一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法技术

本发明专利技术公开了一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法：显微切割肿瘤组织标本；纯化提取ＲＮＡ，体外转录、线性扩增合成ａＲＮＡ；逆转录、二轮体外扩增制备生物素标记ｃＲＮＡ探针；探针与人类全基因组表达谱芯片杂交，信号扫描，输出数据，构建肿瘤纯化组织的基因表达谱；运用权重赋值算法，使用逐个剔除交叉验证对数据归一化处理，分析筛选与肿瘤相关的分子标记物。本发明专利技术结合使用高通量基因芯片、结合显微切割、线性扩增技术，构建不同病理类型、不同临床分期的肿瘤组织中肿瘤基因表达谱，为筛选不同用途的肿瘤分子标记物和潜在的肿瘤药物作用靶点提供了新的方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属肿瘤分子遗传学领域，尤其涉及肿瘤遗传分子标记物的筛选。技术背景人体局部组织发生癌变后，在其组织形态学逐步改变的过程中，癌变细 胞中会有不同的基因(或基因群)及其表达产物随之产生变化，如果能检测 到这些分子构成方面的变化，筛选出与肿瘤遗传相关的分子标记物，则无疑 能对肿瘤的早期诊断、预后判断、疗效监测提供巨大帮助。在不同的肿瘤组织中筛选出一些起关键作用的基因或基因群，筛选出用 于肿瘤早期诊断、分子分类、疗效检测、预后判断等方面的分子标记物，正 是当前肿瘤遗传学上积极探索的问题。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供。本专利技术通过以下详细技术方案实现(1)对肿瘤组织标本和非肿瘤组织 标本进行显微切割；(2)纯化组织标本，提取纯化组织标本中的RNA; (3) 体外转录、线性扩增合成aRNA， aRNA再经逆转录、二轮体外线性扩增制备 生物素标记cRNA探针；(4)探针经片段化后与人类全基因组表达谱芯片杂 交，信号扫描，输出数据，构建肿瘤纯化组织的基因表达谱；(5)运用weighted voting算法，使用leave-one-out cross-validation对数据本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法，其特征在于包含以下步骤：（１）对肿瘤组织标本和非肿瘤组织标本进行显微切割；（２）纯化组织标本，提取纯化组织标本中的ＲＮＡ；（３）体外转录、线性扩增合成ａＲＮＡ，ａＲＮＡ再经逆转录、二轮体外线性扩增制备生物素标记ｃＲＮＡ探针；（４）探针经片段化后与人类全基因组表达谱芯片杂交，信号扫描，输出数据，构建肿瘤纯化组织的基因表达谱；（５）运用权重赋值算法，逐个剔除交叉验证，对数据归一化处理，筛选与肿瘤发生、发展过程相关的分子标记物。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：李桂源，张文玲，曾朝阳，熊炜，周艳宏，李小玲，罗晓敏，范松青，
申请(专利权)人：中南大学，
类型：发明
国别省市：43[]