一种高通量测序数据质检附属装置及其质检方法制造方法及图纸

本发明专利技术公开了一种高通量测序数据质检附属装置及其质检方法，属于生物检测技术领域，包括数据初步处理模块及分别与数据初步处理模块电性连接的数据传输模块和数据接收模块，数据初步处理模块包括二代测序中对数据进行质检并与数据接收模块连接的FastQC软件、对FastQC软件计算得到的质检结果进行转换并与FastQC软件连接的转换模块以及对转换后结果进行排序并转换模块连接的排序模块。本发明专利技术将传统的通过视觉解读评判出测序数据的好坏转变为听觉来进行评判，根据判断到的旋律来直接获得测序数据的好坏，将视觉转换为听觉，摆脱了视觉的控制，更加方便快捷。

【技术实现步骤摘要】
一种高通量测序数据质检附属装置及其质检方法
本专利技术涉及一种测序数据质检装置及其质检方法，特别是涉及一种高通量测序数据质检附属装置及其质检方法，属于生物检测

技术介绍
高通量测序技术主要指第二代测序技术和第三代测序技术，高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件，该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降。而高通量测序的第一步便是对测序数据进行质量控制，传统的对高通量测序数据进行质检只要是通过FastQC软件进行，得到图形化的统计结果，虽然对于结果的解读并不难，但同样耗费精力。
技术实现思路
本专利技术的主要目的是为了提供一种高通量测序数据质检附属装置及其质检方法，通过利用听觉功能，根据判断听到的音乐旋律的情况来直接获得测序数据的好坏情况，不仅免去解读结果文件，而且使判断测序数据好坏更加简单方便。本专利技术的目的可以通过采用如下技术方案达到：一种高通量测序数据质检附属装置，包括数据初步处理模块及分别与所述数据初步处理模块电性连接的数据传输模块和数据接收模块，所述数据初步处理模块包括二代测序中对数据进行质检并与所述数据接收模块连接的FastQC软件、对所述FastQC软件计算得到的质检结果进行转换并与所述FastQC软件连接的转换模块以及对转换后结果进行排序并所述转换模块连接的排序模块。优选的，所述数据初步处理模块在计算机端进行，所述转换模块根据得到的质检结果ASCII字符按照Phred+33格式数据转换为相应的碱基质量值Q。优选的，所述Phred+33格式数据的转换公式为：Qsanger＝-10log10(P)其中：Q为碱基质量，Q值最高为40，P为错误率，错误率P最低为万分之一。优选的，所述数据传输模块采取无线传输模式，包括蓝牙数据传输设备。优选的，所述数据接收模块包括蓝牙接受模块、数据最终处理模块和发音装置模块，所述蓝牙接受模块与所述数据最终处理模块相连接，所述数据最终处理模块与所述发音装置模块相连接。优选的，所述数据最终处理模块包括微控制器、控制电路和发音模块，所述微控制器与所述控制电路电连接，所述控制电路与所述发音模块电连接，所述控制电路控制所述发音模块发声。优选的，所述微控制器包括处理器、振荡电路、复位电路和电源电路，所述处理器分别与所述振荡电路、所述复位电路、所述电源电路和所述控制电路电连接，所述电源电路与所述控制电路电连接。优选的，所述发音模块包括三个微型发音装置，分别能播放低音、中音和高音三种音调，这三种音调对应着测序数据的质量层次。优选的，每个所述微型发音装置的电路均由多个电阻Ri、多个电容Ci、一个电源U1和一个发声器S1组成。一种高通量测序数据质检附属装置的质检方法，利用FastQC软件对测序数据进行质检，将得到的结果进行质量转换，根据Phred+33格式得到对应质量字符的碱基质量值Q，具体包括如下步骤：步骤1：将得到的碱基质量字符转换为相应的ASCII值；步骤2：将得到的ASCII值减去33得到相应的碱基质量值Q；步骤3：通过排序算法将碱基质量值Q进行从低到高的排序；步骤4：步骤1-3完成了数据的初步处理，初步处理完成后将数据通过无线蓝牙模式传输给数据接收模块；步骤5：数据最终处理模块通过数据接收模块接收排序完后的碱基质量值Q，数据最终处理模块的处理器单片机将碱基质量值Q进行等级划分，0～10分为差，10～25为中等，25～40为优，并对每个等级内的个数进行累加统计；步骤6：三个等级分别对应着控制模块的不同动作，单片机的P1端口控制着控制电路，控制电路控制着发音模块发出不同的音律；当Q值为0～10时，P1端口控制控制电路打开发音模块1，关闭发音模块2和3，此时只有发音模块1发音；当Q值为10～25时，P1端口控制控制电路打开发音模块2，关闭发音模块1和3，此时只有发音模块2发音；当Q值为25～40时，P1端口控制控制电路打开发音模块3，关闭发音模块1和2，此时只有发音模块3发音；各发音模块的发音时间通过每个等级内的累加数控制。本专利技术的有益技术效果：按照本专利技术的高通量测序数据质检附属装置及其质检方法，本专利技术提供的高通量测序数据质检附属装置及其质检方法，将传统的通过视觉解读评判出测序数据的好坏转变为听觉来进行评判，简单方便，通过利用听觉的功能，根据判断听到的音乐旋律的情况来直接获得测序数据的好坏情况，这样，不仅可以免去解读结果文件，而且使得我们判断测序数据好坏来得更加简单，通俗。附图说明图1为按照本专利技术的高通量测序数据质检附属装置的一优选实施例的测序数据结构图，其中，第一行：序列名称；第二行：序列的碱基；第三行：序列名称，可以和第1行一样，或使用+号代替；第四行：碱基的质量；图2为按照本专利技术的高通量测序数据质检附属装置的一优选实施例的数据质检流程图；图3为按照本专利技术的高通量测序数据质检附属装置的一优选实施例的结构原理图；图4为按照本专利技术的高通量测序数据质检附属装置的一优选实施例的发音电路图。具体实施方式为使本领域技术人员更加清楚和明确本专利技术的技术方案，下面结合实施例及附图对本专利技术作进一步详细的描述，但本专利技术的实施方式不限于此。如图3和图4所示，本实施例提供的一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，包括数据初步处理模块及分别与所述数据初步处理模块电性连接的数据传输模块和数据接收模块，所述数据初步处理模块包括二代测序中对数据进行质检并与所述数据接收模块连接的FastQC软件、对所述FastQC软件计算得到的质检结果进行转换并与所述FastQC软件连接的转换模块以及对转换后结果进行排序并所述转换模块连接的排序模块。在本实施例中，所述数据初步处理模块在计算机端进行，所述转换模块根据得到的质检结果ASCII字符按照Phred+33格式数据转换为相应的碱基质量值Q，所述Phred+33格式数据的转换公式为：Qsanger＝-10log10(P)其中：Q为碱基质量，Q值最高为40，P为错误率，错误率P最低为万分之一。在本实施例中，所述数据传输模块采取无线传输模式，包括蓝牙数据传输设备。在本实施例中，如图3所示，所述数据接收模块包括蓝牙接受模块、数据最终处理模块和发音装置模块，所述蓝牙接受模块与所述数据最终处理模块相连接，所述数据最终处理模块与所述发音装置模块相连接，所述数据最终处理模块包括微控制器、控制电路和发音模块，所述微控制器与所述控制电路电连接，所述控制电路与所述发音模块电连接，所述控制电路控制所述发音模块发声，所述微控制器包括处理器、振荡电路、复位电路和电源电路，所述处理器分别与所述振荡电路、所述复位电路、所述电源电路和所述控制电路电连接，所述电源电路与所述控制电路电连接。在本实施例中，如图4所示，所述发音模块包括三个微型发音装置，分别能播放低音、中音和高音三种音调，这三种音调对应着测序数据的质量层次，每个所述微型发音装置的电路均由多个电阻Ri、多个电容Ci、一个电源U1和一个发声器S1组成。如图2所示，本实施例提供的一种高通量测序数据质检附属装置的质检方法，利用FastQC软件对测序数据进行质检，将得到的结果进行质量转换，根据Phred+33格式得到对应质量字符的碱基质量值Q，具体包括如下步骤：步骤1：将得到的碱基质量字符转换为相本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，包括数据初步处理模块及分别与所述数据初步处理模块电性连接的数据传输模块和数据接收模块，所述数据初步处理模块包括二代测序中对数据进行质检并与所述数据接收模块连接的FastQC软件、对所述FastQC软件计算得到的质检结果进行转换并与所述FastQC软件连接的转换模块以及对转换后结果进行排序并所述转换模块连接的排序模块。

【技术特征摘要】
1.一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，包括数据初步处理模块及分别与所述数据初步处理模块电性连接的数据传输模块和数据接收模块，所述数据初步处理模块包括二代测序中对数据进行质检并与所述数据接收模块连接的FastQC软件、对所述FastQC软件计算得到的质检结果进行转换并与所述FastQC软件连接的转换模块以及对转换后结果进行排序并所述转换模块连接的排序模块。2.根据权利要求1所述的一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，所述数据初步处理模块在计算机端进行，所述转换模块根据得到的质检结果ASCII字符按照Phred+33格式数据转换为相应的碱基质量值Q。3.根据权利要求2所述的一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，所述Phred+33格式数据的转换公式为：Qsanger＝-10log10(P)其中：Q为碱基质量，Q值最高为40，P为错误率，错误率P最低为万分之一。4.根据权利要求1所述的一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，所述数据传输模块采取无线传输模式，包括蓝牙数据传输设备。5.根据权利要求1所述的一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，所述数据接收模块包括蓝牙接受模块、数据最终处理模块和发音装置模块，所述蓝牙接受模块与所述数据最终处理模块相连接，所述数据最终处理模块与所述发音装置模块相连接。6.根据权利要求5所述的一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，所述数据最终处理模块包括微控制器、控制电路和发音模块，所述微控制器与所述控制电路电连接，所述控制电路与所述发音模块电连接，所述控制电路控制所述发音模块发声。7.根据权利要求6所述的一种高通量测序数据质检附属装置，其特征在于，所述微控制器包括处理器、振荡电路、复位电路和电源电路，所述处理器分别与所述振荡电路、所述复位电路、所述电源电路和所述控制...

【专利技术属性】
技术研发人员：常珊，陆旭峰，陆振宇，孔韧，
申请(专利权)人：江苏理工学院，
类型：发明
国别省市：江苏,32