一种SNP位点分析方法及系统技术方案

本发明专利技术涉及一种SNP位点分析方法及系统。所述的SNP位点分析方法包括：获取标准SNP序列；将标准SNP序列进行标注；获取样本SNP序列；将样本SNP序列进行峰图处理，并标记第二峰；去除样本SNP序列末端的杂峰；将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比；统计样本序列的基因型并输出结果。本发明专利技术所述的SNP位点分析方法主要对SNP位点进行对比统计与分析。

【技术实现步骤摘要】
一种SNP位点分析方法及系统
本专利技术涉及生物信息学、分子生物学、统计学及计算机编程领域，具体涉及一种SNP位点分析方法及系统。
技术介绍
SNP为单核苷酸多态性的简称，是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。现阶段SNP成为第三代遗传标志，是人类基因组计划走向应用的重要步骤。研究表明在人类基因组中每300碱基对就出现一次。大量的SNP位点与人的疾病用药有关。现阶段SNP大量用在高危人群发现、疾病相关基因的鉴定、药物的设计、测试、筛选已有生物学的基础研究等。由于SNP应用的领域广泛检测与筛查的量也随之增大，对于SNP序列的位点基因型数据的分析尤为重要。现阶段的技术可以查找全基因组外显子基因变异情况，是结合高通量二代测序应用的软件技术，主要是针对原始数据的分析。本专利技术主要针对已知SNP位点的比对统计分析。
技术实现思路
本专利技术解决的技术问题是，提供了一种SNP位点分析方法及系统。所述的一种SNP位点分析方法及系统针对SNP位点进行对比统计与分析。为了解决上述技术问题，本专利技术提供的技术方案为：一种SNP位点分析方法，其本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种SNP位点分析方法，其特征在于，包括：获取标准SNP序列；将标准SNP序列进行标注；获取样本SNP序列；将样本SNP序列进行峰图处理，并标记第二峰；去除样本SNP序列末端的杂峰；将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比；统计样本序列的基因型并输出结果。

【技术特征摘要】
1.一种SNP位点分析方法，其特征在于，包括：获取标准SNP序列；将标准SNP序列进行标注；获取样本SNP序列；将样本SNP序列进行峰图处理，并标记第二峰；去除样本SNP序列末端的杂峰；将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比；统计样本序列的基因型并输出结果。2.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法，其特征在于，所述的将标准SNP序列进行标注，具体为标注基因型及SNP所在基因序列中的位置。3.根据权利要求2所述的一种SNP位点分析方法，其特征在于，所述的将标准SNP序列进行标注后，将标准SNP序列以多个文件或镜像存储形式进行存储，形成标准数据库。4.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法，其特征在于，所述的去除样本SNP序列末端的杂峰后还包括：将SNP序列进行拼接。5.根据权利要求1所述的一种SNP位点分析方法，其特征在于，所述的将标准SNP序列与样本SNP序列进行对比，具体为根据标准SNP序列，在样本SNP序列中显示相对应的位点并用不同颜色标记。6.根据权利要求7所述的一种SNP位点分析方法，其特征在于，所述的将标准SNP序列与样本SNP序...

【专利技术属性】
技术研发人员：范绍钦，
申请(专利权)人：广州合众生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东,44