海绵共附生微生物群落总DNA的快速提取方法技术

技术编号:1755761 阅读:327 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
一种海绵共附生微生物群落总DNA的快速提取方法,先将海绵样品切成小块,悬浮于TE缓冲液中放置冰上直接研磨,完成海绵组织的裂解,然后在得到的TE悬浮海绵裂解物中,加入溶菌酶、十二烷基磺酸纳及蛋白酶K处理,离心后加入Tris-饱和酚抽提,然后依次采用Tris-饱和酚、氯仿、异戊醇溶液及氯仿、异戊醇溶液提取,再依次加入NaCl及异丙醇得到DNA沉淀,洗涤后溶解于TE缓冲液,采用RNA酶消解RNA,最后琼脂糖凝胶电泳分析检测提取的DNA样品。本发明专利技术可在一般实验室快速、方便地得到大片段的海绵共附生微生物的群落总DNA样品,可满足基于核酸的海绵共附生微生物种群结构与多样性分析的需要。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种海绵共附生微生物群落总DNA的快速提取方法,其特征在于包括如下步骤:1)直接机械研磨裂解海绵组织:将海绵样品在无菌条件下切成小块,加入由三羟甲基氨基甲烷和乙二胺四乙酸钠配制的pH值为8.0-8.2的TE缓冲液,于冰块上直接研磨5 -30分钟使海绵组织块破碎裂解变成均匀的悬浮液;2)细胞破壁与DNA释放:取海绵组织悬浮液,离心弃上清后,加入TE缓冲液悬浮沉淀,振荡混匀后离心弃上清,再加TE缓冲液悬浮沉淀,并加入溶菌酶混匀后于35-40℃水浴处理,再加十二烷基硫 酸钠及蛋白酶K混匀后45-50℃水浴处理,离心取上清,加入等体积的Tris-饱和酚充分混匀处理,离心后取...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李志勇何丽明
申请(专利权)人:上海交通大学
类型:发明
国别省市:31[中国|上海]

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