单基因遗传性肾脏病基因联合筛查方法、试剂盒及其制备方法技术

本发明专利技术公开了一种单基因遗传性肾脏病基因联合筛查方法、试剂盒及其制备方法，所述试剂盒包含多种遗传性肾脏病相关致病基因或疾病易感基因中全部外显子序列的特异性寡核苷酸捕获探针。本发明专利技术提供的单基因遗传性肾脏病基因联合筛查方法、试剂盒及其制备方法，先是构建受检者的全基因组DNA文库，然后利用制备的单基因遗传性肾脏病基因筛查试剂盒捕获靶基因序列，再通过高通量测序平台的双端150bp测序模式对样本进行检测，生物信息学分析数据结果，从而能够快速、准确地找出与遗传性肾脏病相关基因的突变信息位点，以达到基因诊断的目的，且能够覆盖目前已知的所有遗传性肾脏病基因的外显子区域。

Gene screening method, kit and preparation method for single gene hereditary nephropathy

The invention discloses a method, a kit and a preparation method for joint screening of single gene hereditary kidney disease genes. The kit comprises a specific oligonucleotide capture probe for all exon sequences of various hereditary kidney disease related pathogenic genes or disease susceptibility genes. The method, kit and preparation method of the single gene hereditary kidney disease gene joint screening provided by the invention are as follows: firstly, the whole genome DNA Library of the examinee is constructed, then the target gene sequence is captured by the prepared single gene hereditary kidney disease gene screening kit, and then the sample is detected by the double-ended 150 BP sequencing mode of the high throughput sequencing platform, and the bioinformatics analysis number is obtained. According to the results, we can quickly and accurately identify the mutation information sites of genes related to hereditary kidney disease, in order to achieve the purpose of gene diagnosis, and can cover all the known exon regions of hereditary kidney disease genes.

【技术实现步骤摘要】
单基因遗传性肾脏病基因联合筛查方法、试剂盒及其制备方法
本专利技术涉及一种基因筛查方法、试剂盒及其制备方法，尤其涉及一种筛查各类遗传性肾脏病的试剂盒及其制备和使用方法。
技术介绍
慢性肾脏病(CKD)为突出的全球健康问题，流行病学研究显示我国CKD的发病率为10.8％，美国为13.1％。CKD如得不到有效控制，会发展为终末期肾功能衰竭(ESRD)，为患者、家庭和社会带来沉重的负担。单基因遗传性肾脏病是CKD的重要病因，比如常染色体显性多囊肾病(ADPKD)在成人尸体解剖中发病率为1:500，占ESRD的10％左右，是我国ESRD的第四位病因。薄基底膜病(TBMD)是另一种发病率很高的单基因遗传性肾脏病，由于该病的诊断依赖肾组织电子显微镜检查，所以大量病人被漏诊或误诊，有研究指出TBMD在普通人群中的发病率可以达到1％。单基因肾脏病的种类繁多，大多数缺乏特异性临床表现，诊断依赖基因检测、肾活检和特殊检查(比如TBMD需电子显微镜检查、Fabry病需要进行α-galA酶活性检测、Alport诊断亦依赖电子显微镜和IV型胶原不同a链在皮肤或肾组织染色等)，临床诊断困难，漏误诊率极高。世界卫本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种单基因遗传性肾脏病基因筛查试剂盒，其特征在于，包含多种遗传性肾脏病相关致病基因或疾病易感基因中全部外显子序列的特异性寡核苷酸捕获探针。

【技术特征摘要】
1.一种单基因遗传性肾脏病基因筛查试剂盒，其特征在于，包含多种遗传性肾脏病相关致病基因或疾病易感基因中全部外显子序列的特异性寡核苷酸捕获探针。2.如权利要求1所述的单基因遗传性肾脏病基因筛查试剂盒，其特征在于，所述探针长度为50～105bp。3.如权利要求1所述的单基因遗传性肾脏病基因筛查试剂盒，其特征在于，所述探针以生物素标记。4.如权利要求1所述的单基因遗传性肾脏病基因筛查试剂盒，其特征在于，所述多种遗传性肾脏病相关致病基因或疾病易感基因共有如下706种：5.一种如权利要求1所述的试剂盒的制备方法，其特征在于，包括如下步骤：S1)根据人类基因组HG19序列，调取全部与遗传性肾脏病发生相关基因的外显子序列；S2)针对全部外显子序列非重复区域设计50～105bp长度的捕获探针，每个探针沿着基因位置挪动3～10bp，使得目标区域每个碱基被探针覆盖3～20次；S3)合成步骤S2)中的捕获探针，并以生物素标记。6.一种单基因遗传性肾脏病基因联合筛查方法，其特征在于，包括以下步骤：S1)获取、检测受检者的全基因组DNA样本；S2)构建受检者全基因组文库；S3...

【专利技术属性】
技术研发人员：谢静远，陈楠，熊玉宇，杨福兰，
申请(专利权)人：上海交通大学医学院附属瑞金医院，晶能医疗科技上海有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31