The invention discloses a method for determining sandalwood genome specific sequence and a method for identifying sandalwood, which relates to the field of gene technology. The method includes: obtaining sandalwood genome sequencing data from gene database to determine sandalwood candidate region sequence; aligning sandalwood candidate region sequence with other species genome sequence in gene database, eliminating sandalwood candidate region sequence that can align with other species genome sequence, retaining specific and unable to align with other species genome sequence and using it as sandalwood nucleus. The sandalwood nucleotide specific sequence is mapped to sandalwood genome to determine the location information of sandalwood nucleotide specific sequence in the sandalwood genome. Identification method: Sandalwood was identified by SEQ ID NO.1 nucleotide sequence. By acquiring sandalwood nucleotide specific sequence and utilizing its specificity, the invention identifies the genuineness and falseness of sandalwood from the point of view of gene, and improves the accuracy of sandalwood identification results.
【技术实现步骤摘要】
一种檀香基因组特异序列的确定方法和檀香的鉴定方法
本专利技术涉及生物基因
,尤其涉及一种檀香基因组特异序列的确定方法和檀香的鉴定方法。
技术介绍
檀香(SantalumalbumL)为檀香科(Santalaceae)常绿半寄生植物,在檀香科中檀香油含量最高,具有重要的经济价值。檀香的心材是名贵的中药材;根部、主干等碎材可以提炼俗称“液体黄金”的檀香精油;幼枝和生长过程中修剪下的枝条是高档香制品原材料。最早《本草纲目》记录“治噎膈吐食。又面生黑子,每夜以浆水洗拭令赤,磨汁涂之”,檀香味辛、性温、无毒具有理气和胃等功效,可治心腹疼痛,胸膈不舒。在《中国药典》(1990年版)中首次记载檀香心材具有药用价值。由于檀香全身都是宝,具有巨大的经济价值。近年来,人们对其进行了过度的开发和利用,从而导致檀香木野生资源逐渐减少,甚至匮乏,目前檀香已被列入濒危野生动植物种国际公约(CITES)管制。由于市场的需求逐渐增加,一些人为了追逐利益,使用构造相似的梓木、柏木和黄杉木等来仿造檀香木,从而造成严重的不良的影响。因此,针对上述情况,对檀香木进行准确的鉴别显得尤为重要。檀香的鉴别已有一些传统方法,包括通过显微特性、药材性状和生理生化性状来判断组织结构以及使用气质联用仪(GC-MS)进行成分分析等,但上述通过物理特征鉴别方法无法区分外观、纤维结构相近的仿造品(如扁柏、桂华木等);而生理生化性状鉴别容易受到低温环境的影响,影响鉴别结果;气质联用仪的成分分析是定性鉴别方法,试验要求控温且样本需求量较大,并且试剂杂质对鉴别结果准确性也存在影响。因此,亟需寻找一种可准确鉴别檀香的 ...
【技术保护点】
1.一种檀香基因组特异序列的确定方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:从基因数据库中获取檀香基因组测序数据,确定檀香候选区域序列;将所述檀香候选区域序列比对所述基因数据库中其他物种基因组序列,从所述檀香候选区域序列中剔除能比对上所述其他物种基因组序列,保留特异无法比对上所述其他物种基因组序列并将其作为檀香核苷酸特异序列;将所述檀香核苷酸特异序列映射至所述檀香基因组,确定所述檀香核苷酸特异序列在所述檀香基因组中的位置信息。
【技术特征摘要】
1.一种檀香基因组特异序列的确定方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:从基因数据库中获取檀香基因组测序数据,确定檀香候选区域序列;将所述檀香候选区域序列比对所述基因数据库中其他物种基因组序列,从所述檀香候选区域序列中剔除能比对上所述其他物种基因组序列,保留特异无法比对上所述其他物种基因组序列并将其作为檀香核苷酸特异序列;将所述檀香核苷酸特异序列映射至所述檀香基因组,确定所述檀香核苷酸特异序列在所述檀香基因组中的位置信息。2.如权利要求1所述的一种檀香基因组特异序列的确定方法,其特征在于,所述檀香核苷酸特异序列包括SEQIDNO.1所示核苷酸序列。3.一种檀香的鉴定方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:将权利要求1或2所述檀香核苷酸特异序列和所述位置信...
【专利技术属性】
技术研发人员:谢尚潜,栾美薇,邢剑锋,
申请(专利权)人:海南大学,
类型:发明
国别省市:海南,46
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