过程,网络可以学习到原始测量数据从信号域变换到图像域的映射关系,这一过程由两个全连接层建模,以及重建图像在图像域内的低维流形最佳表示,这一过程由稀疏卷积自编码器建模。另一种方案是将深度神经网络巧妙地融入到重建算法中,HarshitGupta等人2017年在《IEEE医学成像期刊》(IEEETransactionsonMedicalImaging)第37卷,1440-1453页发表的题为《基于CNN的投影梯度下降CT图像重建方法》(CNN-BasedProjectedGradientDescentforConsistentCTImageReconstruction)的文章中提出将投影梯度算法中的投影操作用一个CNN代替,而非将整个重建过程都放在CNN中进行,这可以通过传统算法中的反馈机制确保重建结果与原始测量电压一致。神经网络很早即被应用到EIT中,不过这些模型一般都是浅层的神经网络,这限制了基于神经网络的EIT重建算法的性能。随着深度学习的技术突破,基于神经网络的方法再次受到关注。如上文所述,将神经网络应用于图像重建可以先用传统成像算法进行图像重建,将初步重建的结果输入到神经网络中作处理,此时神经网络起到了图像变换的作用,这也是目前EIT应用中能取得较好结果的方法。鉴于非线性方法有着对噪声和模型误差敏感的缺点,线性重建算法的结果可以被视为神经网络的初始值,这有助于减少噪声和模型误差的影响。S.J.Hamilton等人2017年在《IEEE医学成像期刊》(IEEETransactionsonMedicalImaging)第37卷,2367-2377页发表的题为《深度D-bar:基于深度神经网络的实时电阻抗成像方法》(DeepD-bar:RealtimeElectricalImpedanceTomographyImagingwithDeepNeuralNetworks)的文章中将D-bar算法重建的图像输入到一个U-net中进行后处理,这种被称作DeepD-bar的方法可以使D-bar算法的模糊重建结果得到显著的增强,可以得到清晰的器官边界。若直接将边界测量值输入到神经网络中进行图像重建,那么此时神经网络起到一个非线性重建器的作用。JinZheng等人2018年在《IEEE传感器期刊》(IEEESensorJournal)第18卷,5464-5474页发表的题为《一种基于自编码器的电容层析成像方法》(AnAutoencoder-BasedImageReconstructionforElectricalCapacitanceTomography)的文章中提出将自编码器用于电学图像重建,将测量电压视为对场域内介电常数分布编码的结果,编码器建模正问题,解码器建模逆问题,并将俩者结合起来互相指导一同训练。神经网络也可以作为重建算法的一部分,JingLei等人2018年在《IEEE仪器与测量期刊》(IEEETransactionsonInstrumentationandMeasurement)第67卷,2107-2118页发表的题为《基于深度学习逆问题方法的电容层析成像方法》(DeepLearning-BasedInversionMethodforImagingProbl本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于空洞卷积网络的电阻抗图像重建方法,包括下列步骤:步骤一:从已有的人体胸腔影像图像集中提取待测肺部形状和胸腔轮廓形状,得到肺部和胸腔的二值图像;步骤二:根据二值图像建立相应的包括传感器模型和待测内含物在内的EIT仿真模型,胸腔轮廓形状用于建立传感器模型,肺部形状用于建立一定电导率的内含物;步骤三:考虑模型误差,在EIT仿真模型基础上进行数据增强,操作步骤如下:[1]传感器模型中的每个电极会发生一定的随机移动,以此来模拟实际贴电极时的位置偏差;[2]对每一组仿真电压随机加入一定的高斯噪声,以此模拟实际测量系统的噪声;[3]仿真模型中的肺部内含物会根据实际测量中待测对象可能出现的情况作相应的变化,得到经过数据增强后的待测肺部图像;步骤四:求解上一步骤处理后的仿真模型正问题,得到图像重建所需的边界测量电压,建立CNN模型,测量电压和胸腔二值图像作为CNN模型的输入,上一步骤中[3]处理后的待测肺部图像作为CNN模型的输出;CNN模型主要包括两部分:可学习预重建器,用来得到一个预重建结果,实现输入数据从传感器信号域到图像域的转换;图像后处理网络,接受预重建器的输出图像,还输入胸腔轮廓图像来指导减小模型误差;所构造的可学习预重建器表达式为...

【技术特征摘要】
1.一种基于空洞卷积网络的电阻抗图像重建方法,包括下列步骤:步骤一:从已有的人体胸腔影像图像集中提取待测肺部形状和胸腔轮廓形状,得到肺部和胸腔的二值图像;步骤二:根据二值图像建立相应的包括传感器模型和待测内含物在内的EIT仿真模型,胸腔轮廓形状用于建立传感器模型,肺部形状用于建立一定电导率的内含物;步骤三:考虑模型误差,在EIT仿真模型基础上进行数据增强,操作步骤如下:[1]传感器模型中的每个电极会发生一定的随机移动,以此来模拟实际贴电极时的位置偏差;[2]对每一组仿真电压随机加入一定的高斯噪声,以此模拟实际测量系统的噪声;[3]仿真模型中的肺部内含物会根据实际测量中待测对象可能出现的情况作相应的变化,得到经过数据增强后的待测肺部图像;步骤四:求解上一步骤处理后的仿真模型正问题,得到图像重建所需的边界测量电压,建立CNN模型,测量电压和胸腔二值图像作为CNN模型的输入,上一步骤中[3]处理后的待测肺部图像作为CNN模型的输出;CNN模型主要包括两部分:可学习预重建器,用来得到一个预重建结果,实现输入数据从传感器信号域到图像域的转换;图像后处理网络,接受预重建器的输出图像,还输入胸腔轮廓图像来指导减小模型误差;所构造的可学习预重建器表达式为式中J为传...

【专利技术属性】
技术研发人员:任尚杰孙凯董峰
申请(专利权)人:天津大学
类型:发明
国别省市:天津,12

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