一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用，属于基因工程技术领域，具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。本发明专利技术提供的基因能够使萝卜晚抽薹开花。

A gene related to late bolting characters of radish and its application

The invention provides a gene related to late bolting character of radish and its application, which belongs to the field of genetic engineering technology and has the nucleotide sequence shown in SEQ ID No.1. The gene provided by this invention can make radish bolting and flowering late.

【技术实现步骤摘要】
一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用
本专利技术涉及基因工程
，尤其涉及一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用。
技术介绍
萝卜起源于我国，是我国重要的蔬菜作物，长期以来是我国城乡居民的“当家菜”。年播种面积1600万亩，占我国整个蔬菜生产的6％。萝卜是长日照植物，通过低温春化后在长日照条件下由营养生长转向生殖生长，从而抽薹开花。未熟抽薹开花对萝卜生产最重要的影响是营养生长向生殖生长的转变，抑制肉质根的膨大，导致产量和品质下降。发现萝卜晚抽薹基因以及培育萝卜晚抽薹品种是解决这一问题的根本途径。基于高通量RNA测序技术，在萝卜中鉴定了与晚抽薹开花性状相关的基因，发现了大量差异表达基因及控制抽薹开花的关键基因如FT、CO、SOC1、FLC和LFY。通过转录组分析，发现3个同源FLC基因(RsFLC1、RsFLC2和RsFLC3)，分别位在Rs7、Rs2和Rs3染色体上(Yietal.2014；Kitashibaetal.2014)。RsFLC基因位点上存在明显的序列变异，但是未找到与萝卜晚抽薹性状相关的新的基因序列。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，该基因能够使萝卜晚抽薹开花。为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：本专利技术提供了一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，具有SEQIDNo.1所示的核苷酸序列。本专利技术还提供了上述技术方案所述的基因在鉴别萝卜抽薹性状中的应用。优选的，所述鉴别萝卜抽薹性状的方法，包括以下步骤：将待测萝卜的基因组DNA进行PCR扩增，得到扩增产物，所述PCR扩增使用的引物为1F和1R，所述1F具有SEQIDNo.2所示的核苷酸序列，所述1R具有SEQIDNo.3所示的核苷酸序列；当所述扩增产物的片段为2417bp，且包含上述技术方案所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为晚抽薹性状；当所述扩增产物的片段为790bp，且不包含上述技术方案所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为早抽薹性状。优选的，所述PCR扩增的反应体系每30μl包括：100ng基因组DNA，2μl10×PCRBuffer，1.6μldNTPs，浓度为10μM的1F0.4μl，浓度为10μM的1R0.4μl，1.5μlTaq酶，24.1μlddH2O。优选的，所述PCR扩增的程序为：94℃预变性4min；94℃变性30s，60℃退火1min，72℃延伸1.5min，35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。本专利技术还提供了上述技术方案所述的基因序列在萝卜育种中的应用，所述萝卜育种的方法包括：利用上述技术方案所述的步骤，选择基因组中包含上述技术方案所述基因的待测萝卜作为亲本进行育种。本专利技术提供了一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，该基因与萝卜晚抽薹开花性状相关。萝卜为两年生作物，抽薹开花鉴定时间较长，利用本专利技术作为鉴定萝卜品种抽薹性状和辅助选择育种亲本应用时，能够在苗期对待测品种进行抽薹性鉴定，节省植株田间管理成本和时间。本专利技术实施例的结果显示：本专利技术提供的基因能够使萝卜晚抽薹开花。附图说明图1为萝卜抽薹开花时间性状QTL定位信息，A：抽薹开花时间初步定位于InDel162和InDel170标记之间；B：局部加密的萝卜R02染色体，候选基因RsFLC2位于标记InDel520和InDel535之间；图2为琼脂糖凝胶电泳检测基因分型情况。具体实施方式本专利技术提供了一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，具有SEQIDNo.1所示的核苷酸序列，所述核苷酸序列具体如下所示：上述技术方案所述基因与萝卜的抽薹性状相关，含有上述技术方案所述基因的萝卜的抽薹性状表现为晚抽薹性状。本专利技术还提供上述技术方案所述的基因在鉴别萝卜抽薹性状中的应用。在本专利技术中，所述鉴别萝卜抽薹性状的方法，包括以下步骤：将待测萝卜的基因组DNA进行PCR扩增，得到扩增产物，所述PCR扩增使用的引物为1F和1R，所述1F具有SEQIDNo.2所示的核苷酸序列，所述1R具有SEQIDNo.3所示的核苷酸序列；当所述扩增产物的片段为2417bp，且包含权利要求1所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为晚抽薹性状；当所述扩增产物的片段为790bp，且不包含权利要求1所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为早抽薹性状。本专利技术对所述待测萝卜的基因组DNA的提取方法没有特殊限定，采用本领域技术人员常规使用的提取方法即可，如CTAB法。在本专利技术中，所述PCR扩增使用的引物为1F和1R，所述1F具有SEQIDNo.2所示的核苷酸序列，具体如下所示：5’-ATGGGAAGAAAAAAACTAGAGAT-3’；所述1R具有SEQIDNo.3所示的核苷酸序列，具体如下所示：5’-TGCATTAATCCGTGGTAAATT-3’。在本专利技术中，所述PCR扩增的反应体系每30μl优选包括：100ng基因组DNA，2μl10×PCRBuffer，1.6μldNTPs，浓度为10μM的1F0.4μl，浓度为10μM的1R0.4μl，1.5μlTaq酶，24.1μlddH2O。本专利技术对上述试剂的来源没有特殊限定，采用本领域技术人员常规选用的市售产品即可。在本专利技术中，所述PCR扩增的程序为：94℃预变性4min；94℃变性30s，60℃退火1min，72℃延伸1.5min，35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。本专利技术还提供了上述技术方案所述的基因在萝卜育种中的应用，所述萝卜育种的方法包括：利用上述技术方案所述的步骤，选择包含上述技术方案所述基因的育种材料作为亲本。下面结合实施例对本专利技术提供的一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因及其应用进行详细的说明，但是不能把它们理解为对本专利技术保护范围的限定。实施例1与萝卜耐抽薹性状相关的基因序列的获得本专利技术利用常规的图位克隆的方法对萝卜耐抽薹性状相关的基因进行鉴定和克隆。1、遗传分离群体构建与表型鉴定以来自日本晚抽薹材料“Ninengo”和中国早抽薹材料“Maer”为双亲，构建包含183个单株的F2群体。于2016年春对亲本、F1、F2群体单株进行抽薹和开花性状调查。调查方法为：每隔一天调查单株的现蕾和开花情况。现蕾时间为从定植到肉眼可见花蕾所需的天数；开花时间为从定植到第一朵花开放所需的天数。晚抽薹材料“Ninengo”的现蕾时间和开花时间分别为91天和110天，早抽薹材料“Maer”的现蕾时间和开花时间分别为44天和66天。F2群体单株的抽薹时间变异为43～105天，平均81.27天；开花时间变异为70～121天，平均96.7天；表现为连续分布数量性状遗传的特点。2、遗传连锁图谱构建与数量性状定位(QTL)插入缺失标记(InDel)的开发：利用IlluminaHiseq2500测序平台对亲本“Ninengo”和“Maer”进行全基因组重测序，以‘AokubiDH'参考基因组(Theradishgenomeandcomprehensivegeneexpressionprofileoftuberousrootformationanddevelopment，ScientificReports(2015)5：10835)为参照检测双亲的多态性。初步设计500对InDel标记，InDel标记设计原则为每个标记在‘AokubiDH’参考基因组中的间隔距离为300～800本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。

【技术特征摘要】
1.一种与萝卜晚抽薹性状相关的基因，具有SEQIDNo.1所示的核苷酸序列。2.权利要求1所述的基因在鉴别萝卜抽薹性状中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述鉴别萝卜抽薹性状的方法，包括以下步骤：将待测萝卜的基因组DNA进行PCR扩增，得到扩增产物，所述PCR扩增使用的引物为1F和1R，所述1F具有SEQIDNo.2所示的核苷酸序列，所述1R具有SEQIDNo.3所示的核苷酸序列；当所述扩增产物的片段为2417bp，且包含权利要求1所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为晚抽薹性状；当所述扩增产物的片段为790bp，且不包含权利要求1所述的基因时，所述萝卜抽薹性状为早抽薹性状。4.根据权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员：张丽，王庆彪，
申请(专利权)人：北京市农林科学院，
类型：发明
国别省市：北京,11