从头检测核酸中的序列的方法:通过片段化进行的导向测序技术

技术编号:1754116 阅读:218 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术提供了测定模板核酸的核酸序列的方法,该方法无需预知模板核酸中存在的核酸序列。该方法基于关于片段质量、任意一种核苷酸及其组合的质量、核苷酸切割物(酶或化学切割物)的序列特异性的组合信息确定核酸片段的序列。该方法允许从头检测靶核酸内的序列,而无需预知任何序列信息。该方法被称为通过片段化进行的部分测序(PSBF),即通过将靶序列片段化为质量或长度与已知序列独特相关的寡或多核苷酸而实现目的。这些序列的身份仅通过所用的特异性片段化方法测定,并总是不依赖于靶序列。PSBF可通过应用电泳、质谱或其它可被用于区分被切核酸序列片段大小的任意方法实现。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

【技术保护点】
一种确定模板核酸的靶序列的方法,包括下列步骤:    a)利用聚合酶和根据序列特异反应性和分子量选择的核苷酸以及寡核苷酸引物生成分离的模板核酸的转录物;    b)采用选自酶切割物、化学切割物及二者的组合的切割物进行裂解反应,以序列特异性方式将转录物完全裂解为片段;    c)分析裂解反应产物,以确定片段的分子量;    d)利用核苷酸质量和切割物的裂解特异性完成片段身份作图,以计算步骤b)裂解反应所生成的所有可能片段的分子量和序列;并    e)对步骤c)所观察到的质量与步骤d)的片段身份作图进行比较,其中该比较可实现对样品中存在的所有靶序列的确定。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:CR坎托尔FA西迪奇
申请(专利权)人:波士顿大学信托人
类型:发明
国别省市:US[美国]

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