与谷子码数性状相关的SNP标记及其检测引物和应用制造技术

本申请公开了一种与谷子码数性状相关的SNP标记及其检测引物和应用。本申请与谷子码数性状相关的SNP标记，该SNP标记位于第二条染色体第27578869bp至第28178402bp的bin标记内，SNP标记与谷子码数紧密连锁。本申请与谷子码数性状相关的SNP标记，可以用于谷子码数性状的分子标记辅助育种，通过该SNP标记检测可以预测谷子码数，为实现谷子码数性状的早期鉴定或筛选育种提供了科学依据，对加快谷子品种的遗传选育或改良进程具有重要的理论和实践指导意义。本申请检测SNP标记的引物对，可以对谷子码数进行分型，检测SNP表达的差异。

【技术实现步骤摘要】
与谷子码数性状相关的SNP标记及其检测引物和应用
本申请涉及谷子育种
，特别是涉及一种与谷子码数性状相关的SNP标记及其检测引物和应用。
技术介绍
我国是谷子的原产地和世界上栽培面积最大、产量最高的国家，产量约占全世界总量的80％。同时，我国也是谷子遗传资源数量最多、多样性最丰富的国家。谷穗由穗轴和众多谷码组成，码数和码粒数等是影响谷子产量的重要因子，研究与控制谷子码数、码粒数等产量性状相关的基因及其位置功能等，对于指导谷子遗传育种具有重要的意义。单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)是基因组水平上由单个核苷酸碱基的变异引起的DNA序列多态性，其在基因组中数量多，分布广泛，遗传稳定性好。随着基因测序技术的发展和成本的降低，对不同个体同一基因或基因片段进行直接测序和序列比较，就能够确定碱基是否存在变异。因此，SNP检测有利于基因分型，适用于快速和规模化地筛查未知或已知SNP与某遗传性状的关系。目前关于谷子数量性状相关的QTL定位和SNP标记研究主要集中于SSR标记的开发利用等途经，而利用群体自交系简并基因组测序检测多态性的SNP分子标记本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与谷子码数性状相关的SNP标记，其特征在于：所述SNP标记位于第二条染色体第27578869bp至第28178402bp的bin标记内，所述SNP标记与谷子码数紧密连锁。

【技术特征摘要】
1.一种与谷子码数性状相关的SNP标记，其特征在于：所述SNP标记位于第二条染色体第27578869bp至第28178402bp的bin标记内，所述SNP标记与谷子码数紧密连锁。2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于：所述SNP标记的碱基为T或C。3.根据权利要求1或2所述的SNP标记，其特征在于：所述SNP标记包括CN-02-349位点，所述CN-02-349位点位于第二条染色体的序列第28175349bp位置，所述CN-02-349位点所在的序列如SeqIDNo.1所示，所述CN-02-349位点是SeqIDNo.1所示序列中自5’端起第66位碱基。4.根据权利要求3所述的SNP标记，其特征在于：对SNP标记，利用复合区间作图法，采用5％的总体显著水平，QTL检测的LOD值为5.5675，表型变异解释率为4.95％。5.一种检测权利要求1-4任一项所述的SNP标记的引物对，其特征在于：所述引物对的上游引物为SeqIDNo.2所示序列，下游引物为SeqIDNo.3所示序列；SeqIDNo.2：5’-CGCACCAAACTAGCCACCG...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵治海，李双东，王晓明，张晓磊，张耕耘，史高雷，魏玮，张雅莉，裴晶晶，
申请(专利权)人：张家口市农业科学院，
类型：发明
国别省市：河北,13