用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的单核苷酸多态性标记位点、引物对、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术公开了用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的单核苷酸多态性标记位点、引物对、试剂盒及应用，所述的单核苷酸多态性标记位点是桃基因组第5染色体的第12,622,852位核苷酸，该核苷酸为A或T。本发明专利技术通过对大量桃种质样品的测序比对，鉴定出4063377个SNPs，利用这些SNPs对129份种质的桃果实苦仁/甜仁性状进行全基因组关联分析，鉴定出与桃果实苦仁/甜仁有显著关联的SNP位于第5染色体的第12,622,852bp处。并设计了特定的AS‑PCR分子标记及用于扩增该标记的引物对，通过琼脂糖电泳结果可以获得该基因分型结果。本发明专利技术的检测方法具有简单、快速、成本低的优点，能够实现生产中大规模的应用，具有良好的社会和经济效益。

Single nucleotide polymorphic marker loci, primer pairs, kit and application for identifying the characters of bitteren / sweet kernel of peach fruit

The invention discloses a method for identification of peach fruit bitter kernel / primer Marker Polymorphism, traits of sweet kernel, kit and application of marker polymorphism is the peach genome of chromosome fifth is 12622852nd nucleotides, the nucleotide is A or T. The present invention through the sequence of a large number of peach germplasm samples, identified 4063377 SNPs, using the SNPs of 129 accessions of peach kernel / bitter sweet kernel traits were a genome-wide association analysis identified the 12622852bp and peach kernel / bitter sweet kernel significantly associated with SNP chromosome fifth. And the design of the AS PCR specific molecular markers and marker primers for amplification of the results can be obtained by agarose gel electrophoresis, the genotyping results. The detection method of the invention has the advantages of simple, fast and low cost, and can achieve large-scale application in production, and has good social and economic benefits.

【技术实现步骤摘要】
用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的单核苷酸多态性标记位点、引物对、试剂盒及应用
本专利技术涉及用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的单核苷酸多态性标记位点、引物对、试剂盒及应用，属于生物

技术介绍
选择是育种中最重要的环节之一，它是指在一个群体中选择符合要求的基因型，来进行后续的培育。但在传统育种中，由于很难获知后代的基因型，因此选择的依据通常是表现型而非基因型，这种选择方法对质量性状而言一般是有效的，但对数量性状来说，因为其表现型与基因型之间缺乏明确的对应关系，因而效率不高。此外，对于以果实性状为目标的果树来说，这些性状都有其特定的表现时期，通常需要度过3-5年甚至更长时间的童期，因而选择的时间较晚。这对于那些植株高大、占地多、生长季长的作物，特别是果树之类的园艺作物，显然是非常不利的。近20年来迅速发展起来的基于DNA的分子标记技术，即“分子标记辅助选择”(marker-assistedselection，缩写为MAS)给育种提供了崭新的途径。它通过分析与目的基因紧密连锁的分子标记的基因型来进行育种，从而达到提高育种效率的目的。Yamamoto(2001)利用AFLP(Amplif本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的单核苷酸多态性标记位点，其特征在于，所述的单核苷酸多态性标记位点是桃基因组第5染色体的第12,622,852位核苷酸，该核苷酸为A或T。

【技术特征摘要】
1.用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的单核苷酸多态性标记位点，其特征在于，所述的单核苷酸多态性标记位点是桃基因组第5染色体的第12,622,852位核苷酸，该核苷酸为A或T。2.用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的PCR扩增引物对，其特征在于，所述引物对中的上游引物是根据桃基因组第5染色体的第12,622,852位核苷酸及其上游序列进行设计，所述引物对中的下游引物是根据桃基因组第5染色体的第12,622,852位核苷酸的下游序列进行设计。3.根据权利要求2所述的用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的PCR扩增引物对，其特征在于，所述的上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示。4.用于鉴定桃果实苦仁/甜仁性状的试剂盒，其特征在于，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：曹珂，王力荣，朱更瑞，方伟超，陈昌文，王新卫，
申请(专利权)人：中国农业科学院郑州果树研究所，
类型：发明
国别省市：河南,41