【技术实现步骤摘要】
一种伴随实验生成样本ID的方法
本专利技术涉及临床医学检验领域，具体涉及一种伴随实验生成样本ID的方法。
技术介绍
大规模的实验研究特别是临床医学检验，需要严格管理实验过程，保证实验结果的可靠性、重复性和准确性。其中样本管理是非常重要的一个方面，是实验检测和结果报告的基础。在整个实验过程中，追踪和识别样本通常利用条形码的形式进行管理，但仍然存在人为、系统或者环境因素导致样本被污染或被错误标记。如果在实验过程中，样本被污染或者样本被错误标记，很难被发现，进而产生不能与样本相对应的错误实验结果，导致检测结果误判。通常行业为了避免同一批次之间避免样本污染或标记错误，需要在疑似的样本之间，进行检测数据比较，看数据是否一致，如果非重复样本的结果一致，说明其中有个样本被错误标记。如果重复样本之间的数据不一致，则说明样本被错误标记或者样本被污染。这种方法通常要先处理样本的二代测序数据，而二代测序数据规模较大，分析时间较长，产生的数据结果较多，且样本间存在冗余信息，如果将全部数据进行比较的话，费时费力，效率较慢。另外，在实验检测完成之后，为了证明样本从检测开始到结束，没有发生样本...
【技术保护点】
1.一种伴随实验生成样本ID的方法，其特征在于：包括用于生成ID的基因位点的挑选和伴随高通量测序流程生成样本编码ID两个步骤。
【技术特征摘要】
1.一种伴随实验生成样本ID的方法，其特征在于：包括用于生成ID的基因位点的挑选和伴随高通量测序流程生成样本编码ID两个步骤。2.根据权利要求1所述的伴随实验生成样本ID的方法，其特征在于：所述用于生成ID的基因位点挑选包含以下步骤：(1)检索基因组数据库：检索基因组数据库的基因型数据表中基因位点，导出所有基因位点到本地文本文件，文本文件每一行为一个基因位点；(2)生成基因型位点列表信息：对文本文件内容的进行再一次检索，如有基因位点出现两次或多次，则只保留一个，生成的文本文件为基因型位点列表文件；(3)统计每个位点的基因型频率：读取生成的基因型位点列表文件，每读取一行即一个基因位点，以该基因位点为检索条件，统计该基因位点的纯合野生基因型、杂合突变基因型和纯合突变基因型三种基因型出现的次数，每种基因型出现的次数累加得到基因位点的所有基因型出现的总次数，将每种基因型出现的次数除以该位点所有基因型出现的总次数得到该位点特定基因型的频率；循环读取和检索统计每个基因位点的相关信息，将得到结果输出至本地基因型频率数据文件；(4)缩小基因位点范围：包括以下三种缩小步骤，各个步骤顺序不限：a.根据基因型频率缩小位点范围：循环读取本地基因型频率数据文件，筛选满足以下条件的基因位点用于生成编码ID的候选基因位点：1)基因位点在数据库中至少出现两种基因型，2...
【专利技术属性】
技术研发人员：朱忠旭，周文莉，杨克勤，牛成镇，
申请(专利权)人：杭州迈迪科生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：浙江,33
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