一种培育松散型水稻的方法技术

本发明专利技术公开了一种培育松散型水稻的方法：将Lemont和扬稻4号杂交组配重组自交系分离群体，对分离群体内的不同株系利用D209C、D502、RM3831、RM8264、D943、RM271等6个分子标记分别检测6个与分蘖角度相关的QTL。将标记D209C、D502、RM3831、RM8264扩增Lemont的分子标记带型分别命名为A、B、C、D；将标记D943、RM271扩增扬稻4号的分子标记带型分别命名为E、F。根据育种需要选择聚合A、B、C、D、E、F六个分子标记基因型中不同数目基因型的株系来获得不同松散程度的水稻育种材料。

A Method of Cultivating Loose Rice

The invention discloses a method for cultivating loose rice: Lemont and Yangdao No. 4 hybrids are mated to reconstitute inbred lines to separate populations, and six QTLs related to tillering angle are detected by six molecular markers such as D209C, D502, RM3831, RM8264, D943 and RM271 for different lines within the separated populations. The molecular marker bands of D209C, D502, RM3831 and RM8264 amplified Lemont were named A, B, C and D respectively, and those of D943 and RM271 amplified Yangdao 4 were named E and F respectively. According to the need of breeding, rice breeding materials with different loose degree were obtained by selecting different number of lines from six molecular marker genotypes A, B, C, D, E and F.

【技术实现步骤摘要】
一种培育松散型水稻的方法
本专利技术涉及一种聚合6个QTL培育松散型水稻的方法，该方法可利用6个分子标记快速选育出株型松散的水稻材料。
技术介绍
水稻是一种重要的粮食作物，因为水稻生产关系着我国的粮食安全。我国水稻育种界选育分蘖角度不同的水稻的传统方法都是通过表型选择进行的，即在水稻成熟期根据水稻株型的松散程度来选择不同松散类型的水稻材料，选定之后在下一代才能进一步利用。而通过分子标记对水稻分蘖角度相关基因进行选择可以在水稻苗期即对分蘖角度进行选择，选择的准确率高，在当代即可利用，比传统的表型选择方法大大提高了育种效率。水稻株型的松散程度是一个数量性状，受多个数量性状基因座位(QTL)控制。为了有效的提高育种效率，加快育种进程，本专利技术提出一种聚合6个与分蘖角度相关的QTL以培育松散型水稻的方法。本专利技术相比传统的表型选择方法更简便快速，在水稻苗期即可对株型的松散程度作出选择，因此大大提高了育种效率。
技术实现思路
本专利技术包括以下步骤：(1)将水稻品种Lemont与水稻品种扬稻4号杂交并构建重组自交系分离群体Fn，n≥6；(2)用6个分子标记D209C、D502、RM3831、RM8264、D943、RM271分别PCR扩增步骤(1)获得的分离群体内的不同株系的叶片DNA；(3)利用步骤(2)所述的6个分子标记分别检测步骤(1)描述的分离群体内的不同株系，追踪6个与水稻分蘖角度有关的数量性状基因座位；其中标记D209C定位于水稻第2染色体，用于追踪第2染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-2LE；标记D502定位于水稻第5染色体，用于追踪第5染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-5LE；标记RM3831定位于水稻第7染色体，用于追踪第7染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-7LE；标记RM8264定位于水稻第8染色体，用于追踪第8染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-8LE；标记D943定位于水稻第9染色体，用于追踪第9染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-9YD；标记RM271定位于水稻第10染色体，用于追踪第10染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-10YD；将标记D209C扩增Lemont的分子标记带型命名为A，标记D502扩增Lemont的分子标记带型命名为B，标记RM3831扩增Lemont的分子标记带型命名为C，标记RM8264扩增Lemont的分子标记带型命名为D，标记D943扩增扬稻4号的分子标记带型命名为E，标记RM271扩增扬稻4号的分子标记带型命名为F；(4)选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意5个基因型的株系以获得松散程度最大的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意4个基因型的株系以获得株型的松散程度次之的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意3个基因型的株系以获得株型的松散程度较聚合任意4个基因型的株系更小的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意2个基因型的株系以获得株型的松散程度较聚合任意3个基因型的株系更小的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内携带步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意1个基因型的株系以获得株型的松散程度最小的水稻材料。进一步地，所述步骤(3)中，分子标记基因型A的带型与利用标记D209C在Lemont上PCR扩增到的带型相同，但A并不是qTA-2LE的基因型，由于D209C与qTA-2LE基因连锁，可间接通过选择A的基因型来选择qTA-2LE的基因型；同理可根据D502与qTA-5LE连锁而通过间接选择B基因型来选择qTA-5LE的基因型；根据RM3831与qTA-7LE连锁而通过间接选择C基因型来选择qTA-7LE的基因型；根据RM8264与qTA-8LE连锁而通过间接选择D基因型来选择qTA-8LE的基因型；根据D943与qTA-9YD连锁而通过间接选择E基因型来选择qTA-9YD的基因型；根据RM271与qTA-10YD连锁而通过间接选择F基因型来选择qTA-10YD的基因型。进一步地，所述步骤(4)中，聚合不同数目的基因型的株系的平均株型松散程度按从大到小排序为：聚合A、B、C、D、E、F中的任意5个基因型＞聚合A、B、C、D、E、F中的任意4个基因型＞聚合A、B、C、D、E、F中的任意3个基因型＞聚合A、B、C、D、E、F中的任意2个基因型＞携带A、B、C、D、E、F中的任意1个基因型；需要指出的是，上述排序大小仅适用于对种植在同一个环境条件下的同一Fn世代的分离群体内的株系进行比较，所述Fn中n为固定数值。进一步地，松散型水稻定义为聚合权利要求1所述的步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的五个基因型的株系在每年5月至6月于杭州播种条件下平均分蘖角度小于72度的水稻，分蘖角度定义为最贴近地面的分蘖与地面的夹角。具体实施方式实施例1：在水稻品种Lemont和水稻品种扬稻4号杂交组配的F13代分离群体中，6个分子标记的应用。1.将水稻品种Lemont作母本，与水稻品种扬稻4号作父本进行杂交并构建F13代分离群体(Lemont为来自美国的粳稻品种，扬稻4号为来自江苏的籼稻品种，Lemont和扬稻4号由中国水稻研究所国家水稻种质资源中期库提供)，这个包括219个株系在内的F13分离群体于2017年6月30日播种在杭州市富阳区中国水稻研究所试验场。2.利用标记D209C、D502、RM3831、RM8264、D943、RM271对这个219个株系的分离群体每一株系进行PCR检测，利用标记D209C扩增Lemont的分子标记带型来追踪第2染色体上qTA-2LE基因座位的株型松散的等位基因，利用标记D502扩增Lemont的分子标记带型来追踪第5染色体上qTA-5LE基因座位的株型松散的等位基因，利用标记RM3831扩增Lemont的分子标记带型来追踪第7染色体上qTA-7LE基因座位的株型松散的等位基因，利用标记RM8264扩增Lemont的分子标记带型来追踪第8染色体上qTA-8LE基因座位的株型松散的等位基因，利用标记D943扩增扬稻4号的分子标记带型来追踪第9染色体上qTA-9YD基因座位的株型松散的等位基因，利用标记RM271扩增扬稻4号的分子标记带型来追踪第10染色体上qTA-10YD基因座位的株型松散的等位基因。将标记D209C扩增Lemont的分子标记带型命名为A，标记D502扩增Lemont的分子标记带型命名为B，标记RM3831扩增Lemont的分子标记带型命名为C，标记RM8264扩增Lemont的分子标记带型命名为D，标记D943扩增扬稻4号的分子标记带型命名为E，标记RM271扩增扬稻4号的分子标记带型命名为F。3.选择携带不同QTL数目的株系以获得平均分蘖角度不同的水稻材料(表1)。表1.在F13世代利用D209C、D502、RM3831、RM8264、D943、RM271等6个标记进行选择得到的携带不同等位基因的株系的平均分蘖角度，该F13群体于2017年本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种培育松散型水稻的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)将水稻品种Lemont与水稻品种扬稻4号杂交并构建重组自交系分离群体Fn，n≥6；(2)用6个分子标记D209C、D502、RM3831、RM8264、D943、RM271分别PCR扩增步骤(1)获得的分离群体内的不同株系的叶片DNA；(3)利用步骤(2)所述的6个分子标记分别检测步骤(1)描述的分离群体内的不同株系，追踪6个与水稻分蘖角度有关的数量性状基因座位；其中标记D209C定位于水稻第2染色体，用于追踪第2染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA‑2LE；标记D502定位于水稻第5染色体，用于追踪第5染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA‑5LE；标记RM3831定位于水稻第7染色体，用于追踪第7染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA‑7LE；标记RM8264定位于水稻第8染色体，用于追踪第8染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA‑8LE；标记D943定位于水稻第9染色体，用于追踪第9染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA‑9YD；标记RM271定位于水稻第10染色体，用于追踪第10染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA‑10YD；将标记D209C扩增Lemont的分子标记带型命名为A，标记D502扩增Lemont的分子标记带型命名为B，标记RM3831扩增Lemont的分子标记带型命名为C，标记RM8264扩增Lemont的分子标记带型命名为D，标记D943扩增扬稻4号的分子标记带型命名为E，标记RM271扩增扬稻4号的分子标记带型命名为F；(4)选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意5个基因型的株系以获得松散程度最大的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意4个基因型的株系以获得株型的松散程度次之的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意3个基因型的株系以获得株型的松散程度较聚合任意4个基因型的株系更小的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意2个基因型的株系以获得株型的松散程度较聚合任意3个基因型的株系更小的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内携带步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意1个基因型的株系以获得株型的松散程度最小的水稻材料。...

【技术特征摘要】
1.一种培育松散型水稻的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)将水稻品种Lemont与水稻品种扬稻4号杂交并构建重组自交系分离群体Fn，n≥6；(2)用6个分子标记D209C、D502、RM3831、RM8264、D943、RM271分别PCR扩增步骤(1)获得的分离群体内的不同株系的叶片DNA；(3)利用步骤(2)所述的6个分子标记分别检测步骤(1)描述的分离群体内的不同株系，追踪6个与水稻分蘖角度有关的数量性状基因座位；其中标记D209C定位于水稻第2染色体，用于追踪第2染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-2LE；标记D502定位于水稻第5染色体，用于追踪第5染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-5LE；标记RM3831定位于水稻第7染色体，用于追踪第7染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-7LE；标记RM8264定位于水稻第8染色体，用于追踪第8染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-8LE；标记D943定位于水稻第9染色体，用于追踪第9染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-9YD；标记RM271定位于水稻第10染色体，用于追踪第10染色体与分蘖角度有关的QTL：qTA-10YD；将标记D209C扩增Lemont的分子标记带型命名为A，标记D502扩增Lemont的分子标记带型命名为B，标记RM3831扩增Lemont的分子标记带型命名为C，标记RM8264扩增Lemont的分子标记带型命名为D，标记D943扩增扬稻4号的分子标记带型命名为E，标记RM271扩增扬稻4号的分子标记带型命名为F；(4)选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意5个基因型的株系以获得松散程度最大的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意4个基因型的株系以获得株型的松散程度次之的水稻材料；选择步骤(1)描述的分离群体内聚合步骤(3)描述的A、B、C、D、E、F六个基因型中的任意3个基因型的株系以获得株型的松散程度较聚合任意4个基因型的株系更小的水稻材料；选择步骤(1...

【专利技术属性】
技术研发人员：曾宇翔，杨长登，季芝娟，梁燕，陈渊，曹妮，
申请(专利权)人：中国水稻研究所，
类型：发明
国别省市：浙江,33