刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的SSR引物及其在种群遗传多样性分析中的应用制造技术

技术编号:19075701 阅读:94 留言:0更新日期:2018-09-29 17:48
本发明专利技术公开了刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的SSR引物及其在种群遗传多样性分析中的应用。本发明专利技术根据刺槐叶瘿蚊广腹细蜂线粒体基因组数据设计获得13多万条SSR序列并从中筛选出差异较为稳定、多态性良好的37对SSR特异性引物。本发明专利技术进一步公开了所述的37对SSR特异性引物在刺槐叶瘿蚊广腹细蜂种群的遗传多样性分析、种群进化分析、多态性分析以及构建刺槐叶瘿蚊广腹细蜂指纹图谱等方面的应用。本发明专利技术对于开展刺槐叶瘿蚊广腹细蜂这类天敌类群群体遗传多样性研究、掌握其来源及群体分化情况等具有重要的价值。

【技术实现步骤摘要】
刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的SSR引物及其在种群遗传多样性分析中的应用
本专利技术涉及SSR引物,尤其涉及刺槐叶瘿蚊广腹细蜂(PlatygasterrobiniaeBuhlandDuso)的特异性SSR引物,本专利技术进一步涉及所述特异性SSR引物在刺槐叶瘿蚊广腹细蜂种群遗传多样性分析等方面的应用,属于刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的特异性SSR引物及其应用领域。
技术介绍
刺槐叶瘿蚊广腹细蜂PlatygasterrobiniaeBuhlandDuso(Hymenoptera:Platygastridae)是中国重要外来种刺槐叶瘿蚊Obolodiplosisrobiniae(Haldeman)(双翅目:瘿蚊科)卵-幼虫跨期寄生性天敌,对刺槐叶瘿蚊的寄生率较高,尤其在其寄主年发生后期,寄生率往往可达到80%以上,是一类十分优良的天敌资源。在过去的十多年间,刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的寄主--刺槐叶瘿蚊因向欧洲和亚洲的很多国家与地区迅速传播扩散而受到了广泛关注,与此同时,刺槐叶瘿蚊广腹细蜂也在这些国家和地区先后被发现,并因其寄生率较高、降低寄主虫口密度的作用十分显著而逐渐被研究者青睐。目前,关于刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的研究仍停留在生物学基础研究阶段,对其起源、传播扩散及遗传分化情况尚处于空白。研究生物不同种群间遗传多样性及遗传结构,是探讨其起源和传播历史最为有效的手段之一。通过对种群遗传学的研究,可以揭示生物进化的历史,有助于我们更加直观的感受到物种在自然条件下与所处环境之间的相互关系及历程。物种的遗传多样性现状是物种长期进化的产物,也是其生存和进化的基础;是解释其进化历程和适应潜力的基础,又是进一步揭示其濒危机理和稀有程度的关键方法,并将为标准的制定保护策略和方法提供重要的论证(解新明等,2000);通过对种群遗传学的研究,还可以对现存的其他生物的生存状况和将来的发展趋势进行评估和预测。生物的遗传多样性程度与其适应能力具有一定相关性,一般而言,遗传多样性程度越高,其对所处周围环境的适应能力就越大,并且进化的潜力也越大。遗传多样性的研究结果是保护遗传学中制定保护策略措施的重要依据。种群遗传学属于遗传学下的一门分支学科,研究内容包括种群遗传结构及其变化规律。利用分子标记技术进行种群遗传学研究,加速了种群遗传学的发展进程。从起初的限制性片段长度多态性分子标记(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)技术逐步发展到现今应用比较普遍的微卫星分子标记技术(simplesequencerepeats,SSR)和单核苷酸分子多态性标记(SingleNucleotidePolymorphisms,SNP)技术,在昆虫方面为群体遗传学研究提供了有力保障。微卫星DNA(microsatellitesDNA)分子标记,又称SSR(SimpleSequenceRepeat)即简单重复序列,是目前研究群体遗传多样性中应用最为广泛的分子标记方法之一。微卫星DNA序列在真核细胞中均匀分布,多由2-6个不同核苷酸以短串联重复的形式组合而成,平均每段短重复序列之间间隔5-10kb,在序列的编码区、调控区、内含子中以及其他区域均可发现。它于1981年由Spritz在珠蛋白中首次被发现,到目前SSR分子标记技术在分子生物学中广泛应用。微卫星DNA分子标记由于具有特异性好、多态性高、有用遗传信息量大、共显性遗传及检测方便快速且稳定性高等特点,目前广泛应用于遗传结构及遗传多样性等方面的研究,是生物群体遗传结构分析与变异研究中极有价值的分子标记,研究不同种群的遗传多样性及遗传结构。开发刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的特异性SSR引物,能够应用于研究刺槐叶瘿蚊广腹细蜂不同群体的遗传多样性,分析该寄生蜂不同群体遗传结构特征和群体遗传多样性,明晰不同群体遗传分化和基因流状况以及群体系统发育与进化关系,从而能够揭示刺槐叶瘿蚊广腹细蜂群体遗传变异规律,阐明刺槐叶瘿蚊广腹细蜂群体的系统进化和地理分化,进而为后续探讨刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的起源与传播历史奠定基础,这对于掌握其来源及群体分化情况,对开发与利用天敌、继而开展生物防治等具有十分重要的理论与实践意义。
技术实现思路
本专利技术目的之一是提供基于刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的多态性较好的SSR引物,这些SSR引物能够在刺槐叶瘿蚊广腹细蜂扩增出特异性、稳定性、多态性的目的条带;本专利技术目的之二是将所筛选出的特异性SSR引物应用于刺槐叶瘿蚊广腹细蜂不同种群的遗传多样性分析或遗传结构分析等。本专利技术的上述目的是通过以下技术方案来实现的:本专利技术首先公开了刺槐叶瘿蚊广腹细蜂的特异性SSR引物,选自以下37对引物中的任意一对或多对:引物对1:由核苷酸序列为SEQIDNo.1所示上游引物和SEQIDNo.2所示下游引物组成;引物对2:由核苷酸序列为SEQIDNo.3所示上游引物和SEQIDNo.4所示下游引物组成;引物对3:由核苷酸序列为SEQIDNo.5所示上游引物和SEQIDNo.6所示下游引物组成;引物对4:由核苷酸序列为SEQIDNo.7所示上游引物和SEQIDNo.8所示下游引物组成;引物对5:由核苷酸序列为SEQIDNo.9所示上游引物和SEQIDNo.10所示下游引物组成;引物对6:由核苷酸序列为SEQIDNo.11所示上游引物和SEQIDNo.12所示下游引物组成;引物对7:由核苷酸序列为SEQIDNo.13所示上游引物和SEQIDNo.14所示下游引物组成;引物对8:由核苷酸序列为SEQIDNo.15所示上游引物和SEQIDNo.16所示下游引物组成;引物对9:由核苷酸序列为SEQIDNo.17所示上游引物和SEQIDNo.18所示下游引物组成;引物对10:由核苷酸序列为SEQIDNo.19所示上游引物和SEQIDNo.20所示下游引物组成;引物对11:由核苷酸序列为SEQIDNo.21所示上游引物和SEQIDNo.22所示下游引物组成;引物对12:由核苷酸序列为SEQIDNo.23所示上游引物和SEQIDNo.24所示下游引物组成;引物对13:由核苷酸序列为SEQIDNo.25所示上游引物和SEQIDNo.26所示下游引物组成;引物对14:由核苷酸序列为SEQIDNo.27所示上游引物和SEQIDNo.28所示下游引物组成;引物对15:由核苷酸序列为SEQIDNo.29所示上游引物和SEQIDNo.30所示下游引物组成;引物对16:由核苷酸序列为SEQIDNo.31所示上游引物和SEQIDNo.32所示下游引物组成;引物对17:由核苷酸序列为SEQIDNo.33所示上游引物和SEQIDNo.34所示下游引物组成;引物对18:由核苷酸序列为SEQIDNo.35所示上游引物和SEQIDNo.36所示下游引物组成;引物对19:由核苷酸序列为SEQIDNo.37所示上游引物和SEQIDNo.38所示下游引物组成;引物对20:由核苷酸序列为SEQIDNo.39所示上游引物和SEQIDNo.40所示下游引物组成;引物对21:由核苷酸序列为SEQIDNo.41所示上游引物和SEQIDNo.42所示下游引物组成;引物对22:由核苷酸序列为SEQIDNo.43所示上游引物和SEQIDNo.44所示下游引物组成;引物对23:由核苷酸序列本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.刺槐叶瘿蚊广腹细蜂(Platygaster robiniae Buhl and Duso)的特异性SSR引物,其特征在于,包括:引物对1:由核苷酸序列为SEQ ID No.1所示上游引物和SEQ ID No.2所示下游引物组成;引物对2:由核苷酸序列为SEQ ID No.3所示上游引物和SEQ ID No.4所示下游引物组成;引物对3:由核苷酸序列为SEQ ID No.5所示上游引物和SEQ ID No.6所示下游引物组成;引物对4:由核苷酸序列为SEQ ID No.7所示上游引物和SEQ ID No.8所示下游引物组成;引物对5:由核苷酸序列为SEQ ID No.9所示上游引物和SEQ ID No.10所示下游引物组成;引物对6:由核苷酸序列为SEQ ID No.11所示上游引物和SEQ ID No.12所示下游引物组成;引物对7:由核苷酸序列为SEQ ID No.13所示上游引物和SEQ ID No.14所示下游引物组成;引物对8:由核苷酸序列为SEQ ID No.15所示上游引物和SEQ ID No.16所示下游引物组成;引物对9:由核苷酸序列为SEQ ID No.17所示上游引物和SEQ ID No.18所示下游引物组成;引物对10:由核苷酸序列为SEQ ID No.19所示上游引物和SEQ ID No.20所示下游引物组成;引物对11:由核苷酸序列为SEQ ID No.21所示上游引物和SEQ ID No.22所示下游引物组成;引物对12:由核苷酸序列为SEQ ID No.23所示上游引物和SEQ ID No.24所示下游引物组成;引物对13:由核苷酸序列为SEQ ID No.25所示上游引物和SEQ ID No.26所示下游引物组成;引物对14:由核苷酸序列为SEQ ID No.27所示上游引物和SEQ ID No.28所示下游引物组成;引物对15:由核苷酸序列为SEQ ID No.29所示上游引物和SEQ ID No.30所示下游引物组成;引物对16:由核苷酸序列为SEQ ID No.31所示上游引物和SEQ ID No.32所示下游引物组成;引物对17:由核苷酸序列为SEQ ID No.33所示上游引物和SEQ ID No.34所示下游引物组成;引物对18:由核苷酸序列为SEQ ID No.35所示上游引物和SEQ ID No.36所示下游引物组成;引物对19:由核苷酸序列为SEQ ID No.37所示上游引物和SEQ ID No.38所示下游引物组成;引物对20:由核苷酸序列为SEQ ID No.39所示上游引物和SEQ ID No.40所示下游引物组成;引物对21:由核苷酸序列为SEQ ID No.41所示上游引物和SEQ ID No.42所示下游引物组成;引物对22:由核苷酸序列为SEQ ID No.43所示上游引物和SEQ ID No.44所示下游引物组成;引物对23:由核苷酸序列为SEQ ID No.45所示上游引物和SEQ ID No.46所示下游引物组成;引物对24:由核苷酸序列为SEQ ID No.47所示上游引物和SEQ ID No.48所示下游引物组成;引物对25:由核苷酸序列为SEQ ID No.49所示上游引物和SEQ ID No.50所示下游引物组成;引物对26:由核苷酸序列为SEQ ID No.51所示上游引物和SEQ ID No.52所示下游引物组成;引物对27:由核苷酸序列为SEQ ID No.53所示上游引物和SEQ ID No.54所示下游引物组成;引物对28:由核苷酸序列为SEQ ID No.55所示上游引物和SEQ ID No.56所示下游引物组成;引物对29:由核苷酸序列为SEQ ID No.57所示上游引物和SEQ ID No.58所示下游引物组成;引物对30:由核苷酸序列为SEQ ID No.59所示上游引物和SEQ ID No.60所示下游引物组成;引物对31:由核苷酸序列为SEQ ID No.61所示上游引物和SEQ ID No.62所示下游引物组成;引物对32:由核苷酸序列为SEQ ID No.63所示上游引物和SEQ ID No.64所示下游引物组成;引物对33:由核苷酸序列为SEQ ID No.65所示上游引物和SEQ ID No.66所示下游引物组成;引物对34:由核苷酸序列为SEQ ID No.67所示上游引物和SEQ ID No.68所示下游引物组成;引物对35:由核苷酸序列为SEQ ID No.69所示上游引物和SEQ ID No.70所示下游引物组成;引物对36:由核苷酸序列为SEQ ID No.71所示上游引物和SEQ ID No.72所示下游引物组成;引物对37:由核苷酸序列为SEQ ID No.73所示上游引物和SEQ ID No.74...

【技术特征摘要】
1.刺槐叶瘿蚊广腹细蜂(PlatygasterrobiniaeBuhlandDuso)的特异性SSR引物,其特征在于,包括:引物对1:由核苷酸序列为SEQIDNo.1所示上游引物和SEQIDNo.2所示下游引物组成;引物对2:由核苷酸序列为SEQIDNo.3所示上游引物和SEQIDNo.4所示下游引物组成;引物对3:由核苷酸序列为SEQIDNo.5所示上游引物和SEQIDNo.6所示下游引物组成;引物对4:由核苷酸序列为SEQIDNo.7所示上游引物和SEQIDNo.8所示下游引物组成;引物对5:由核苷酸序列为SEQIDNo.9所示上游引物和SEQIDNo.10所示下游引物组成;引物对6:由核苷酸序列为SEQIDNo.11所示上游引物和SEQIDNo.12所示下游引物组成;引物对7:由核苷酸序列为SEQIDNo.13所示上游引物和SEQIDNo.14所示下游引物组成;引物对8:由核苷酸序列为SEQIDNo.15所示上游引物和SEQIDNo.16所示下游引物组成;引物对9:由核苷酸序列为SEQIDNo.17所示上游引物和SEQIDNo.18所示下游引物组成;引物对10:由核苷酸序列为SEQIDNo.19所示上游引物和SEQIDNo.20所示下游引物组成;引物对11:由核苷酸序列为SEQIDNo.21所示上游引物和SEQIDNo.22所示下游引物组成;引物对12:由核苷酸序列为SEQIDNo.23所示上游引物和SEQIDNo.24所示下游引物组成;引物对13:由核苷酸序列为SEQIDNo.25所示上游引物和SEQIDNo.26所示下游引物组成;引物对14:由核苷酸序列为SEQIDNo.27所示上游引物和SEQIDNo.28所示下游引物组成;引物对15:由核苷酸序列为SEQIDNo.29所示上游引物和SEQIDNo.30所示下游引物组成;引物对16:由核苷酸序列为SEQIDNo.31所示上游引物和SEQIDNo.32所示下游引物组成;引物对17:由核苷酸序列为SEQIDNo.33所示上游引物和SEQIDNo.34所示下游引物组成;引物对18:由核苷酸序列为SEQIDNo.35所示上游引物和SEQIDNo.36所示下游引物组成;引物对19:由核苷酸序列为SEQIDNo.37所示上游引物和SEQIDNo.38所示下游引物组成;引物对20:由核苷酸序列为SEQIDNo.39所示上游引物和SEQIDNo.40所示下游引物组成;引物对21:由核苷酸序列为SEQIDNo.41所示上游引物和SEQIDNo.42所示下游引物组成;引物对22:由核苷酸序列为SEQIDNo.43所示上游引物和SEQIDNo.44所示下游引物组成;引物对23:由核苷酸序列为SEQIDNo.45所示上游引物和SEQIDNo.46所示下游引物组成;引物对24:由核苷酸序列为SEQIDNo.47所示上游引物和SEQIDNo.48所示下游引物组成;引物对25:由核苷酸序列为SEQIDNo.49所示上游引物和SEQIDNo.50所示下游引物组成;引物对26:由核苷酸序列为SEQIDNo.51所示上游引物和SEQIDNo.52所示下游引物组成;引物对27:由核苷酸序列为SEQIDNo.53所示上游引物和SEQIDNo.54所示下游引物组成;引物对28:由核苷酸序列为SEQIDNo.55所示上游引物和SEQIDNo.56所示下游引物组成;引物对29:由核苷酸序列为SEQIDNo.57所示上游引物和SEQIDNo.58所示下游引物组成;引物对30:由核苷酸序列为SEQIDNo.59所示上游引物和SEQIDNo.60所示下游引物组成;引物对31:由核苷酸序列为SEQIDNo.61所示上游引物和SEQIDNo.62所示下游引物组成;引物对32:由核苷酸序列为SEQIDNo.63所示上游引物和SEQIDNo.64所示下游引物组成;引物对33:由核苷酸序列为SEQIDNo.65所示上游引物和SEQIDNo.66所示下游引物组成;引物对34:由核苷酸序列为SEQIDNo.67所示上游引物和SEQIDNo.68所示下游引物组成;引物对35:由核苷酸序列为SEQIDNo.69所示上游引物和SEQIDNo.70所示下游引物组成;引物对36:由核苷酸序列为SEQIDNo.71所示上游引物和SEQIDNo.72所示下游引物组成;引物对37:由核苷酸序列为SEQIDNo.73所示上游引物和SEQIDNo.74所示下游引物组成。2.刺槐叶瘿蚊广腹细蜂(PlatygasterrobiniaeBuhlandDuso)的特异性SSR引物,其特...

【专利技术属性】
技术研发人员:姚艳霞杨君赵文霞淮稳霞林若竹
申请(专利权)人:中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所
类型:发明
国别省市:北京,11

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