本发明专利技术公开了一种基于CRISPR/Cas9基因编辑技术选育绿豆不育突变体的方法及专用gRNA。所述方法包括：将含有gRNA序列的植物CRISPR/Cas9质粒转入绿豆中，从而编辑SEQ ID NO.1所示的绿豆VrPUB4基因的ORF区域，其中所述gRNA对应的DNA序列如SEQ ID NO.2～SEQ NO.21任一条所示。本发明专利技术主要通过利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对SEQ ID NO.1所示基因VrPUB4的序列进行编辑，使该基因中出现插入/缺少(InDel)，从而发生了移码变异而使基因功能丧失，产生不育的基因编辑植株。本发明专利技术提供一种选育雄性不育绿豆的新方法，为绿豆的杂交育种提供新的种质资源。
【技术实现步骤摘要】
基于CRISPR/Cas9基因编辑技术选育绿豆不育突变体的方法及专用gRNA
本专利技术涉及分子育种、基因工程有分子生物学领域，具体地说，涉及一种利用CRISPR/Cas9基因编辑技术选育绿豆不育突变体的方法。
技术介绍
绿豆(VignaradiateL.)是我国主要食用豆类作物之一，其含有丰富的维生素和矿物质、膳食纤维、蛋白，深得消费者喜爱。但是，绿豆品种均为产量较低的常规品种，产量一般只是1000至1500公斤/公倾。由于单产低，难于与其它大田作物竞争，面积不断萎缩。因此如何大幅度提高绿豆产量是广大绿豆育种家所必须面临和解决的迫切问题。杂种优势的利用是提高作物产量的途径之一。杂种优势是生物界的一种普遍现象，一般是指杂种在生长势、生活力、抗逆性、繁殖力、适应性、产量、品质等方面优于其亲本的现象。目前已经有多种作物的杂交种被利用于生产。在天然自花传粉的作物之中，水稻的杂种优势的利用是最好的例子，杂交稻一般比常规稻增产10-20％。中国在1973年就建立起“三系配套”的水稻育种系统，近年来杂交水稻的种植面积一直都超过水稻种植总面积的50％(Chengetal.,2007)。Chen等(2003)发现利用绿豆品种KPS1与Korea7等不同组合配制的杂交组合后代在产量上最高可得到40％以上的超亲优势。但是，目前绿豆还缺乏可用的雄性不育系。
技术实现思路
专利技术目的：为解决现有技术中的问题，本专利技术的目的之一是提供一种基于CRISPR/Cas9基因编辑技术选育绿豆不育突变体的方法；本专利技术的目的之二是提供一种特异性靶向绿豆VrPUB4基因的gRNA、其DNA分子、相关载体、重组工程菌及其应用。技术方案：本专利技术所述的基于CRISPR/Cas9基因编辑技术选育绿豆不育突变体的方法，包括：将含有gRNA序列的植物CRISPR/Cas9质粒转入绿豆中，从而编辑SEQIDNO.1所示的绿豆VrPUB4基因的ORF区域，其中所述gRNA的序列如SEQIDNO.2～SEQIDNO.21任一条所示。进一步优选的，gRNA序列如SEQIDNO.2所示，该gRNA特异性好，基因编辑效果好，可成功获得雄性不育的绿豆突变体。含有gRNA序列的植物CRISPR/Cas9质粒的骨架载体可以为但不仅限于pYAO:hSpCas9，也可采用其他植物基因编辑骨架质粒。以pYAO:hSpCas9为例，说明含有gRNA序列的植物CRISPR/Cas9质粒的构建过程：(1)合成正反寡聚核苷酸链1)5’-ATTG[20N或21N]-3’和2)5’-AAAC[20n或21n]-3’，其中“20N或21N”为所述的gRNA序列，20n或21n为gRNA的反向互补序列；(2)正反寡聚核苷酸链1)和2)退火成双链后连入经内切酶BsaI消化过的AtU6-26-sgRNA-SK载体中，构建得AtU6-26-target-sgRNA载体；(3)AtU6-26-target-sgRNA载体经内切酶SpeI和NheI进行双酶切，切下AtU6-26-target-sgRNA目的片段后连入经SpeI酶切的pYAO:hSpCas9载体即可。本专利技术还提供了一种特异性靶向绿豆VrPUB4基因的gRNA，其序列如SEQIDNO.2～SEQIDNO.21任一条所示。本专利技术还提供了编码所述特异性靶向绿豆VrPUB4基因的gRNA的DNA分子。本专利技术还提供了含有所述的DNA分子的重组载体或重组工程菌。本专利技术又提供了所述的gRNA、所述的DNA分子、所述的重组载体或重组工程菌在靶向修饰绿豆VrPUB4基因以及选育绿豆不育突变体中的应用。本专利技术进一步提供了一种用于编辑绿豆VrPUB4基因的试剂盒，含有所述的gRNA。本专利技术进一步提供了一种用于编辑绿豆VrPUB4基因的试剂盒，含有所述的DNA分子。本专利技术进一步提供了一种用于编辑绿豆VrPUB4基因的试剂盒，含有所述的重组载体或重组工程菌。与现有技术相比，本专利技术的有益效果为：本专利技术主要通过利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对SEQNO.1所示基因VrPUB4的序列进行编辑，使该基因中出现插入/缺少(InDel)，从而发生了移码变异而使基因功能丧失，产生不育的基因编辑植株。本专利技术提供一种选育雄性不育绿豆的新方法，为绿豆的杂交育种提供新的种质资源。本专利技术方法简单、定向、成功率高。附图说明图1为实施例3获得的不育突变株相关性状图片；其中，A.不育株与可育株比较，左为可育株，右为不育株；B.不育株的花药与柱头；C.可育株花粉I/KI溶液染色情况；D.不育株花粉I/KI溶液染色情况。具体实施方式下面结合具体实施例，进一步阐明本专利技术，应理解这些实施例仅用于说明本专利技术而不用于限制本专利技术的范围，在阅读了本专利技术之后，本领域技术人员对本专利技术的各种等价形式的修改均落于本申请所附权利要求所限定的范围。若未特别指明，实施例均按照常规实验条件，如Sambrook等分子克隆实验手册(SambrookJ&RussellDW,MolecularCloning:aLaboratoryManual,2001)，或按照制造厂商说明建议的条件。实施例1用于编辑VrPUB4的gRNA的设计VrPUB4(LOC106752492)编码一个含有U-Box结构的蛋白。根据CRISPR/Cas9基因编辑的原理，SEQIDNO.1所示基因VrPUB4的序列的protospaceradjacentmotif(PAM，即“NGG”，其中“N”为任何一种核苷酸)前的20nt即为gRNA序列。如果gRNA的5’端第一个核苷酸不是鸟嘌呤(G)，则在5’端加上一个G，此时gRNA长21nt。在基因VrPUB4中设计得到的所有gRNA如表1所示。gRNA序列应该在外显子上，不能离ATG起始子太近，应在整个基因前中段部分。将gRNA在绿豆基因绿数据库(http://plantgenomics.snu.ac.kr/mediawiki-1.21.3/index.php/Main_Page)进行Blast比对，确定靶序列在绿豆基因组上是唯一的。表1gRNA序列实施例2用于编辑VrPUB4的CRISPR载体的构建编辑VrPUB4的CRISPR载体的框架为pYAO:hSpCas9(YanL,WeiS,WuY,etal.High-efficiencygenomeeditinginArabidopsisusingYAOpromoter-drivenCRISPR/Cas9system[J].Molecularplant,2015,8(12):1820-1823.)，用于编辑VrPUB4的CRISPR载体的构建方法如下：合成正反寡聚核苷酸链1)5’-ATTG[20N或21N]-3’和2)5’-AAAC[20n或21n]-3’。其中“20N或21N”为表1所示的gRNA序列，20n或21n为表1所示的gRNA的反向互补序列，例如GGACCGGCACCTATGATGATAGG的反向互补序列为CCTATCATCATAGGTGCCGGTCC。本实施例及实施例3具体采用的gRNA为表1中的第一条序列TTCGCCTTGTCTCTAACAATCGG。将正反两个寡聚核苷酸链1)和2)进行退火，方案为：a.将寡聚核苷酸链溶于超纯水，至本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种基于CRISPR/Cas9基因编辑技术选育绿豆不育突变体的方法，其特征在于，包括：将含有gRNA序列的植物CRISPR/Cas9质粒转入绿豆中，从而编辑SEQ ID NO.1所示的绿豆VrPUB4基因的ORF区域，其中所述gRNA的序列如SEQ ID NO.2～SEQ NO.21任一条所示。
【技术特征摘要】
1.一种基于CRISPR/Cas9基因编辑技术选育绿豆不育突变体的方法，其特征在于，包括：将含有gRNA序列的植物CRISPR/Cas9质粒转入绿豆中，从而编辑SEQIDNO.1所示的绿豆VrPUB4基因的ORF区域，其中所述gRNA的序列如SEQIDNO.2～SEQNO.21任一条所示。2.一种特异性靶向绿豆VrPUB4基因的gRNA，其特征在于，其序列如SEQIDNO.2～SEQIDNO.21任一条所示。3.编码权利要求2所述的特异性靶向绿豆VrPUB4基因的gRNA的DNA分子。4.含有权利要求3所述的DNA分子的重组载体或重组工...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈景斌，林云，袁星星，薛晨晨，顾和平，李群三，陈新，
申请(专利权)人：江苏省农业科学院，
类型：发明
国别省市：江苏,32
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