黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法及其应用技术

技术编号:20415351 阅读:47 留言:0更新日期:2019-02-23 05:41
本发明专利技术公开了一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法及其应用,根据黄牛SPARC基因SNP位点(g.12545 C>T)为C或T的碱基多态性,以待测黄牛基因组DNA为模板,以突变受阻扩增引物PCR扩增黄牛SPARC基因部分片段;扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定黄牛SPARC基因的基因型;本发明专利技术可以在DNA水平上检测与黄牛生长性状关联的分子标记,以加快黄牛的早期选育,培育出生长性状优良的黄牛种群。

【技术实现步骤摘要】
黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法及其应用
本专利技术属于分子遗传学领域,涉及基因单核苷酸多态性(SNP)的检测,特别涉及一种SPARC基因单核苷酸多态性位点辅助快速检测黄牛生长性状的方法。
技术介绍
单核苷酸多态性(SNP)是由广泛分布于动物基因组中的单个核苷酸位点上的遗传多态性,可以发生在编码区和非编码区(内含子或基因间)(Dang等,2014)。如果突变是错义类型,发生在CDS区域的SNP将改变并影响蛋白质。另一种情况是SNP发生在CDS区域,但没有修改基因的编码,称之为同义突变,原因是密码子的简并性。SNP会引起动物表型差异。SPARC也称为骨粘连蛋白、基底膜40蛋白,是一种富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白,于1981年由Termine等人首次提取(Zhao等,2007)。SPARC广泛分布于体内。由于其特殊的结构,它具有抑制细胞周期,细胞粘附和转移,以及细胞和基质之间调节的作用。同时,SPARC还可以进行组织修复,血管生成等功能的调解(Alkabie等,2016)。SPARC已成为研究肥胖和糖尿病等疾病的新方向(Harriesetal,2013)。由于其高氨基酸同源性本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:以待测黄牛基因组DNA为模板,以引物对P1和引物对P2作为突变受阻扩增的外引物和内引物,PCR扩增黄牛SPARC基因部分片段,对扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SPARC基因单核苷酸多态性位点的基因型。

【技术特征摘要】
1.一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:以待测黄牛基因组DNA为模板,以引物对P1和引物对P2作为突变受阻扩增的外引物和内引物,PCR扩增黄牛SPARC基因部分片段,对扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SPARC基因单核苷酸多态性位点的基因型。2.根据权利要求1所述一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法,其特征在于:所述黄牛SPARC基因单核苷酸多态性位点为对应于牛SPARC基因参考序列NC_007305.6上的突变位点g.12545C>T。3.根据权利要求1所述一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法,其特征在于:所述引物对P2为:上游内引物:5’-TGGAAGTAGGAGAATTCGATGATGGTTCC-3’;下游内引物:5’-CCACCACCTCCTCTTCGGTTTCCGCA-3’。4.根据权利要求1所述一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法,其特征在于:所述引物对P1为:上游外引物:5’-CCATCCTCTGTGGGTACCCAAGGCTTT-3’;下游外引物:5’-CGTTTCCTTGGGAAGGAACCTCACACAG-3’。5.根据权利要求1所述一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测...

【专利技术属性】
技术研发人员:黄永震张丹阳王大会安清明徐嘉威贺花张子敬王献伟王二耀陈宏雷初朝胡沈荣
申请(专利权)人:西北农林科技大学
类型:发明
国别省市:陕西,61

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