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H5亚型禽流感病毒核酸检测方法及其试剂盒技术

技术编号:1753786 阅读:425 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
H5亚型禽流感病毒核酸检测方法及其试剂盒,涉及一种病毒。提供一种操作简便、实验可靠性高、可进行实时检测、灵敏度高、特异性好、周期短的H5亚型禽流感病毒核酸检测方法和试剂盒。步骤:1)寻求H5亚型禽流感病毒特有的保守序列作为待测靶基因;2)设计合成一对特异性引物,引物长度为18-30bp;3)根据保守序列设计合成一对Y型双链特异性荧光探针;4)使用步骤2中的一对特异性引物和步骤3中的Y型双链特异性荧光探针及PCR成份组成20μL荧光PCR反应体系的检测溶液,将荧光PCR反应体系的检测溶液装入PCR反应管;5)设置阳性对照模板和阴性对照模板,进行实时荧光PCR反应,获得检测结果。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
H5亚型禽流感病毒核酸检测方法,其特征在于包括以下步骤:    1)寻求H5亚型禽流感病毒特有的保守序列作为待测靶基因,保守序列为:    catt  ccacaacata  caccctctca  ccatcgggga  gtgccccaaa  tatgtgaaat  caaacagatt    agtccttgcg  actggactca  gaaatacccc  tcaaagagag  agaagaagaa  aaaagagagg  actatttgga    gctatagcag  gttttataga  gggaggatgg  cagggaatgg  tagatggttg;    2)设计合成一对H5亚型禽流感病毒特异性引物,引物长度在18~30bp之间,一对H5亚型禽流感病毒特异引物序列为:    上游引物:5′-CAT  TCC  ACA  ACA  TAC  ACC  C-3’  19bp  Tm=50.7℃,    下游引物:5′-CAA  CCA  TCT  ACC  ATT  CCC  T-3’  19bp  Tm=51.7℃;    3)根据保守序列设计合成一对Y型双链特异性荧光探针,具体要求如下:    a.Y型双链特异性荧光探针的长度为18~30bp,退火温度为50~70℃;    b.标记荧光剂的链与保守序列完全匹配,另一条链标记淬灭剂;    c.两条链的3’端为了防止引发扩增反应需要封闭;    d.两条链的一个末端存在碱基完全不匹配,不匹配的碱基长度为2~10bp;    4)使用步骤2中的一对特异性引物和步骤3中的Y型双链特异性荧光探针及PCR成份组成20μL荧光PCR反应体系的检测溶液,将荧光PCR反应体系的检测溶液装入PCR反应管,每一PCR反应管中的成份包括1.5~4.0mM  MgCl↓[2],0.1~3mM  dNTPs,1~3U  Taq酶,0.2~0.5U反转录酶,上下游引物各为0.2~0.6μM,2μl10×PCR缓冲液,荧光剂标记探针0.05~0.3μM,粹灭剂标记探针0.06~0.36μM;    5)设置阳性对照模板和阴性对照模板,进行实时荧光PCR反应,获得检测结果,阳性对照模板为包含保守序列的MS2噬菌体,阴性对照模板为灭菌后的无离子水,实时荧光PCR反应的条件为42℃反转录15~30min,94℃预变性3~8min后进入循环,循环程序为94℃变性...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:陈亮于广福邵寒娟张国广窦敏曾雅明
申请(专利权)人:厦门大学
类型:发明
国别省市:92[中国|厦门]

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