重度抑郁症相关基因及其在诊断中的应用制造技术

本发明专利技术公开了重度抑郁症相关基因及其在诊断中的应用，所述基因为SLC35E1，本发明专利技术通过高通量测序发现SLC35E1基因在重度抑郁症患者中表达上调，通过进一步验证证实SLC35E1基因及其编码的蛋白在重度抑郁症患者中确实存在差异表达，提示SLC35E1 mRNA及其编码的蛋白可作为检测标志物应用于重度抑郁症的临床诊断。

Related genes of severe depression and their application in diagnosis

The present invention discloses major depression-related genes and their applications in diagnosis. The gene is SLC35E1. High-throughput sequencing shows that the expression of SLC35E1 gene is up-regulated in patients with major depression. Further validation confirms that there are indeed differences between SLC35E1 gene and its encoded protein in patients with major depression. The expression of SLC35E1 mRNA and the protein encoded by SLC35E1 may be used as a marker for clinical diagnosis of severe depression.

【技术实现步骤摘要】
重度抑郁症相关基因及其在诊断中的应用
本专利技术涉及生物医学领域，涉及重度抑郁症相关基因及其在诊断中的应用，具体的所涉及的基因标志物为SLC35E1。
技术介绍
抑郁症是指由多种因素如遗传、创伤、压力等引起的，一种严重危害人类身心健康的慢性复发性精神性疾病，以情绪、认知及行为功能紊乱为主，临床表现复杂，如持久的情绪低落，植物神经系统功能紊(如食欲、睡眠障碍)，认知障碍(如无价值感和不恰当的罪恶感)及精神活动异常(明显的激越和迟滞)等甚至会出现自杀观念或者自杀行为。随着社会节奏的变快、生活压力的加剧，抑郁症已变得越来越常见。据报道抑郁症的全球人群终身患病率高达20％，大约50％的抑郁症患者经抗抑郁治疗后效果不显著，且有大约50％-60％的患者会出现复发给患者社交、职业或其他功能带来严重的损害，另有研究表明60％的自杀者都是因为抑郁症，而抑郁症患者中大概有15％-17％最终会自杀身亡。抑郁症这种高患病率、高复发率、高致残致死率，且临床表现复杂多样的特点，给患者家庭及社会带来了巨大的经济负担。据世界卫生组织统计，全球每年用于治疗抑郁症的经济费用高达六百亿美元，到2030年时，抑郁症所带来的经济负担将可能将成为所有疾病中的第一位。因此，阐明MDD的发病机制，对于MDD的预防、相关药物的设计及合理有效的临床治疗具有重要意义，现已成为生物医学领域亟待解决的重要问题。随着高通量测序技术的发展，遗传因子在疾病中的研究受到广泛重视。现代分子遗传学认为很多社会环境或自身经历等因素可引起基因表达的变化，导致某些特定的基因发生表观遗传改变，这些变化引起神经元的可塑性和功能异常，基于基因水平的重度抑郁症发病机理及生物标志物的研究逐步引起学者们的关注。寻找与重度抑郁症相关的基因应用于重度抑郁症的临床诊断，揭示重度抑郁症的发病机制，提高患者的生存质量具有重要的意义。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供与重度抑郁症发生发展相关的基因标志物，使用基因标志物来诊断疾病具有及时性、特异性和灵敏性，患者在抑郁症早期就能知晓风险，针对风险高低，采取相应的预防和治疗措施，从而提高生活质量。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术提供了检测SLC35E1水平的试剂在制备诊断重度抑郁症产品中的应用。进一步，所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术检测SLC35E1水平的试剂。进一步，所述试剂包括：特异性识别SLC35E1基因的探针；或特异性扩增SLC35E1基因的引物；或特异性结合SLC35E1编码的蛋白的抗体或配体。进一步，所述特异性扩增SLC35E1基因的引物序列对如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示。本专利技术提供了一种体外检测样本中SLC35E1表达水平的产品，所述产品包括制剂、芯片或试剂盒；其中，所述产品通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术的方法检测SLC35E1基因或蛋白的表达水平。所述芯片包括基因芯片、蛋白芯片，所述基因芯片包括用于检测SLC35E1基因转录水平的针对SLC35E1基因的寡核苷酸探针，所述蛋白芯片包括SLC35E1蛋白的特异性抗体或配体；所述试剂盒包括基因检测试剂盒、蛋白检测试剂盒，所述基因检测试剂盒包括用于检测SLC35E1基因转录水平的试剂、或芯片，所述蛋白检测试剂盒包括用于检测SLC35E1蛋白表达水平的试剂、或芯片。“样本”是包含细胞或细胞物质的可从中获取核酸、多肽、或其它分析物的物质。优选的，所述样本为血液。本专利技术提供了上面所述的产品在制备诊断重度抑郁症工具中的应用。本专利技术提供了一种诊断重度抑郁症的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括：检测SLC35E1基因或蛋白表达水平的一种或多种试剂；和选自下组的一种或多种物质：容器、使用说明书、阳性对照物、阴性对照物、缓冲剂、助剂或溶剂。进一步，所述试剂盒包括通过RT-PCR法、qRT-PCR法、生物芯片检测法、DNA印迹法、原位杂交法、免疫印迹法检测SLC35E1基因或蛋白表达水平的试剂。进一步，所述用qRT-PCR法检测SLC35E1基因表达水平的试剂包括如序列SEQIDNO.1～2所示的特异性扩增SLC35E1基因的引物。进一步，所述用qRT-PCR法检测SLC35E1基因表达水平的试剂还包含SYBRGreen聚合酶链式反应体系、用于扩增管家基因的引物对；所述SYBRGreen聚合酶链式反应体系包含：PCR缓冲液、dNTPs、SYBRGreen荧光染料。进一步，所述扩增管家基因为GAPDH，扩增GAPDH的引物序列对如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示。附图说明图1是利用QPCR检测SLC35E1基因在重度抑郁症患者中的表达情况图；图2是利用蛋白免疫检测SLC35E1蛋白在重度抑郁症患者中的表达情况图。具体的实施方式本专利技术经过广泛而深入的研究，通过高通量测序的方法，检测重度抑郁症患者和正常人中的差异表达基因，探讨其与重度抑郁症的发生之间的关系，从而为抑郁症的早期检测提供标志物。通过筛选，本专利技术首次发现了重度抑郁症患者中SLC35E1显著性上调，提示SLC35E1可作为检测指标应用于重度抑郁症的临床诊断。SLC35E1基因和蛋白SLC35E1位于人19号染色体短臂1区3带，在本专利技术的上下文中，“SLC35E1基因”包括人SLC35E1基因以及人SLC35E1基因的任何功能等同物的多核苷酸。一种代表性的SLC35E1基因的核苷酸序列如目前国际公共核酸数据库GeneBank中SLC35E1基因(NM_024881.4)所示。本领域技术人员将认识到，本专利技术的实用性并不局限于对本专利技术的靶标基因的任何特定变体的基因表达进行定量。如果当核酸或其片段与其它核酸(或其互补链)最佳比对时(具有适当的核苷酸插入或缺失)，在至少大约60％的核苷酸碱基、通常至少大约70％、更通常至少大约80％、优选至少大约90％、及更优选至少大约95-98％核苷酸碱基中存在核苷酸序列相同性，则这两个序列是“基本同源的”(或者基本相似的)。本专利技术的SLC35E1基因可以是天然的或是人工合成的，或者使用可以表达SLC35E1的DNA片段的载体转染细胞获得。所述载体所述载体包括病毒载体、真核表达载体。病毒载体可以是任何适当的载体，包括但不限于逆转录病毒载体、腺病毒载体、腺病毒相关病毒载体、疱疹病毒(例如单纯疱疹病毒、痘苗病毒及EB病毒)载体、甲病毒载体。真核表达载体可以是任何适当的表达载体，包括但不限于pCMV-Myc表达载体、pcDNA3.0表达载体、pcDNA3.1表达载体、pEGFP表达载体、pEFBos表达载体、pTet表达载体、pTRE表达载体、或者在公知表达载体的基础上经改造的载体，比如pBin438、pCAMBIA1301等。在本专利技术的上下文中，SLC35E1基因表达产物包括人SLC35E1蛋白以及人SLC35E1蛋白的部分肽。所述SLC35E1蛋白的部分肽含有与重度抑郁症相关的功能域。“SLC35E1蛋白”包括SLC35E1蛋白以及SLC35E1蛋白的任何功能等同物。所述功能等同物包括SLC35E1蛋白保守性变异蛋白质、或其活性片段，或其活性衍生物，等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧条件下本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测SLC35E1水平的试剂在制备诊断重度抑郁症产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.检测SLC35E1水平的试剂在制备诊断重度抑郁症产品中的应用。2.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术检测SLC35E1水平的试剂。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括：特异性识别SLC35E1基因的探针；或特异性扩增SLC35E1基因的引物；或特异性结合SLC35E1编码的蛋白的抗体或配体。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述特异性扩增SLC35E1基因的引物序列对如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示。5.一种体外检测样本中SLC35E1表达水平的产品，其特征在于，所述产品包括制剂、芯片或试剂盒。6.根据权利要求5所述的产品，其特征在...

【专利技术属性】
技术研发人员：肖枫，马翠，
申请(专利权)人：北京泱深生物信息技术有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11