The present invention provides an application of a skin related SNP marker in the genotyping of a black bone chicken. The SNP marker is located at the upstream of the transcription start site of the TYR gene promoter region, with a polymorphic base of adenine A or thymine T. The SNP genotype was highly specific, and the detection band was single and the typing results were accurate. Combined with the detection method, the whole operation process is more convenient, efficient and lower cost, and the rapid and accurate individual screening can be realized, which provides the basis for the breeding and variety protection of the variety of black bone chicken.
【技术实现步骤摘要】
一种肤色相关的SNP标记在乌骨鸡基因分型中的应用
本专利技术属于分子生物学检测领域,具体涉及一种肤色相关的SNP标记在乌骨鸡基因分型中的应用。
技术介绍
鸡的皮肤颜色作为质量性状是一种非常重要的品种特征。由于不同的市场消费需求,鸡的皮肤颜色具有重要的经济用途。家禽的皮肤颜色主要分为白、黄、黑三种,其中黑色皮肤以乌骨鸡为代表。乌骨鸡具有特效的滋补和药用价值,其最显著的特征是体内含有大量黑色素。乌骨鸡黑色素作为一种重要的活性物质,其具有清除自由基、抗氧化、延缓衰老和提高机体免疫力等功效。研究表明乌骨鸡黑色素能够富集Cu、Mn、Fe、Co和Ni等微量元素,上述元素可以直接参与机体的细胞免疫,而且参与三大物质代谢途径,同时抑制由诱变剂所导致的基因突变。徐幸莲等通过实验得出乌骨鸡黑色素可有效清除超氧阴离子自由基,具有超氧歧化酶的作用。同时证明乌骨鸡黑色素能延长果蝇的平均寿命,提高果蝇的性活力,显著降低果蝇的脂褐素含量(P<0.05),得出乌骨鸡黑色素具有延缓衰老的作用。综述所述,乌骨鸡体内黑素是其发挥药用滋补功效的物质基础,乌骨鸡体内黑素沉积量的增加可有效提高其药用价值。另外,在乌骨鸡长期的自繁过程中出现了部分个体肤色变浅的现象,而白色个体出售价格远低于黑色个体,严重影响了乌骨黑鸡的养殖收益。因此,开展乌骨鸡黑色性状的选育,提高乌骨鸡体内黑色素含量,对当前乌骨鸡养殖生产具有重要的意义。酪氨酸酶(tyrosinae,TYR)是黑色素合成过程中重要的限速酶,它能催化酪氨酸氧化产生多巴和多巴醌。酪氨酸酶正常功能的缺失将导致黑色素合成通路阻断,使动物表现出白化 ...
【技术保护点】
一种肤色相关的SNP标记在乌骨鸡基因分型中的应用,其特征在于:所述SNP标记位于TYR基因启动子区的转录起始位点上游2228bp处,具有多态性碱基为腺嘌呤A或胸腺嘧啶T。
【技术特征摘要】
1.一种肤色相关的SNP标记在乌骨鸡基因分型中的应用,其特征在于:所述SNP标记位于TYR基因启动子区的转录起始位点上游2228bp处,具有多态性碱基为腺嘌呤A或胸腺嘧啶T。2.根据权利要求1所述的一种肤色相关的SNP标记在乌骨鸡基因分型中的应用,其特征在于:所述应用是基于SNP位点设计PCR扩增引物,采用扩增引物对待测样本DNA进行PCR扩增,扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,并成像,最终根据扩增产物中目的条带的有无确定所述待测样本的SNP标记的基因型。3.根据权利要求1所述的一种肤色相关的SNP标记在乌骨鸡基因分型中的应用,其特征在于:所述扩增引物的反向扩增引物的设计方法如下:使SNP位点位于反向引物的3'端,将靠近SNP位点的第三碱基变为错配碱基C,其序列为R1:5’-AACTCTAACAGAACCATCATTTCTT-3’R2:5’-AACTCTAACAGAACCATCATTTCTA-3’正向通用引物F:5’-CTGAAAGGAGGTTGTAGTGAGC-3’。4.根据权利要求2所述的一种肤色相关的SNP标记在乌骨鸡基因分型中的应用,其特征在于:所述PCR扩增程序如下:94℃预变性5min,循环扩增阶段:94℃30s变性,55℃30s退火,72℃30s延伸,循环30次,最后在72℃保温10min终末延伸,扩增反应结束后,PCR产物进行电泳检测。5.根据权利...
【专利技术属性】
技术研发人员:喻世刚,王钢,廖娟,
申请(专利权)人:乐山师范学院,
类型:发明
国别省市:四川,51
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