一种基于RRBLUP的全基因组预测方法和装置制造方法及图纸

本发明专利技术实施例提供一种基于RRBLUP的全基因组预测方法和装置，所述方法包括：获取待预测的杂交种的基因型数据；根据预先建立的RRBLUP预测模型和所述杂交种的基因型数据，对杂交组合后代的表型数据进行预测，得到表型数据预测结果；结合育种资源和规模，根据所述表型数据预测结果，选择具有高产潜力的候选杂交组合。利用本发明专利技术提供的方法可根据亲本基因型推测杂种的基因型，从而对其表型数据进行预测，进而推荐具有高产潜力的杂交组合。

【技术实现步骤摘要】
一种基于RRBLUP的全基因组预测方法和装置
本专利技术实施例涉及育种
，尤其涉及一种基于RRBLUP的全基因组预测方法和装置。
技术介绍
作物育种的主要目标是培育出比市场上现有品种具有更好表现的新品种。利用杂种优势的杂交育种可以培育出表现比亲本更加优良的杂交品种。如杂交水稻、杂交玉米等的推广应用增加了粮食产量，为全球粮食安全的保障做出了贡献。在杂交育种的过程中，需要通过杂交获得大量的杂交种，并在田间进行多轮多级筛选，然后进行多年多点的测试，最终获得尽可能符合人们预期的新品种。随机亲本的杂交后代的农艺性状表现具有一定程度的未知性和不确定性，因此杂交育种是一个结果充满未知，需要不断尝试的过程，运气也是一定程度上影响成功与否的一个因素。育种家们在以往的工作中已经收集、开发或积累了许多可用于杂交育种的自交系亲本。同时，双单倍体(DH)等新的生物技术为育种家开发新的育种亲本提供了便利。相较于以往收集并保存种质资源的做法，利用DH技术可在短时间内获得大量可用于二次杂交育种的纯合亲本。可以产生的组合数是一个关于亲本材料数的非线性增长函数，可用以下公式表示：H＝f(P)＝P(P-1)/2其中本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于RRBLUP的全基因组预测方法，其特征在于，包括：获取待预测的杂交种的基因型数据；根据预先建立的RRBLUP预测模型和所述杂交种的基因型数据，对杂交组合后代的表型数据进行预测，得到表型数据预测结果；结合育种资源和规模，根据所述表型数据预测结果，选择具有高产潜力的候选杂交组合。

【技术特征摘要】
1.一种基于RRBLUP的全基因组预测方法，其特征在于，包括：获取待预测的杂交种的基因型数据；根据预先建立的RRBLUP预测模型和所述杂交种的基因型数据，对杂交组合后代的表型数据进行预测，得到表型数据预测结果；结合育种资源和规模，根据所述表型数据预测结果，选择具有高产潜力的候选杂交组合。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述杂交种的基因型数据根据自交系亲本或DH系亲本的纯合基因型推测得到。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述RRBLUP预测模型的建立步骤为：获取用于建模的群体中杂交种的表型数据和基因型数据并进行处理；通过处理后的数据，利用RRBLUP算法对分子标记的效应进行估计，得到所述RRBLUP预测模型。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述RRBLUP算法为：Y＝Xb+Wm+e；其中:Y是训练群体中各杂种的表型向量；X是长度等于训练群体中各杂种数目，元素值均为1的向量；b是计算出的固定效应，即训练群体中各杂种的表型平均值；W是对基因型进行编码得到的关联矩阵；m是根据模型估算出的分子标记效应向量；e是残余误差。5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述RRBLUP预测模型中b和m的估计值可通过线性代数预算求解以下方程得到：其中:X长度等于训练群体中各杂种数目，元素值均为1的向量；X'是将X转置后的得到的向量；W是对基因型进行编码得到的关联矩阵；W'是将W转置后的得到的向量；I为单位矩阵；ha2是目...

【专利技术属性】
技术研发人员：邹继军，林海艳，钟敬，傅军，杨世超，杨益民，黄喆，杜海萧，李可，伊凡·舒斯特尔，王冰冰，
申请(专利权)人：袁隆平农业高科技股份有限公司，中信科技发展有限公司，长沙百奥云数据科技有限公司，
类型：发明
国别省市：湖南,43