本发明专利技术提供了一种与绵羊饲料转化率相关的分子标记，以及该分子标记的检测方法和应用。本发明专利技术通过对绵羊ZEB2基因进行PCR扩增和序列分析，发现在扩增片段的第645位存在一个T/C多态性位点，进一步使用PCR‑RLPF对137只湖羊的多态性位点进行检测和建立最小二乘模型，对基因型和饲料转化率进行关联分析，最终确定了本发明专利技术扩增的ZEB2基因片段可以作为与绵羊饲料转化率相关的分子标记，以及C等位基因为优势等位基因。本发明专利技术的分子标记可用于节粮型绵羊的选育和节粮型优质肉羊新品种的培育，为绵羊饲料转化率的遗传改良提供了基因工程手段，具有重大的实际应用价值。
【技术实现步骤摘要】
一种与绵羊饲料转化率相关的分子标记及其应用
本专利技术属于分子标记制备
，具体涉及ZEB2基因片段作为影响绵羊饲料转化率的分子标记及其应用。
技术介绍
随着经济的发展，人们对肉类的需求量越来越大，其中，羊肉为需求量比较大的食材之一。据统计，目前全国绵，山羊存栏3亿只左右(赵有璋.国内外养羊业发展趋势、问题和对策.现代畜牧兽医,2015,(09):63-68)，我国人口众多，但牧场有限，多数羊是在舍饲条件下喂养，对粮食依赖性大，如何最大程度的缓解人畜争食的矛盾，提高羊群饲料转化率，已经变得越来越重要。在不影响动物正常生长的前提下降低饲料投入的遗传改良所涉及的指标即畜禽的饲料利用率。动物的饲料利用率指其对所采食饲粮的利用效率，主要受饲粮以及动物两方面因素的影响。饲料效率(Feedefficiency，FE)是饲料转化率(Feedconversionration，FCR)的简称，也叫饲料报酬，一般情况下饲料转化率是指动物增重1kg所消耗的饲料量，即料重比(feedintake/gain，F/G)，是长期以来人们使用的衡量饲料利用率高低的一项重要经济指标。另外，增重饲料比(gain/feedintake，G/F)都是表示畜禽增重和日粮采食量之间关系的指标(LancasterPA,CarstensGE,JrCD,etal.PhenotypicandgeneticrelationshipsofresidualfeedintakewithperformanceandultrasoundcarcasstraitsinBrangusheifers.JournalofAnimalScience,2009,87(12):3887-3896)，饲料转化率在国内外被广泛应用，在肉产品生产中用料肉比，而禽蛋生产中则用料蛋比。要改善饲料转化率就要从提高畜禽增重或肉蛋产量和降低饲料消耗两方面入手(AggreySE,KarnuahAB,SebastianB,etal.Geneticpropertiesoffeedefficiencyparametersinmeat-typechickens.GeneticsSelectionEvolution,2010,42(1):1-5.AggreySE,RekayaR.DissectionofKoch'sresidualfeedintake:implicationsforselection.PoultryScience,2013,92(92):2600-2605)。研究表明饲料转化率的遗传力为0.26～0.41，属中等遗传力性状，受遗传控制且能够通过选择改良(WillemsOW,MillerSP,WoodBJ.Assessmentofresidualbodyweightgainandresidualintakeandbodyweightgainasfeedefficiencytraitsintheturkey(Meleagrisgallopavo).GeneticsSelectionEvolution,2013,45(1):1-8)。依据科学的数据，对羊群进行选种选配，遗传改良(莫负涛.不同RFI育肥羔羊生产性能和体组成及消化代谢研究.甘肃农业大学,2016)，是可行的方法之一。如何确定科学依据，是我们要解决的难题之一。目前，大多数指标是跟据动物表型进行分析，从基因层面上对绵羊饲料转化率进行的系统分析还很少。ZEB2，(zinc-fingerE-boxbindinghomeobox2),又称Smad结合蛋白(Smad-interactingprotin1，SIP1),属于E盒结合锌指蛋白(ZincfingerE-boxbindingprotein,ZEB)家族。ZEB2在人类胚胎中枢神经系统以及周围神经系统均有高水平的表达。此外，ZEB2也参与了对肿瘤细胞凋亡、细胞周期以及复制衰老等方面的调控(刘晓蕾.ZEB2和Smad1相互作用对Nanog调控作用研究.西北农林科技大学,2014)。ZEB2也是一种转录因子，最初研究认为ZEB2在于细胞核内，但是随着研究的深入开展，发现ZEB2不但在细胞核内，其在细胞的胞浆以及胞核中都有表达，还参与了细胞的炎症反应以及细胞的形成、生长、分化、凋亡、胚胎发育等多种生命活动调控(段训凰.miR-203和ZEB2直接相互作用抑制EMT信号通路减少肺腺癌化疗耐药.南方医科大学,2016)。MartínezR等利用基因芯片研究发现ZEB2基因也对牛的体重有影响(MartínezR,BejaranoD,GómezY,etal.Genome-wideassociationstudyforbirth,weaningandyearlingweightinColombianBrahmancattle.Genetics&MolecularBiology,2017,40(2):453-459.)。ZEB2基因更多是在医学癌症，和肿瘤方面研究，在关于动物生长性状方面的研究比较少，绵羊饲料转化率是由微效多基因影响，本专利技术通过对ZEB2基因进行测序和分析，探讨其不同基因型与绵羊饲料转化率的相关性，旨在为绵羊良种选育方面提供参考依据，为我国优良绵羊品种的培育提供基因工程手段。
技术实现思路
本专利技术的目的在于克服现有技术的缺陷，提供了一种作为与绵羊饲料转化率相关的分子标记及其应用。本专利技术的分子标记从绵羊ZEB2基因中扩增得到，其具体核苷酸序列如SEQIDNO:1所示。通过克隆绵羊ZEB2基因的DNA序列并测序，寻找ZEB2基因的多态性位点，从而可以建立绵羊饲料转化率相关分子标记的检测方法，并可将该分子标记应用于节粮型优质肉羊新品种的培育中。具体地，本专利技术的技术方案如下所述：一方面，本专利技术提供了一种与绵羊饲料转化率相关的分子标记，该分子标记对通过对绵羊ZEB2基因进行扩增而获得，具体的，该分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示，即AGCAGCAACAACAGCAATGAGGACGAGCTCAAGGTGGGAAAAGTAAAGAAGGGGCCATACTTGATGAGGCCACACATCTTCCAGTAGTTTCCATTCCAGCAGGCCACTTGCTCTGTGCGGTTCTGGGATCACAACCGGGTGTAATGAGAAGAGTCCTGGACTCGGTTCAGGAAACTCTGGCTTCTGGCCCCCCAGCCCTGCCATCCAATCATAGCCTGGCCATGGCACATCCCCTAACCTCTCTGGACCTCATGTCCCTAGCTGTAAAATGTAGGGATTGAATGGGGGTTGCAAACTGGTGGCTGACAGATGTGTTTGGTTTGGCTCACAGAGTATCTTAAACACATTCGAATTGGTTGCCAATATTTTAAAATTGGGCAGTTTCACTCGCAGAGTCAGATTTCAAGCACCTCTGGAGAGCTCGGAAGATATGACATCTCTGGCCTACATTGATGCCTGGAAAGGCCGTGAGAGAACTCCTCCTGCTTCCCCTTGGAAGGATAGCTCCCCACCACGCCTCACCAGCTTGGT本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与绵羊饲料转化率相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中第645bp处的Y是T或C，该突变导致分子标记的T/C多态性。
【技术特征摘要】
1.一种与绵羊饲料转化率相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示，其中第645bp处的Y是T或C，该突变导致分子标记的T/C多态性。2.一种检测权利要求1所述的分子标记的PCR引物对，其特征在于，所述引物对的正向引物的核苷酸序列如SEQIDNO:2所示，反向引物的核苷酸序列如SEQIDNO:3所示。3.一种检测权利要求1所述的分子标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求2的引物对。4.如权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中还包含了Bpu10I限制性内切酶。5.一种检测权利要求1所述的分子标记的方法，其包括如下步骤：a)使用权利要求2所述引物对，或者权利要求3所述的试剂盒，对绵羊基因组DNA进行扩增；b)对步骤...
【专利技术属性】
技术研发人员：王维民，张德印，张小雪，李冲，喇永富，李国泽，
申请(专利权)人：甘肃农业大学，
类型：发明
国别省市：甘肃,62
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