序列比对的状态监控装置及方法制造方法及图纸

本发明专利技术提供了一种序列比对的状态监控装置及方法，其中，在该序列比对的状态监控装置中包括：序列比对模块，用于逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；与序列比对模块连接的比对结果输出模块，用于根据序列比对模块的比对，针对比对序列中的每个碱基输出一个比对结果；与比对结果输出模块连接的响应模块，用于根据比对结果输出模块输出的比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。其将视觉的比对结果转换为听觉，以此相关人员能够直接利用听觉的功能，根据判断听到的不同预设声音的情况来直接获得序列比对结果的好坏，不仅可以免去解读繁琐的序列结果文件，而且可以随时监测序列比对的比对状态，简单易懂，方便快捷。

State monitoring device and method for sequence alignment

The invention provides a monitoring device and method, a sequence which is included in the device for monitoring the state of the sequence alignment, sequence alignment module, for each of the comparison and reference base sequence alignment in the sequence alignment; sequence alignment module is connected with the output of the module, according to the sequence comparison module. A comparison of the results of each needle in the nucleotide sequence alignment result and output; output response module connection, according to the comparison results for the output of the output module to monitor the default sound playback, sequence alignment state. The visual comparison results into the hearing, to relevant personnel can directly use auditory function, hearing the sound judgment according to different presuppositions of direct sequence alignment result not only can avoid tedious interpretation of sequence results file, but also can be used to monitor the alignment, sequence alignment is simple and convenient.

【技术实现步骤摘要】
序列比对的状态监控装置及方法
本专利技术涉及生物信息
，尤其涉及一种序列比对的状态监控装置及方法。
技术介绍
序列比对是生物信息学的基本组成和重要基础，其基本思想是，基于生物学中序列决定结构、结构决定功能的普遍规律，将核酸序列和蛋白质一级结构上的序列都看成由基本字符组成的字符串，检测序列之间的相似性，找出序列之间共同的区域，同时辨别序列之间的差异。目前实现序列比对的软件虽然很多，但是对于结果的处理都有些许欠缺，缺乏易读性，相关人员往往都需要研究很久才能看懂结果文件，大大浪费了时间。
技术实现思路
针对上述问题，本专利技术提供了一种序列比对的状态监控装置及方法，有效解决现有技术中序列比对结果缺乏易读性等技术问题。本专利技术提供的技术方案如下：一种序列比对的状态监控装置，包括：序列比对模块，用于逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；与所述序列比对模块连接的比对结果输出模块，用于根据所述序列比对模块的比对，针对比对序列中的每个碱基输出一个比对结果；与所述比对结果输出模块连接的响应模块，用于根据所述比对结果输出模块输出的比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。进一步优选地，在所述状态监控装置中还包括分别与序列比对模块和比对结果输出模块连接的打分模块，所述打分模块根据所述序列比对模块的比对进行打分；所述比对结果输出模块根据所述打分模块的打分输出不同的比对结果。进一步优选地，在所述打分模块中，当序列比对模块比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基相同，打出第一预设分数；当序列比对模块比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基不同，打出第二预设分数。进一步优选地，在所述比对结果输出模块中，当打分模块打出第一预设分数，输出第一预设二进制数；当打分模块打出第二预设分数，输出第二预设二进制数；在所述响应模块中，当比对结果输出模块输出第一预设分数，响应第一预设声音；当比对结果输出模块输出第二预设分数，响应第二预设声音。进一步优选地，所述状态监控模块中还包括与所述响应模块连接的比对结果判断模块，所述比对结果判断模块在比对序列比对结束后根据不同预设声音的播放时间判断整个比对序列的比对状态。本专利技术还提供了一种序列比对的状态监控方法，包括：逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；输出比对序列中的每个碱基的比对结果；根据比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。进一步优选地，在步骤逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对之后，还包括：根据比对序列中各碱基的比对进行打分；在步骤输出比对序列中的每个碱基的比对结果中，具体为：根据打分输出不同的比对结果。进一步优选地，在步骤根据比对序列中各碱基的比对进行打分中，包括：当比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基相同，打出第一预设分数；当比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基不同，打出第二预设分数。进一步优选地，在步骤根据打分输出不同的比对结果中，包括：当打出第一预设分数，输出第一预设二进制数；当打出第二预设分数，输出第二预设二进制数；在步骤根据比对结果播放预设声音中，包括：当输出第一预设分数，响应第一预设声音；当输出第二预设分数，响应第二预设声音。进一步优选地，在步骤根据比对结果播放预设声音之后，还包括：在比对序列比对结束后根据不同预设声音的播放时间判断整个比对序列的比对状态。在本专利技术提供的序列比对的状态监控装置及方法中，针对现有技术中序列比对结果文件的难以解读及人眼无法实时观察到比对状态的技术问题，将视觉的比对结果转换为听觉，以此相关人员能够直接利用听觉的功能，根据判断听到的不同预设声音的情况来直接获得序列比对结果的好坏，不仅可以免去解读繁琐的序列结果文件，而且可以随时监测序列比对的比对状态，简单易懂，方便快捷。附图说明下面将以明确易懂的方式，结合附图说明优选实施方式，对上述特性、技术特征、优点及其实现方式予以进一步说明。图1为本专利技术中序列比对的状态监控装置一种实施方式示意图；图2为本专利技术中序列比对的状态监控装置另一种实施方式示意图；图3为本专利技术中序列比对的状态监控装置另一种实施方式示意图；图4为本专利技术中序列比对的状态监控装置一种实施方式流程示意图。附图标记：100-序列比对的状态监控装置，110-序列比对模块，120-比对结果输出模块，130-响应模块，140-打分模块，150-比对结果判断模块。具体实施方式为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对照附图说明本专利技术的具体实施方式。显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图，并获得其他的实施方式。如图1所示为本专利技术提供的序列比对的状态监控装置一种实施方式示意图，从图中可以看出，在该状态监控装置100中包括：序列比对模块110、比对结果输出模块120及响应模块130，其中，比对结果输出模块120分别与序列比对模块和响应模块130连接。在工作过程中，首先，序列比对模块110逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；之后，比对结果输出模块120根据序列比对模块110的比对，针对比对序列中的每个碱基输出一个比对结果；最后，响应模块130根据比对结果输出模块120输出的比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。在本实施方式中，由比对序列由多个碱基组成，以此在比对的过程中，序列比对模块110逐一将比对序列中的碱基与参考序列中的碱基进行比对，且每比对一个，通过比对结果输出模块120输出比对结果，并通过响应模块130根据比对结果响应预设声音，以此循环，直到比对序列中所有的碱基比对结束。要说明的是，我们对上述预设声音不做具体限定，如在一实例中，当比对序列中某一个碱基与参考序列相应位置的碱基比对成功，播放柔和的音乐；当比对序列中某一个碱基与参考序列相应位置的碱基比对不成功，播放刺耳的音乐，这样相关人员就能够根据听到的音乐判断比对序列中每个碱基的比对结果，通俗易懂。在其他实例中，还可以将预设声音设定为其他类型的声音，如不同的铃声等，只要相关人员能够根据该预设声音辨别出不同的比对结果即可。对上述实施方式进行改进得到本实施方式，如图2所示，在本实施方式中，状态监控装置100中除了包括序列比对模块110、比对结果输出模块120及响应模块130之外，还包括分别与序列比对模块110和比对结果输出模块120连接的打分模块140。在工作过程中，首先，序列比对模块110逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；之后，打分模块140根据序列比对模块110的比对进行打分；接着，比对结果输出模块120根据打分模块140的打分输出不同的比对结果；最后，响应模块130根据比对结果输出模块120输出的比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。在本实施方式中，当序列比对模块110比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基相同，打分模块140打出第一预设分数，相对应的，比对结果输出模块120输出第一预设二进制数，响应模块130响应第一预设声音；当序列比对模块110比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基不同，打分模块140打出第二预设分数，相对应的，比对结果输出模块120输出第二预设二进制数，响应模块130响应第二本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种序列比对的状态监控装置，其特征在于，所述状态监控装置中包括：序列比对模块，用于逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；与所述序列比对模块连接的比对结果输出模块，用于根据所述序列比对模块的比对，针对比对序列中的每个碱基输出一个比对结果；与所述比对结果输出模块连接的响应模块，用于根据所述比对结果输出模块输出的比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。

【技术特征摘要】
1.一种序列比对的状态监控装置，其特征在于，所述状态监控装置中包括：序列比对模块，用于逐个将比对序列中的碱基与参考序列比对；与所述序列比对模块连接的比对结果输出模块，用于根据所述序列比对模块的比对，针对比对序列中的每个碱基输出一个比对结果；与所述比对结果输出模块连接的响应模块，用于根据所述比对结果输出模块输出的比对结果播放预设声音，实现对序列比对状态的监控。2.如权利要求1所述的状态监控装置，其特征在于，在所述状态监控装置中还包括分别与序列比对模块和比对结果输出模块连接的打分模块，所述打分模块根据所述序列比对模块的比对进行打分；所述比对结果输出模块根据所述打分模块的打分输出不同的比对结果。3.如权利要求2所述的状态监控装置，其特征在于，在所述打分模块中，当序列比对模块比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基相同，打出第一预设分数；当序列比对模块比对出比对序列中的一碱基与参考序列相应位置的碱基不同，打出第二预设分数。4.如权利要求3所述的状态监控装置，其特征在于，在所述比对结果输出模块中，当打分模块打出第一预设分数，输出第一预设二进制数；当打分模块打出第二预设分数，输出第二预设二进制数；在所述响应模块中，当比对结果输出模块输出第一预设分数，响应第一预设声音；当比对结果输出模块输出第二预设分数，响应第二预设声音。5.如权利要求1-4任意一项所述的状态监控装置，其特征在于，所述状态监控模块中还包括与所述响应模块连接的比...

【专利技术属性】
技术研发人员：常珊，陆旭峰，
申请(专利权)人：江苏理工学院，
类型：发明
国别省市：江苏,32