The invention belongs to the field of biotechnology, in particular to a group of RT PCR for nucleic acid rapid genotyping detection of avian metapneumovirus subtypes, characterized in that, including for the detection of avian metapneumovirus A primers for 1, for the detection of avian metapneumovirus B primer pairs 2, primers for detection of avian metapneumovirus C type in 3 and for the detection of avian metapneumovirus type D primers for 4; among them, the primers of No.1 and ID such as SEQ SEQ ID No.2 shown in sequence 1, the primers such as SEQ ID and SEQ No.3 ID shown in No.4 2 of the primers sequences, such as SEQ ID and SEQ No.5 ID No.6 shown in sequence 3, the primer of the 4 sequence is shown as SEQ ID and SEQ No.7 ID No.8. The above nucleic acids can be used to detect four subtypes of avian PNV A, B, C and D. The primers are highly specific, and there is no cross reaction between primers, and no cross reaction with other viruses.
【技术实现步骤摘要】
用于RT-PCR快速分型检测禽偏肺病毒亚型的核酸及应用
本专利技术属于生物
,具体涉及用于RT-PCR快速分型检测禽偏肺病毒亚型的核酸及应用。
技术介绍
禽偏肺病毒(Avianmetapneumovirus,aMPV)又名禽肺病毒或火鸡鼻气管炎病毒,是一种世界范围内分布的禽类重要病原。该病毒可引起禽类的急性上呼吸道感染、成年鸡头部肿大、被感染的产蛋鸡产蛋率、孵化率均会有所降低。禽偏肺病毒属于副黏病毒科、肺病毒亚科中的偏肺病毒属,不分节段单股负链的RNA病毒,长约14kb,由8个基因组成,主要编码8结构蛋白,依次为:3’端前导区(Leader),核蛋白(N),磷蛋白(P),基质蛋白(M),融合蛋白(F),第二基质蛋白(M2),小疏水蛋白(SH),表面糖蛋白(G)和RNA聚合酶(L),5’端尾部区(Trailer)。由于G蛋白是所有病毒蛋白中最不保守的蛋白,根据G基因核苷酸序列的多变性,把禽偏肺病毒分为A、B、C、D四个亚型。禽偏肺病毒于1978年在南非共和国首次发现,随后在欧洲、中东和美国也报道了该病毒。我国沈瑞忠于等人1998年对该病毒进行分离并报道。之后在 ...
【技术保护点】
一组用于RT‑PCR快速分型检测禽偏肺病毒亚型的核酸,其特征在于,包括用于检测禽偏肺病毒A型的引物对1、用于检测禽偏肺病毒B型的引物对2、用于检测禽偏肺病毒C型的引物对3和用于检测禽偏肺病毒D型的引物对4;其中,所述引物对1的序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示,所述引物对2的序列如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示,所述引物对3的序列如SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示,所述引物对4的序列如SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示。
【技术特征摘要】
1.一组用于RT-PCR快速分型检测禽偏肺病毒亚型的核酸,其特征在于,包括用于检测禽偏肺病毒A型的引物对1、用于检测禽偏肺病毒B型的引物对2、用于检测禽偏肺病毒C型的引物对3和用于检测禽偏肺病毒D型的引物对4;其中,所述引物对1的序列如SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示,所述引物对2的序列如SEQIDNo.3和SEQIDNo.4所示,所述引物对3的序列如SEQIDNo.5和SEQIDNo.6所示,所述引物对4的序列如SEQIDNo.7和SEQIDNo.8所示。2.如权利要求1所述的核酸,其特征在于,该组核酸还包括禽偏肺病毒A型检测的阳性扩增产物1、禽偏肺病毒B型检测的阳性扩增产物2、禽偏肺病毒C型检测的阳性扩增产物3和禽偏肺病毒D型检测的阳性扩增产物4;其中,所述阳性扩增产物1包含如SEQIDNo.9所示的序列,所述阳性扩增产物2包含如SEQIDNo.10所示的序列,所述阳性扩增产物3包含如SEQIDNo.11所示的序列,所述阳性扩增产物4包含如SEQIDNo.12所示的序列。3.含有如权利要求1或2任一所述核酸的检测试剂盒。4.如权利要求3所述的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒还包括:5×Buffer、dNTPs、混合酶;其中,所述混合酶包括反转录酶和DNA聚合酶。5.如权利要求3所述的检测试剂盒,所述检测试剂盒还包括阳性质控品,所述阳性质控品包括DNA质控品和/或RNA质控品。所述DNA质控品是将具有SEQIDNo.9、SEQIDNo.10、SEQIDNo.11、SEQIDNo.12所示序列的核苷酸片段插入pGEM-TEasy载体构建而成的重组质粒;所述RNA质控品是将含有SEQIDNo...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘爵,王利佳,姜海军,韦莉,王菁,全荣,朱珊珊,侯磊,王丹,李子璇,
申请(专利权)人:北京市农林科学院,
类型:发明
国别省市:北京,11
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