水稻两系不育系系谱鉴定的方法技术

本发明专利技术公开了一种水稻两系不育系系谱鉴定的方法，包括水稻基因组DNA的提取、芯片杂交、高质量SNP标记的筛选、不育基因的基因型分析、聚类获得亚群结构、分析SNP的分布情况、鉴定遗传关系等步骤。本发明专利技术以水稻全基因组SNP芯片系统为基础，分析结果准确性高，可操作性强。通过分析待测材料的全基因组信息，可鉴定水稻两系不育系不同品种之间正确的遗传关系，有利于两系杂交稻中不育系亲本的选择和进一步发展。

【技术实现步骤摘要】
水稻两系不育系系谱鉴定的方法
本专利技术属于遗传育种
，具体涉及一种水稻两系不育系系谱鉴定的方法。
技术介绍
因为不育系的发现，使得大规模发展杂交水稻成为可能。而杂交水稻从最初的三系发展到两系，因为后者不需要保持系，操作更简便，配组更容易，使得两系杂交水稻获得了迅速的发展。水稻两系不育系是两系法杂交水稻的母本，因为其具有对光照和温度的敏感而表现出可育或不育的表型，从而应用于制种和杂交配组。自从石松明发现光敏不育系材料农垦58S和邓华凤发现温敏不育系材料安农S-1以后，新的水稻两系不育系材料的创制取得了长足进展，大量高产、优质和具有更强杂种优势和配合力的两系不育系品种得到了审定和大面积推广应用，由于商业利益等驱动，导致两系不育系出现了系谱关系和遗传背景不清晰的问题，这严重影响了两系杂交稻中不育系亲本的选择和进一步发展。已有的对于水稻两系不育系系谱的研究主要基于两个方面：（1）现有的公开的系谱资料，（2）基于光敏或温敏不育基因的DNA序列开发的针对单位点的功能性标记，结合PCR和酶切及电泳技术来区分基因型。上述方法的缺点分别在于：（1）已有的研究结果标明：公开的系谱资料在很大程度上本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.水稻两系不育系系谱鉴定的方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）利用水稻全基因组SNP芯片系统，对待测的水稻两系不育系材料的叶片组织进行基因组DNA的提取和芯片杂交；获得待测材料的SNP基因型数据，并筛选出高质量的SNP标记进入后续分析；（2）选定至少一个不育基因，并分析该选定的不育基因在各个材料中的基因型，进行初步聚类，获得该选定的不育基因的亚群结构；（3）以该选定的不育基因的SNP为核心，向侧翼扩展，利用Haploview软件分析侧翼SNP在各个材料中的分布情况；以此鉴定材料之间的遗传关系。

【技术特征摘要】
1.水稻两系不育系系谱鉴定的方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）利用水稻全基因组SNP芯片系统，对待测的水稻两系不育系材料的叶片组织进行基因组DNA的提取和芯片杂交；获得待测材料的SNP基因型数据，并筛选出高质量的SNP标记进入后续分析；（2）选定至少一个不育基因，并分析该选定的不育基因在各个材料中的基因型，进行初步聚类，获得该选定的不育基因的亚群结构；（3）以该选定的不育基因的SNP为核心，向侧翼扩展，利用Haploview软件分析侧翼SNP在各个材料中的分布情况；以此鉴定材料之间的遗传关系。2.根据权利要求1所述的水稻两系不育系系谱鉴定的方法，其特征在于，所述步骤（1）还可以是：对待测水稻两系不育系材料的叶片组织进行基因组DNA的...

【专利技术属性】
技术研发人员：张先文，邓华凤，李继明，何强，贺治洲，张武汉，舒服，
申请(专利权)人：湖南杂交水稻研究中心，湖南省农业科学院，华智水稻生物技术有限公司，湖南农业大学，
类型：发明
国别省市：湖南,43