一种提高水稻产量的磷酸苷油酸变位酶基因片段及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种提高水稻产量的磷酸苷油酸变位酶基因片段及其应用。本发明专利技术所提供的筛选具有不同产量性状的水稻的方法，可包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；(2)进行如下判定：在不同地理位置但同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。实验证明，本发明专利技术提供的方法可筛选具有不同单株产量性状的水稻，且操作简单，准确率高，在水稻育种中具有重要的应用价值。

A gene fragment of Phospho oleic acid shift enzyme to increase rice yield and its application

The invention discloses a phosphosyloleic acid mutation gene fragment for improving rice yield and its application. The method of screening rice with different yield traits can include the following steps: (1) detecting the genotypes based on specific gene fragments in the rice to be measured; the specific gene fragment is located in the rice genome, OsIPGAM1, and there are two allelic forms of the OsIPGAM1_a and OsIPGAM1_b, and the OsIPGAM1_a as a sequence list. The sequence 1 shows that the OsIPGAM1_b is shown as sequence 2 of the sequence list; (2) it is determined as follows: the average yield of rice population with genotype OsIPGAM1_b homozygous type is higher than that of genotype OsIPGAM1_a homozygous rice group at different geographical locations but the same growth conditions. The experiment proved that the method provided by the invention can be used to screen rice with different yield traits of single plant, and it has simple operation and high accuracy. It has important application value in rice breeding.

【技术实现步骤摘要】
一种提高水稻产量的磷酸苷油酸变位酶基因片段及其应用
本专利技术属于生物
，涉及一种普适性培育高产水稻的专用特异基因组片段和特异引物对,尤其涉及一种提高水稻产量的磷酸苷油酸变位酶基因片段及其应用。
技术介绍
水稻(OryzasativaL.)是世界半数以上人口的主食。随着全球人口增加和生活水平的提高，对培育广谱性高产水稻品种的需求也与日俱增。从现有各类水稻材料中找出提升水稻高产的基因组片段及其鉴定方法，有利于育种过程中有针对性地选材、跟踪和确认具高产性状的水稻品种。水稻育种的一个基本目标就是获得在较广泛的地理条件下生长良好的稻谷品种。目前的育种方法还是以地域性为主，能否找到在多个地区都可以增加产量的基因类型及其确切序列仍是分子育种的一个制约因素。对不同水稻群体自然变异的详尽研究可以对农业育种上这一制约因素带来突破。基因组学的发展为选定、比较特定基因或分子标记为选择条件的育种带来新的希望。对普遍提升水稻产量的目标而言，已经有可能获得促进这一目标实现的遗传分子序列。
技术实现思路
本专利技术提供了一种培育高产作物的方法及其专用特异基因组片段及其特异引物对。本专利技术所提供的筛选方法适于选择在不同地理条件下均可高产的水稻(方法甲)，包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；(2)进行如下判定：在不同地理区域的同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。适于不同地理条件的高产水稻为在不同地理位置的大田条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。所述不同地理区域的同等生长条件为不同地理区域但是同等生长条件。本专利技术所提供的筛选方法适于选择在不同地理条件下均可高产的水稻(方法乙)可包括如下步骤：(1)以待测水稻的基因组DNA为模板，采用特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_b纯合型；(2)进行如下判定：在同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。本专利技术还可以提供一种高产水稻的筛选方法，为方法A或方法B；所述方法A包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；(2)进行如下判定：同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量；所述方法B包括如下步骤：(1)以待测水稻的基因组DNA为模板，采用上述特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_b纯合型；(2)进行如下判定：同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。上述同等生长条件可以为相同地理区域的同等生长条件。生长条件指自然环境(土壤、温度、湿度和养分等)和人工管理(施肥、农药使用和驱鸟等)。本专利技术还提供了一种水稻选育方法(方法丙)，可包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；(2)基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻为选育的目的水稻。为解决上述技术问题，本专利技术还提供了一种水稻选育方法(方法丁)，可包括如下步骤：(1)以待测水稻的基因组DNA为模板，采用特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_b纯合型；(2)基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻为选育的目的水稻。所述目的水稻为产量高的水稻。以上任一所述特异引物对可由引物1和引物2组成；所述引物1可为如下(a1)或(a2)：(a1)序列表的序列3所示的单链DNA分子；(a2)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的单链DNA分子；所述引物2可为如下(b1)或(b2)：(b1)序列表的序列4所示的单链DNA；(b2)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的单链DNA分子。本专利技术还保护一种特异等位基因片段，所述特异等位基因片段可为OsIPGAM1_a或OsIPGAM1_b；所述OsIPGAM1_a可为如下(c1)或(c2)：(c1)序列表的序列1所示的DNA分子；(c2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子；所述OsIPGAM1_b可为如下(d1)或(d2)：(d1)序列表的序列2所示的:DNA分子；(d2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子。(c2)或(d2)中，“取代和/或缺失和/或添加”发生的位置位于序列表的序列1与序列表的序列2之间的三个差异以外的区域。所述特异引物对也属于本专利技术的保护范围。为解决上述技术问题，本专利技术还提供了一种试剂盒，包括所述特异引物对。所述试剂盒中还可包括用于提取水稻基因组DNA的常规试剂和/或用于进行PCR扩增的常规试剂和/或用于进行测序的常规试剂。所述试剂盒的用途为如下(e1)或(e2)或(e3)或(e4)：(e1)筛选适于不同地理条件的高产水稻；(e2)筛选具有不同产量性状的水稻；(e3)鉴定或辅助鉴定水稻的产量性状；(e4)鉴定或辅助鉴定具有不同产量性状的水稻。所述试剂盒的制备方法也属于本专利技术的保护范围。所述试剂盒的制备方法包括将所述试剂盒中各条引物分别单独包装的步骤。本专利技术还保护所述特异等位基因片段或所述特异引物对的应用，为如下(e1)或(e2)或(e3)或(e4)：(e1)筛选适于不同地理条件的高产水稻；(e2)筛选具有不同产量性状的水稻；(e3)鉴定或辅助鉴定水稻的产量性状；(e4)鉴定或辅助鉴定具有不同产量性状的水稻。所述特异等位基因片段、所述特异引物对、所述试剂盒或以上任一所述方法在水稻育种中的应用也属于本专利技术的保护范本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种筛选适于不同地理条件的高产水稻的方法，为方法甲或方法乙；所述方法甲包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；(2)进行如下判定：在不同地理区域的同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量；所述方法乙包括如下步骤：(1)以待测水稻的基因组DNA为模板，采用权利要求4所述特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_b纯合型；(2)进行如下判定：在不同地理区域的同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。

【技术特征摘要】
1.一种筛选适于不同地理条件的高产水稻的方法，为方法甲或方法乙；所述方法甲包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；(2)进行如下判定：在不同地理区域的同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量；所述方法乙包括如下步骤：(1)以待测水稻的基因组DNA为模板，采用权利要求4所述特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_b纯合型；(2)进行如下判定：在不同地理区域的同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。2.一种高产水稻的筛选方法，为方法A或方法B；所述方法A包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；(2)进行如下判定：同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量；所述方法B包括如下步骤：(1)以待测水稻的基因组DNA为模板，采用权利要求4所述特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsIPGAM1_b纯合型；(2)进行如下判定：同等生长条件下，基因型为OsIPGAM1_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsIPGAM1_a纯合型的水稻群体的平均产量。3.一种水稻选育方法，为方法丙或方法丁；所述方法丙包括如下步骤：(1)检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsIPGAM1，存在OsIPGAM1_a和OsIPGAM1_b两种等位形式，所述OsIPGAM1_a如序列表的序列1所示，所述OsIPGAM1_b如序列表的序列2所示；...

【专利技术属性】
技术研发人员：鲁迎青，
申请(专利权)人：中国科学院植物研究所，
类型：发明
国别省市：北京,11