水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记及应用制造技术

本发明专利技术提供水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记，包括标记SNP1和/或标记SNP2，其中，标记SNP1所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2886707碱基处，该处碱基为G或A；标记SNP2所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2888118碱基处，该处碱基为G或A。针对所述分子标记分别设计特异性扩增引物，通过PCR扩增进行Pi36基因型的检测。本发明专利技术的分子标记为共显性，可有效区分3种不同基因型，所述分子标记可用于选育抗稻瘟病水稻，缩短抗稻瘟病水稻的育种周期，加快育种速度，降低育种成本，具有操作简单，成本低廉，周期短等优点。

Co-dominant Molecular Markers of Rice Blast Resistance Gene Pi36 and Their Application

The present invention provides co-dominant molecular markers of rice blast resistance gene Pi36, including markers SNP1 and/or SNP2, in which the polymorphic loci contained in the marker SNP1 are located at the base of 2886707 corresponding to rice Nippon Qing 8, where the base is G or A; and the polymorphic loci contained in the marker SNP2 are located at the base of 2888118 corresponding to rice Nippon Qing 8, where the base is G or A. \u3002 Specific amplification primers were designed for the molecular markers, and the genotype of Pi36 was detected by PCR amplification. The molecular marker of the invention is co-dominant and can effectively distinguish three different genotypes. The molecular marker can be used for breeding rice resistant to blast, shortening the breeding cycle of rice resistant to blast, speeding up the breeding speed and reducing the breeding cost, and has the advantages of simple operation, low cost and short cycle.

【技术实现步骤摘要】
水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记及应用
本专利技术属于分子生物学及植物分子育种领域，具体地说，涉及水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记及应用。
技术介绍
水稻作为我国主要粮食经济作物，常年遭受来自病虫害的威胁，其中稻瘟病是危害最为严重的病害之一。在中国各个水稻产区，稻瘟病每年都有发生，病虫盛行时产量可减少10％～20％，较严重地区可达40％～50％，甚至绝收。大量使用抗稻瘟病药剂可缓解稻瘟病的危害但也大幅度增加了水稻生产的成本，且污染环境，实践表明选育抗稻瘟病品种是控制稻瘟病最为经济有效的措施。但由于稻瘟病生理小种众多、变异快，往往新推出的抗病品种在种植不久后便丧失抗性从而降低了利用价值。因此发掘及利用不同抗稻瘟病基因，培育具有不同抗病基因的水稻品种对选育广谱、持久抗稻瘟病品种具有重要作用。常规抗病育种中，抗性鉴定繁琐、需投入较多人力及成本、鉴定易受外界条件影响而导致结果不准确，因此育种效率偏低。分子标记辅助育种是一种利用与功能基因紧密连锁或基因内功能标记，在后代中结合基因型和表性鉴定对目标形状进行选择的现代育种技术。该方法可以极大缩短育种年限，提高育种效率，而且还节约了大量本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记，其特征在于，包括标记SNP1和/或标记SNP2，其中，标记SNP1所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2886707碱基处，该处碱基为G或A；标记SNP2所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2888118碱基处，该处碱基为G或A。

【技术特征摘要】
1.水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记，其特征在于，包括标记SNP1和/或标记SNP2，其中，标记SNP1所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2886707碱基处，该处碱基为G或A；标记SNP2所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2888118碱基处，该处碱基为G或A。2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，标记SNP1的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示，标记SNP2的核苷酸序列如SEQIDNO:2所示。3.用于检测权利要求1所述分子标记的ARMS-PCR引物，其特征在于，用于检测标记SNP1的引物包括Pi36-RR和Pi36-RF，其核苷酸序列如SEQIDNO:3-4所示；用于检测标记SNP2的引物包括Pi36-SF和Pi36-SR，其核苷酸序列如SEQIDNO:5-6所示。4.含有权利要求3所述引物的检测试剂或试剂盒。5.权利要求1或2所述分子标记、权利要求3所述引物或权利要求4所述检测试剂或试剂盒的以下任一应用：1)在水稻抗稻瘟病基因Pi36的基因型鉴定中的应用；2)在鉴定及筛选抗稻瘟病水稻种质资源中的应用；3)在抗稻瘟病水稻品种分子标记辅助育种中的应用。6.水稻抗稻瘟病基因...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨远柱，邓钊，刘兰兰，王凯，秦鹏，符辰建，严天泽，周延彪，
申请(专利权)人：袁隆平农业高科技股份有限公司，湖南隆平高科种业科学研究院有限公司，湖南亚华种业科学研究院，
类型：发明
国别省市：湖南,43