与小麦苗期根系构型相关的KASP标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一个与小麦苗期根系构型相关的SNP位点，该位点位于小麦4D染色体16.64Mb位置处的基因的第36位。本发明专利技术还基于该SNP位点开发了KASP标记专用引物、包含该KASP标记引物的试剂盒以及利用该KASP标记引物鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的方法。本发明专利技术的KASP标记专用引物可用于鉴定待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型可确定AA基因型的待测小麦的根系性状优于AG或GG基因型的待测小麦，进而用于筛选苗期根系性状优良的小麦品种。

KASP Markers Related to Root Architecture of Wheat Seedlings and Their Application

The present invention relates to an SNP locus associated with root architecture at seedling stage of wheat, which is located at position 36 of the gene at 16.64Mb of 4D chromosome of wheat. The present invention also develops a KASP marker specific primer, a kit containing the KASP marker primer and a method for identifying or assisting wheat root traits by using the KASP marker primer. The special primer for KASP marker can be used to identify the genotype of wheat to be tested. According to the genotype of wheat to be tested, it can be determined that the root traits of AA genotype of wheat to be tested are better than those of AG or GG genotype of wheat to be tested, and then it can be used to screen wheat varieties with good root traits at seedling stage.

【技术实现步骤摘要】
与小麦苗期根系构型相关的KASP标记及其应用
本专利技术涉及生物
，具体地涉及与小麦苗期根系构型相关的KASP标记引物、包含该KASP标记引物的试剂盒以及利用该KASP标记引物鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的方法。
技术介绍
根系作为支撑和固定植物地上部重要器官，也是合成多种激素、氨基酸物质的主要场所，优良的根系构型及根际进程为植株养分高效利用提供重要保障，并在促进作物生长与产量形成方面起关键支撑作用(Kaushik等，2017)。植物生长初期根系发育对养分施入极为敏感，利用遗传育种方法掌握与地上部生长发育相适应并具有持久稳定活力的根系成为现代分子育种技术的重要环节。小麦根系构型不仅是奠定植株生长势强弱的基础，还与其抗旱、抗干热风能力密切相关。结合当今世界范围内极端气候频发及资源稀缺，培育高产稳产抗逆的小麦品种已经成为育种家们的研究热点。针对不同基因型小麦根系特性差异，挖掘苗期根系生长发育遗传调控机制,可为抗旱节水小麦品种选育过程中正确选择根系指标提供科学依据，对旱地小麦高产、高效栽培及充分利用土壤资源具有重要意义(Baker等，2015)。由于根生长于地下，对其开展取样研究存在较本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种KASP标记引物组，其特征在于所述KASP标记引物组包括上游引物F1、上游引物F2及下游引物R中的至少两种引物，其中所述上游引物F1的序列如序列1所示；所述上游引物F2的序列如序列2所示；所述下游引物R的序列如序列3所示。

【技术特征摘要】
1.一种KASP标记引物组，其特征在于所述KASP标记引物组包括上游引物F1、上游引物F2及下游引物R中的至少两种引物，其中所述上游引物F1的序列如序列1所示；所述上游引物F2的序列如序列2所示；所述下游引物R的序列如序列3所示。2.权利要求1所述的KASP标记引物组，其特征在于所述上游引物F1包括自5’端到3’端依次排列的FAM荧光序列和第22-39位的单链DNA，所述FAM荧光序列是序列1中的第1-21位所示的单链DNA，其核苷酸序列如序列9所示；所述上游引物F2包括自5’端到3’端依次排列的HEX荧光序列和第22-39位的单链DNA，所述HEX荧光序列为序列2中的第1-21位所示的单链DNA，其核苷酸序列如序列10所示。3.一种用于鉴定或辅助鉴定待测小麦根系性状的试剂盒，其特征在于所述试剂盒包含权利要求1或2所述的KASP标记引物组。4.一种DNA片段，其特征在于所述DNA片段位于小麦4D染色体16.64Mb位置处，且其核苷酸序列如序列4所示。5.一种与小麦苗期根系构型相关的SNP位点，其特征在于所述SNP位点位于小麦4D染色体16.64Mb位置处的基因的第36位，所述基因的核苷酸序列如序列4所示。6.一种鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的方法，其特征在于所述方法包括以下步骤：1)检测待测小麦4D染色体16.64Mb位置处的基因的第36位脱氧核糖核苷酸的基因型是AA、GG和AG中的哪一种；以及2)根据步骤1)所获得的所述待测小麦的基因型确定AA基因型的待测小麦的根系性状优于GG或AG基因型的待测小麦，其中所述AA基因型为4D染色体16.64Mb位置处的基因的第36位脱氧核糖核苷酸为A的纯合体；所述AG基因型为4...

【专利技术属性】
技术研发人员：肖永贵，杨梦娇，武玉莹，何中虎，夏先春，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：北京,11