一种从海洋沉积物中同时提取微生物宏基因组DNA和总RNA的方法技术

技术编号:1742315 阅读:305 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术提供一种从海洋沉积物中同时提取微生物宏基因组DNA和总RNA的方法,包括将海洋沉积物用变性溶液处理,加入沙子振荡,加入蛋白酶和溶菌酶进行裂解,再加入SDS和PVPP溶液进行进一步裂解,加入萃取剂进行处理,萃取液用异丙醇沉淀,最后用核酸吸附树脂进行纯化。该方法特别适用于从海洋沉积物中同时提取微生物宏基因组DNA和总RNA,同时也可应用于陆地土壤样品,陆地湖泊沉积物样品中微生物宏基因组DNA和总RNA的共提取。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种能从海洋沉积物中同时提取出微生物宏基因组DNA和总RNA的方法。
技术介绍
海洋,尤其是深海极端环境中微生物资源的研究开发中存在的一个关键问题就是样品中可以人工培养的微生物种类较少,直接影响了资源研究开发的范围。以核酸物质为基础的分子生物学技术的应用克服了培养技术的限制,为研究开发海洋,尤其是深海极端环境提供了强有力的手段。但是海洋,尤其是深海环境样品中的微生物含量很少,现有技术中的DNA提取方法在操作过程中由于黏土对核酸物质的吸附,抽提过程中的降解与损失,酶类、抑制剂等杂质的共提取及纯化效率的高低都影响着所得到的核酸物质的质量,从而限制了研究开发的进行,因此有必要建立一种方法用于高效地提取海洋环境中,尤其是深海沉积物中微生物中的核酸物质。许多实验方法已经描述了如何从土壤或湖泊沉积物中提取微生物宏基因组DNA(Wilson et al,1997;Leff et al.1995;Miller et al,1999),也有商业用途的试剂盒,例如美国MBIO公司的UltracleanTM试剂盒,但这些方法都是针对生物量多或样品量多的样品,获得的DNA在大小,纯度方面有本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种从海洋沉积物中同时提取微生物宏基因组DNA和总RNA的方法,其特征在于:该方法包括如下步骤:(1)用变性溶液和沙子处理沉积物样品;(2)向上述步骤(1)处理后的样品中加入核酸提取缓冲液和酶进行裂解;(3)向上述步 骤(2)的样品中加入SDS和PVPP溶液进行处理并离心得到上清液;(4)重复上述步骤(2),(3)两次,收集三次离心得到的上清液;(5)向上述步骤(4)中的上清液中加入萃取剂进行处理并离心得到上层水相溶液;(6)向上 述步骤(5)中的水相溶液中加入异丙醇沉淀并离心去除上清液,所得沉淀用水重...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:曾润颖赵晶
申请(专利权)人:国家海洋局第三海洋研究所
类型:发明
国别省市:92[中国|厦门]

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